Correcting the Mean-Variance Dependency for Differential Variability Testing Using Single-Cell RNA Sequencing Data.

Eling, Nils; Richard, Arianne C; Richardson, Sylvia; Marioni, John C; Vallejos, Catalina A

Eling, Nils; Richard, Arianne C; Richardson, Sylvia; Marioni, John C; Vallejos, Catalina A.

Afiliación

Eling N; European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Wellcome Genome Campus, Hinxton, Cambridge CB10 1SD, UK; Cancer Research UK Cambridge Institute, University of Cambridge, Li Ka Shing Centre, Cambridge CB2 0RE, UK.
Richard AC; Cancer Research UK Cambridge Institute, University of Cambridge, Li Ka Shing Centre, Cambridge CB2 0RE, UK; Cambridge Institute for Medical Research, University of Cambridge, Cambridge Biomedical Campus, Hills Road, Cambridge CB2 0XY, UK.
Richardson S; MRC Biostatistics Unit, University of Cambridge, Cambridge Institute of Public Health, Forvie Site, Robinson Way, Cambridge Biomedical Campus, Cambridge CB2 0SR, UK.
Marioni JC; European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Wellcome Genome Campus, Hinxton, Cambridge CB10 1SD, UK; Cancer Research UK Cambridge Institute, University of Cambridge, Li Ka Shing Centre, Cambridge CB2 0RE, UK. Electronic address: marioni@ebi.ac.uk.
Vallejos CA; The Alan Turing Institute, British Library, 96 Euston Road, London NW1 2DB, UK; Department of Statistical Science, University College London, 1-19 Torrington Place, London WC1E 7HB, UK; MRC Human Genetics Unit, MRC Institute of Genetics and Molecular Medicine, University of Edinburgh, Western Genera

Cell Syst ; 7(3): 284-294.e12, 2018 09 26.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30172840

Asunto(s)

Variación Biológica Poblacional; Linfocitos T CD4-Positivos/fisiología; Modelos Teóricos; Análisis de Secuencia de ARN/métodos; Análisis de la Célula Individual; Animales; Diferenciación Celular/genética; Linaje de la Célula/genética; Simulación por Computador; Regulación de la Expresión Génica; Inmunidad/genética; Activación de Linfocitos/genética; Ratones; Ratones Endogámicos C57BL; Transcriptoma

Palabras clave

Bayesian; immune activation; single-cell RNA sequencing; statistics; transcriptional noise; variability

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Linfocitos T CD4-Positivos / Análisis de Secuencia de ARN / Análisis de la Célula Individual / Variación Biológica Poblacional / Modelos Teóricos Límite: Animals Idioma: En Revista: Cell Syst Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Reino Unido

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