Improved transcriptome assembly using a hybrid of long and short reads with StringTie.

Shumate, Alaina; Wong, Brandon; Pertea, Geo; Pertea, Mihaela

Shumate, Alaina; Wong, Brandon; Pertea, Geo; Pertea, Mihaela.

Afiliación

Shumate A; Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins University, Baltimore, Maryland, United States of America.
Wong B; Center for Computational Biology, Johns Hopkins University, Baltimore, Maryland, United States of America.
Pertea G; Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins University, Baltimore, Maryland, United States of America.
Pertea M; Center for Computational Biology, Johns Hopkins University, Baltimore, Maryland, United States of America.

PLoS Comput Biol ; 18(6): e1009730, 2022 06.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-35648784

Asunto(s)

Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Transcriptoma; Algoritmos; Animales; Exones; Humanos; Ratones; Análisis de Secuencia de ADN; Análisis de Secuencia de ARN; Programas Informáticos; Transcriptoma/genética

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento / Transcriptoma Límite: Animals / Humans Idioma: En Revista: PLoS Comput Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Año: 2022 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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