Zea mays RNA-seq estimated transcript abundances are strongly affected by read mapping bias.

Zhan, Shuhua; Griswold, Cortland; Lukens, Lewis

Zhan, Shuhua; Griswold, Cortland; Lukens, Lewis.

Afiliación

Zhan S; Department of Plant Agriculture, University of Guelph, Guelph, Ontario, Canada.
Griswold C; Department of Integrative Biology, University of Guelph, Guelph, Ontario, Canada.
Lukens L; Department of Plant Agriculture, University of Guelph, Guelph, Ontario, Canada. llukens@uoguelph.ca.

BMC Genomics ; 22(1): 285, 2021 Apr 20.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33874908

Asunto(s)

Perfilación de la Expresión Génica; Zea mays; RNA-Seq; Análisis de Secuencia de ARN; Transcriptoma; Zea mays/genética

Palabras clave

Gene coexpression analysis; Genetic diversity; Maize; Mapping bias; RNA-Seq; Sequence divergence; Transcriptome variation; eQTL analysis

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Zea mays / Perfilación de la Expresión Génica Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Genomics Asunto de la revista: GENETICA Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Canadá

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