Combining camera trap surveys and IUCN range maps to improve knowledge of species distributions.

Reliable maps of species distributions are fundamental for biodiversity research and conservation. The International Union for Conservation of Nature (IUCN) range maps are widely recognized as authoritative representations of species' geographic limits, yet they might not always align with actual occurrence data. In recent area of habitat (AOH) maps, areas that are not habitat have been removed from IUCN ranges to reduce commission errors, but their concordance with actual species occurrence also remains untested. We tested concordance between occurrences recorded in camera trap surveys and predicted occurrences from the IUCN and AOH maps for 510 medium- to large-bodied mammalian species in 80 camera trap sampling areas. Across all areas, cameras detected only 39% of species expected to occur based on IUCN ranges and AOH maps; 85% of the IUCN only mismatches occurred within 200 km of range edges. Only 4% of species occurrences were detected by cameras outside IUCN ranges. The probability of mismatches between cameras and the IUCN range was significantly higher for smaller-bodied mammals and habitat specialists in the Neotropics and Indomalaya and in areas with shorter canopy forests. Our findings suggest that range and AOH maps rarely underrepresent areas where species occur, but they may more often overrepresent ranges by including areas where a species may be absent, particularly at range edges. We suggest that combining range maps with data from ground-based biodiversity sensors, such as camera traps, provides a richer knowledge base for conservation mapping and planning.

Combinación de censos con fototrampas y mapas de extensión de la UICN para incrementar el conocimiento sobre la distribución de las especies Resumen Los mapas confiables de la distribución de las especies son fundamentales para la investigación y conservación de la biodiversidad. Los mapas de distribución de la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN) están reconocidos como representaciones de autoridad de los límites geográficos de las especies, aunque no siempre se alinean con los datos actuales de su presencia. En los mapas recientes de área de hábitat (ADH), las áreas que no son hábitat han sido eliminadas de la distribución de la UICN para reducir los errores de comisión, pero su concordancia con la presencia actual de las especies tampoco ha sido analizada. Analizamos la concordancia entre la presencia registrada por los censos de fototrampas y pronosticamos la presencia a partir de los mapas de la UICN y de ADH de 510 especies de mamíferos de talla mediana a grande en 80 áreas de muestreo de fototrampas. Las cámaras detectaron sólo el 39% de las especies esperadas con base en la distribución de la UICN y los mapas de ADH en todas las áreas; el 85% de las disparidades con la UICN ocurrieron dentro de los 200 km a partir del borde de la distribución. Sólo el 4% de la presencia de las especies fue detectada por las cámaras ubicadas fuera de la distribución de la UICN. La probabilidad de disparidad entre las cámaras y la UICN fue significativamente mayor para los mamíferos de talla pequeña y para los especialistas de hábitat en las regiones Neotropical e Indomalaya y en áreas con doseles forestales más bajos. Nuestros hallazgos sugieren que los mapas de distribución y ADH pocas veces subrepresentan las áreas con presencia de las especies, pero con frecuencia pueden sobrerrepresentar la distribución al incluir áreas en donde las especies pueden estar ausentes, en particular los bordes de la distribución. Sugerimos que la combinación de los mapas de distribución con los sensores de biodiversidad en tierra, como las fototrampas, proporciona una base más rica de conocimiento para el mapeo y la planeación de la conservación.

Comparing wildlife habitat suitability models based on expert opinion with camera trap detections.

Expert knowledge is used in the development of wildlife habitat suitability models (HSMs) for management and conservation decisions. However, the consistency of such models has been questioned. Focusing on 1 method for elicitation, the analytic hierarchy process, we generated expert-based HSMs for 4 felid species: 2 forest specialists (ocelot [Leopardus pardalis] and margay [Leopardus wiedii]) and 2 habitat generalist species (Pampas cat [Leopardus colocola] and puma [Puma concolor]). Using these HSMs, species detections from camera-trap surveys, and generalized linear models, we assessed the effect of study species and expert attributes on the correspondence between expert models and camera-trap detections. We also examined whether aggregation of participant responses and iterative feedback improved model performance. We ran 160 HSMs and found that models for specialist species showed higher correspondence with camera-trap detections (AUC [area under the receiver operating characteristic curve] >0.7) than those for generalists (AUC < 0.7). Model correspondence increased as participant years of experience in the study area increased, but only for the understudied generalist species, Pampas cat (ß = 0.024 [SE 0.007]). No other participant attribute was associated with model correspondence. Feedback and revision of models improved model correspondence, and aggregating judgments across multiple participants improved correspondence only for specialist species. The average correspondence of aggregated judgments increased as group size increased but leveled off after 5 experts for all species. Our results suggest that correspondence between expert models and empirical surveys increases as habitat specialization increases. We encourage inclusion of participants knowledgeable of the study area and model validation for expert-based modeling of understudied and generalist species.

