STRAIN: an R package for multi-locus sequence typing from whole genome sequencing data.

Dalsass, Mattia; Bodini, Margherita; Lambert, Christophe; Mortier, Marie-Cécile; Romanelli, Marco; Medini, Duccio; Muzzi, Alessandro; Brozzi, Alessandro

Dalsass, Mattia; Bodini, Margherita; Lambert, Christophe; Mortier, Marie-Cécile; Romanelli, Marco; Medini, Duccio; Muzzi, Alessandro; Brozzi, Alessandro.

Afiliación

Dalsass M; GSK, Siena, Italy.
Bodini M; Present address: Department of Experimental Oncology, European Institute of Oncology, Milan, Italy.
Lambert C; GSK, Siena, Italy.
Mortier MC; GSK, Rixensart, Belgium.
Romanelli M; GSK, Rixensart, Belgium.
Medini D; GSK, Siena, Italy.
Muzzi A; Università degli studi di Siena, Siena, Italy.
Brozzi A; GSK, Siena, Italy.

BMC Bioinformatics ; 20(Suppl 9): 347, 2019 Nov 22.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-31757201

Asunto(s)

Genoma Bacteriano; Tipificación de Secuencias Multilocus/métodos; Programas Informáticos; Secuenciación Completa del Genoma/métodos; Alelos; Técnicas de Tipificación Bacteriana

Palabras clave

Multi locus sequence type (MLST); R package; Sequence type (ST); Whole genome sequencing (WGS)

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Genoma Bacteriano / Tipificación de Secuencias Multilocus / Secuenciación Completa del Genoma Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: Italia

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