A performant bridge between fixed-size and variable-size seeding.

Kutzner, Arne; Kim, Pok-Son; Schmidt, Markus

Kutzner, Arne; Kim, Pok-Son; Schmidt, Markus.

Afiliación

Kutzner A; Department of Information Systems, College of Engineering, Hanyang University, 222 Wangsimni-ro, Seongdong-gu, Seoul, 04763, Republic of Korea.
Kim PS; Department of Information Security, Cryptology, and Mathematics, Kookmin University, 77, Jeongneung-ro, Seongbuk-gu, Seoul, 02707, Republic of Korea.
Schmidt M; Department of Information Systems, College of Engineering, Hanyang University, 222 Wangsimni-ro, Seongdong-gu, Seoul, 04763, Republic of Korea. schmidtm@hanyang.ac.kr.

BMC Bioinformatics ; 21(1): 328, 2020 Jul 23.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-32703211

Asunto(s)

Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; Alineación de Secuencia/métodos; Algoritmos

Palabras clave

FMD-index; High-throughput sequence alignment; MEM; Minimizer; SMEM

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Alineación de Secuencia / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2020 Tipo del documento: Article

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