ABSTRACT
During the third year of the pandemic in Peru, the persistent transmission of SARS-CoV-2 led to the appearance of more transmissible and immune-evasive Omicron sublineages; in that context, the National Genomic Surveillance of SARS-CoV-2 performed by the Peruvian National Institute of Health detected spike mutations in the circulating Omicron BA.5.1.25 sublineage which was later designated as DJ.1 and increased during the fourth COVID-19 wave, this eventually branched into new sublineages. The introduction, emergence, and timing of the most recent common ancestor (tMRCA) of BA.5.1.25 and its descendants (DJ.1, DJ.1.1, DJ.1.2, and DJ.1.3) were investigated in this paper as well as the time lags between their emergence and identification by the Peruvian National Institute of Health. Our findings show that ongoing genomic surveillance of SARS-CoV-2 is critical for understanding its phylogenetic evolution and the emergence of novel variations.
ABSTRACT
RESUMEN En el presente estudio se estimó el rendimiento diagnóstico de la prueba Xpert®Xpress SARS-CoV-2 en comparación con la RT PCR en tiempo real-protocolo Charité, para la detección de SARS-CoV-2 en pacientes peruanos. Se trató de un diseño de prueba diagnóstica que incluyó 100 muestras de hisopado nasal y faríngeo. Se obtuvo una concordancia global de 98,70% (IC95%: 92,98-99,97), con un coeficiente kappa de 0,97 (IC95%: 0,86-1.00); se estimó una sensibilidad y especificad relativa de 100% y 96,15%, respectivamente. Adicionalmente, el porcentaje del área bajo la curva ROC fue 98,08% en ambos casos y se obtuvo una especificidad analítica del 100% para los diferentes virus respiratorios evaluados. En conclusión, la prueba Xpert®Xpress SARS-CoV-2 a partir de muestras de hisopado nasal y faríngeo fue altamente sensible y específica, así mismo el coeficiente kappa mostró una excelente correlación, al compararla con la prueba de referencia.
ABSTRACT The present study assessed the diagnostic performance of the Xpert®Xpress SARS-CoV-2 test in comparison with the Charité protocol real-time RT PCR for the detection of SARS-CoV-2 in Peruvian patients. This was a diagnostic test study that included 100 nasal and pharyngeal swab samples. We obtained an overall concordance of 98.70% (95%CI: 92.98-99.97), with a kappa coefficient of 0.97 (95%CI: 0.86-1.00) and sensitivity and relative specificity rates of 100% and 96.15%, respectively. Additionally, the percentage of the area under the ROC curve was 98.08% in both cases, and an analytical specificity rate of 100% was obtained for the different respiratory viruses evaluated. In conclusion, the Xpert®Xpress SARS-CoV-2 test, by using nasal and pharyngeal swab samples, was highly sensitive and specific, and the kappa coefficient showed an excellent correlation when compared to the reference test.
Subject(s)
Humans , Male , Female , Molecular Diagnostic Techniques , Polymerase Chain Reaction , COVID-19ABSTRACT
Introducción. La vacunación contra el virus de la hepatitis B (VHB) en recién nacidos es crucial para la prevención de la transmisión perinatal. Objetivo. Determinar factores individuales e institucionales asociados a la vacunación contra el VHB en las 12 y 24 primeras horas de vida. Métodos. Se diseñó un estudio transversal y multicéntrico. Los datos sobre la vacunación fueron recogidos de los padres y de la revisión de reportes. Los datos de los variables individuales de los recién nacidos y madres fueron recogidos de las historias clínicas. Los datos institucionales fueron recogidos de registros de atención inmediata y directamente del personal de inmunizaciones. Resultados. Se incluyó 777 recién nacidos en 10 establecimientos. En el análisis multinivel resultó favorable a la vacunación en las primeras 12 horas, el mayor tiempo de atención en los servicios de inmunizaciones (RP: 1,0; IC95%: 0,99 - 1,01). Para la vacunación dentro de las 24 horas de vida fue favorable la mayor cantidad de personal de enfermería en los servicios de vacunación (RP: 1,02; IC95%: 1,01 - 1,03) y desfavorable la mayor cantidad de partos al día de los establecimientos (RP: 0,99; IC95%: 0,99 - 0,997). No se identificó factores individuales. Conclusión. Factores institucionales, como el tiempo de atención, la cantidad de personal de enfermería y la cantidad de partos, estuvieron asociados con la vacunación contra el VHB en recién nacidos. Se requiere estrategias de mejora como la introducción de la vacunación en la atención inmediata del neonato para la prevención de la transmisión perinatal del VHB.