Comparación entre los modelos de idoneidad de hábitat basados en la opinión de expertos y la detecciones con cámaras trampa Resumen El conocimiento de expertos se usa en el desarrollo de modelos de idoneidad de hábitat (MIH) para la gestión y la toma de decisiones en conservación. Sin embargo, se ha cuestionado la coherencia de dichos modelos. Utilizamos un solo método, el proceso de jerarquización analítica, para generar MIH para cuatro felinos: dos especies especialistas de bosque (Leopardus pardalis y L. wiedii)) y dos generalistas de hábitat (Leopardus colocola y Puma concolor). Usamos estos MIH, la detección de las especies mediante censos de cámaras trampa y modelos lineales generalizados, para analizar el efecto de dichas especies y las características de los expertos sobre la correspondencia entre los modelos expertos y las detecciones con cámaras trampa. También analizamos si la agregación de las respuestas de los participantes y la retroalimentación iterativa mejoran el desempeño del modelo. Analizamos 160 MIH y encontramos que los modelos para las especies especialistas mostraron una correspondencia mayor con las detecciones de cámarastrampa (ABC [área bajo la curva de la característica operante receptora] >0.7) para las especies generalistas (ABC < 0.7). La correspondencia del modelo incrementó conforme incrementaron los años de experiencia de los participantes en el área de estudio, pero sólo para Leopardus colocola, una especie generalista y poco estudiada (ß = 0.024 [SE 0.007]). Ninguna otra característica de los participantes se asoció con la correspondencia del modelo. La retroalimentación y la revisión de los modelos aumentaron la correspondencia y la agregación de opiniones de múltiples participantes aumentó la correspondencia sólo para las especies especialistas. La correspondencia promedio de las opiniones agregadas incrementó conforme creció el tamaño grupal, aunque se niveló después de cinco expertos para todas las especies. Nuestros resultados sugieren que la correspondencia entre los modelos de expertos y las evaluaciones empíricos incrementan conforme aumenta la especialización del hábitat. Promovemos la inclusión de participantes conocedores del área de estudio y la validación del modelo para el modelado de expertos de especies generalistas y poco estudiadas.

Medium and large-sized mammals from Isla Santay National of Recreation Area in western Ecuador / Mamíferos medianos y grandes del Área Nacional de Recreación Isla Santay en el occidente de Ecuador

Abstract Isla Santay is an important Ecuadorian conservation area for native species, but with little information on mammals. Between August 2018 and January 2019, the richness and abundance of medium and large mammals was studied in two areas with different land use: undisturbed, and disturbed. We used a combination of camera trapping, direct observation, and indirect evidence (i.e. tracks, scat) for quantifying species richness. We recorded a total of six species, all observed in both zones, and three of them are currently included on the Red List of Mammals in Ecuador. In the undisturbed zone, Leopardus pardalis was the most frequently observed species and showed the highest activity; in the disturbed zone, L. pardalis and Procyon cancrivorus were the most active. Additionally, we reported the presence of Lontra longicaudis and Philander melanurus for the first time in this reserve. Several species that we expected to observe, such as Didelphis marsupialis, Nasua nasua, Eira barbara, Galictis vittata, and Herpailurus yaguarondi, were not recorded. Isla Santay presented low species richness, probably due to environmental pollution and geographic isolation. Nonetheless, Isla Santay is a critical area for the preservation of mammalian species from western Ecuador, especially for species at risk. Future research should prioritize both the preservation of ecological processes and the understanding of the negative effects of human impacts on local biodiversity.

