Generic accelerated sequence alignment in SeqAn using vectorization and multi-threading.

Rahn, René; Budach, Stefan; Costanza, Pascal; Ehrhardt, Marcel; Hancox, Jonny; Reinert, Knut

Rahn, René; Budach, Stefan; Costanza, Pascal; Ehrhardt, Marcel; Hancox, Jonny; Reinert, Knut.

Afiliación

Rahn R; Department of Mathematics and Computer Science, Freie Universität Berlin, Berlin, Germany.
Budach S; Otto-Warburg-Laboratory, RNA Bioinformatics, Max Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin, Germany.
Costanza P; ExaScience Lab, IMEC, Leuven, Belgium.
Ehrhardt M; Department of Mathematics and Computer Science, Freie Universität Berlin, Berlin, Germany.
Hancox J; Health & Life Sciences, Intel Corporation, London, UK.
Reinert K; Department of Mathematics and Computer Science, Freie Universität Berlin, Berlin, Germany.

Bioinformatics ; 34(20): 3437-3445, 2018 10 15.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-29726911

Asunto(s)

Alineación de Secuencia; Programas Informáticos; Algoritmos

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Alineación de Secuencia Idioma: En Revista: Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Alemania

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