Introduction. Vaccination against hepatitis B Virus (HBV) in newborns is crucial for the prevention of perinatal transmission. Objective. To determine the individual and institutional factors associated with vaccine for HBV in newborns in the first 12 hours and 24 hours of life. Methods. A cross-sectional, multicenter-design study was conducted in high level public and private hospitals in Lima Metropolitana and Callao. Information on vaccination was obtained through consultations with parents and review of health service reports. Individual variables of the newborns and their mothers were obtained from the medical records of the newborns. Institutional data were collected from immediate care records and from health personnel responsible for the immunization program. Results. The study was conducted in 10 health facilities, including 777 newborns. In the multilevel analysis, the longest care time in the vaccination service was favorable for vaccination within 12 hours of life (PR: 1,0; 95% CI: 0,9995-1,01); while for vaccination within 24 hours of life was favorable the greater number of nursing personnel (RP: 1,02; IC95%: 1,01-1,03) and unfavorable the greater number of deliveries per day in the institution (RP:0,99; IC95%: 0,99-0,997). No individual factors related to vaccination were identified. Conclusions. Institutional factors, such as length of care, number of nursing staff, and number of deliveries, were associated with newborn HBV vaccination. Improvement strategies are required, such as the introduction of vaccination in the immediate care of the newborn for the prevention of perinatal transmission of HBV.
ABSTRACT
Introducción: Las manos de los trabajadores de la salud son los más frecuentes medios portadores de los microorganismos responsables de infecciones asociadas a la atención en salud. El objetivo de nuestro estudio fue evaluar el nivel de conocimientos de lavado de manos de tres hospitales nacionales del seguro social de salud en Lima metropolitana, 2018. Material y Métodos: Durante abril-agosto 2018, entrevistamos a enfermeras y médicos de tres hospitales nacionales con un cuestionario administrado en tres secciones y evaluado en escala vigesimal: generalidades, razones de la higiene de manos durante atención en salud y situaciones para realizar la higiene de manos. Resultados: La mediana del nivel de conocimientos de enfermeras y médicos sobre higiene de manos fue de 13,41. El nivel de conocimientos es diferente entre enfermeras y médicos (13,3 vs. 13,6). Asimismo, se encontraron menor frecuencia de acierto en los ítems: desinfección de manos dura 20 a 30 segundos (54,1%, n=276), desinfección de manos tiene 8 pasos (52,9%, n=270), eliminar los microorganismos transitorios de la piel (47,1%, n=240), cuando existe un diagnóstico infeccioso (34,7%, n=177). Conclusión: El nivel de conocimientos de las enfermeras y médicos fue bajo y existe diferencia entre subgrupos profesionales. Se recomienda implementar entrenamientos continuos siguiendo las estrategias multimodulares de la OMS
Introduction: The hands of health care workers are the most common means of carrying the microorganisms responsible for healthcare-associated infections. The objective of our study was to evaluate the level of handwashing knowledge in three national social health insurance hospitals in metropolitan Lima, 2018. Material and Methods: During April-August 2018, we interviewed nurses and physicians from three national hospitals with a three-sections questionnaire to evaluate on a twenty-first scale the following domains: generalities, reasons for hand hygiene during health care, and situations to perform hand hygiene. Results: The median knowledge of nurses and physicians about hand hygiene was 13.41. The knowledge differs between nurses and physicians (13.3 vs. 13.6). Also, there was a lower frequency of success in the following items: hand disinfection lasts 20 to 30 seconds (54.1%, n=276), hand disinfection has 8 steps (52.9%, n=270), elimination of transitory skin microorganisms (47.1%, n=240), when there is an infectious diagnosis (34.7%, n=177). Conclusion:The knowledge of nurses and physicians was low and there is a difference between professional subgroups. It is recommended to implement continuous training following the WHO multimodular strategies
ABSTRACT
Introducción: La definición de prioridades de investigación en salud dirige los esfuerzos de investigación para promover ciencia, tecnología e innovación en salud. Material y Métodos: La definición de estas en el Seguro Social de Salud peruano para el periodo 2020-2022 se realizó en cuatro etapas y de forma sistemática, estructurada, participativa y secuencial. Resultados: Primero, se evaluó el avance de investigación en las prioridades del periodo 2017-2019. En la segunda etapa, se consultó diversas fuentes y se identificó necesidades de investigación orientadas a enfermedades y se estableció el marco para prioridades orientadas a sistemas de salud e intervenciones sanitarias. La tercera etapa consistió en una consulta ampliada para seleccionar los temas prioritarios orientados a enfermedades. Finalmente, se desarrolló un taller participativo y multidisciplinario para seleccionar temas, subtemas y áreas prioritarias de investigación. Conclusión: El producto final fue la definición de 11 temas prioritarios, siete para enfermedades y cuatro para sistemas de salud e intervenciones sanitarias.
