Refining evERdock: Improved selection of good protein-protein complex models achieved by MD optimization and use of multiple conformations.

Shinobu, Ai; Takemura, Kazuhiro; Matubayasi, Nobuyuki; Kitao, Akio

Shinobu, Ai; Takemura, Kazuhiro; Matubayasi, Nobuyuki; Kitao, Akio.

Afiliación

Shinobu A; School of Life Science and Technology, Tokyo Institute of Technology, 2-12-1 Ookayama, Meguro, Tokyo 152-8550, Japan.
Takemura K; School of Life Science and Technology, Tokyo Institute of Technology, 2-12-1 Ookayama, Meguro, Tokyo 152-8550, Japan.
Matubayasi N; Division of Chemical Engineering, Graduate School of Engineering Science, Osaka University, Toyonaka, Osaka 560-8531, Japan.
Kitao A; School of Life Science and Technology, Tokyo Institute of Technology, 2-12-1 Ookayama, Meguro, Tokyo 152-8550, Japan.

J Chem Phys ; 149(19): 195101, 2018 Nov 21.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30466278

Asunto(s)

Proteínas Bacterianas/química; Complejos Multiproteicos/química; Proteínas de Plantas/química; Ribonucleasas/química; Tripsina/química; Animales; Bovinos; Cucurbita/química; Enlace de Hidrógeno; Simulación del Acoplamiento Molecular; Simulación de Dinámica Molecular; Conformación Proteica; Termodinámica; Agua/química

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Proteínas de Plantas / Ribonucleasas / Proteínas Bacterianas / Tripsina / Complejos Multiproteicos Tipo de estudio: Prognostic_studies Límite: Animals Idioma: En Revista: J Chem Phys Año: 2018 Tipo del documento: Article País de afiliación: Japón

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