Introduction: Health research priorities definition address research efforts to the promotion of health science, technology, and innovation. Material and Methods: Health research priorities in the Peruvian Social Security for the period 2020-2022 was carried out in four stages using a systematic, structured, participatory and sequential process. Results: First, the progress of the research in the priorities of the period 2017-2019 was evaluated. In the second stage, various sources were consulted to identify disease-oriented research needs and the framework for priorities oriented to health systems and health interventions. The third stage consisted of an expanded consultation to select priority disease-oriented topics. Finally, a participatory and multidisciplinary workshop was developed to select themes, subtopics, and priority areas for research. Conclusion: The final product was the definition of 11 priority themes, seven for diseases and four for health systems and health interventions
ABSTRACT
INTRODUCCIÓN: La cirugía bariátrica es considerada la herramienta más efectiva para el tratamiento de la obesidad severa. No está claro si los pacientes con resistencia a la insulina responden igual que otras personas. Nuestro objetivo es evaluar la asociación entre el índice HOMA-IR prequirúrgico con el porcentaje de sobrepeso perdido (%PSP) un año poscirugía bariátrica usando la técnica gastrectomía vertical (GV). MÉTODOS: Cohorte retrospectiva incluyendo pacientes ≥ 18 años con IMC ≥ 35 kg/m2 intervenidos por primera vez con GV entre 2014-2017 en la Clínica Avendaño, Perú. Se incluyó solo aquellos con diabetes mellitus tipo 2, hipertensión arterial o dislipidemia. Un %PSP al año ≥ 60% fue considerado satisfactorio. Se usó regresión Lineal y de Poisson con varianza robusta en forma cruda y ajustada para evaluar asociaciones con %PSP. RESULTADOS: La muestra de 91 pacientes tuvo una mediana de 34 años y un 57,1% fueron mujeres. Un 85,7% presentó resistencia a la insulina según HOMA-IR. Al año poscirugía el 76,9% tuvo un %PSP satisfactorio. En el modelo lineal ajustado por cada año de edad adicional hubo un 0,29% menos %PSP (p = 0,019), y por cada punto extra del HOMA-IR hubo 0,93% más %PSP (p = 0,004). La regresión de Poisson ajustada mostró un 2% menos de éxito por cada año de edad adicional (p = 0,050) y un 2% más de éxito por cada punto adicional de HOMA-IR (p = 0,038). CONCLUSIONES: Se encontró asociación entre mayor valor prequirúrgico de HOMA-IR con un mayor %PSP al año poscirugía. Es posible que la resistencia a insulina no afecte de forma adversa los resultados de la cirugía bariátrica GV
INTRODUCTION: Bariatric surgery is considered the most effective treatment for severe obesity. However, it is not clear if patients with diabetes mellitus or insulin resistance have the same response than patients without those conditions. Our objective was to evaluate association between pre-surgical HOMA-IR index and percentage of excess weight loss (EWL%) one year after bariatric surgery using sleeve gastrectomy. METHODS: Retrospective cohort including patients ≥ 18 years old with BMI ≥ 35 kg/m2, who underwent primary sleeve gastrectomy between 2014-2017 at the Avendaño Medical Center, Peru. Only patients with Type 2 Diabetes, Hypertension, or Dyslipidemia were included. EWL% ≥ 60% one year after surgery was considered satisfactory. Crude and adjusted Lineal and Poisson regression with robustness was used to assess statistical associations with EWL%. RESULTS: Ninety-one patients were included with a median of 34 years, and 57.1% were women. 85.7% had insulin resistance as per HOMA-IR. One year after surgery, 76.9% had a satisfactory EWL%. The lineal model showed .29% less EWL% per each extra year of life (P = .019), and .93% more EWL% per each extra HOMA-IR point (P = .004). The adjusted Poisson model showed 2% lower risk of having a satisfactory EWL% per each additional year of life (P = .050), and 2% more chance of success per each additional HOMA-IR point (P = .038). CONCLUSIONS: There was association between a higher pre-surgical HOMA-IR index and increased EWL% one year after surgery. It is possible that insulin resistance does not affect negatively sleeve gastrectomy outcomes