Resumen Isla Santay es una importante área ecuatoriana de conservación para especies nativas, pero que posee poca información sobre mamíferos. Entre agosto de 2018 y enero 2019, la riqueza y abundancia de mamíferos medianos y grandes fue estudiada en dos zonas con diferente uso de suelo: no disturbada, y disturbada. La riqueza de especies fue cuantificada mediante una combinación de fototrampeo, observación directa y evidencias indirectas (rastros, heces, etc.). Registramos seis especies en ambas zonas, de las cuales tres están incluidas en la lista roja de mamíferos del Ecuador. En la zona no disturbada, Leopardus pardalis fue la especie más frecuente y mostró más actividad; mientras que esta misma especie junto con Procyon cancrivorus lo fueron en la zona intervenida; Lontra longicaudis y Philander melanurus fueron registradas por primera vez para la reserva. Especies esperadas como Didelphis marsupialis, Nasua nasua, Eira barbara, Galictis vittata, y Herpailurus yaguarondi estuvieron ausentes. Isla Santay presentó una baja riqueza de especies, probablemente debido a amenazas como la contaminación ambiental y aislamiento geográfico. A pesar de esto, Isla Santay ayuda en la protección de mamíferos en la región, especialmente para especies amenazadas. Futuras investigaciones deben priorizar la preservación de los procesos ecológicos y a entender el efecto negativo de los impactos antropogénicos en su biodiversidad.

Diversidad y distribución de los mamíferos del Perú I: Didelphimorphia, Paucituberculata, Sirenia, Cingulata, Pilosa, Primates, Lagomorpha, Eulipotyphla, Carnivora, Perissodactyla y Artiodactyla / Diversity and distribution of mammals from Peru I: Didelphimorphia, Paucituberculata, Sirenia, Cingulata, Pilosa, Primates, Lagomorpha, Eulipotyphla, Carnivora, Perissodactyla, and Artiodactyla

Resumen Este trabajo presenta una síntesis actualizada del conocimiento de la diversidad y distribución de 11 órdenes de mamíferos del Perú. La información de especies es presentada a nivel de país, ecorregión y por primera vez por departamento. Además, identificamos las especies endémicas para el país y damos los rangos de elevación por especie. Para ello se realizó una revisión exhaustiva tanto de la literatura como de ejemplares en colecciones científicas, además de consultas con especialistas. Aquí, reportamos 191 especies pertenecientes a los órdenes Didelphimorphia (46 spp.), Paucituberculata (2), Sirenia (1), Cingulata (5), Pilosa (8), Primates (42), Lagomorpha (2), Eulipotyphla (3), Carnivora (33), Perissodactyla (2) y Artiodactyla (47, incluyendo 32 cetáceos), de los cuales 22 especies son endémicas para el país. Debido a su alta diversidad y al alto número de cambios taxonómicos los órdenes Chiroptera y Rodentia serán tratados separadamente en futuros artículos. Los registros de especies presentadas en este trabajo, aunado a los reportes recientes de murciélagos (189 especies) y roedores (189 especies) totalizan a una diversidad de 569 especies de mamíferos para el Perú. Finalmente, proporcionamos notas taxonómicas de las especies que presentan cambios con respecto a la anterior lista de mamíferos peruanos. Esperamos que este primer listado de mamíferos por departamentos incentive estudios más detallados de la diversidad peruana a nivel regional.

Abstract This work summarizes recent knowledge regarding the diversity and distribution of 11 Orders of mammals from Peru. Species information is presented for the country, ecoregions and, for the first time, by individual departments. Furthermore, we identified endemic species for the country and provided elevation ranges per species. To compile our information, we conducted an exhaustive review of the scientific literature and specimens in scientific collections, consulting with specialists when needed to verify records. We report 191 species belonging to the orders Didelphimorphia (46 spp.), Paucituberculata (2), Sirenia (1), Cingulata (5), Pilosa (8), Primates (42), Lagomorpha (2), Eulipotyphla (3), Carnivora (33), Perissodactyla (2), and Artiodactyla (47, including 32 cetaceans); 22 of these are endemic to Peru. Due to their high diversity and number of taxonomic changes, the Orders Chiroptera and Rodentia will be treated separately in future articles. The species records presented here, together with previous reports of bats (189 spp.) and rodents (189 spp.) yield a current total 569 species of mammals for Peru. Finally, we provide taxonomic notes for species that exhibit differences with respect to the previously published list of Peruvian mammals. We hope that this first list of mammals by department encourages further studies of Peruvian mammalian diversity at the regional level.

Effects of body size on estimation of mammalian area requirements.

Accurately quantifying species' area requirements is a prerequisite for effective area-based conservation. This typically involves collecting tracking data on species of interest and then conducting home-range analyses. Problematically, autocorrelation in tracking data can result in space needs being severely underestimated. Based on the previous work, we hypothesized the magnitude of underestimation varies with body mass, a relationship that could have serious conservation implications. To evaluate this hypothesis for terrestrial mammals, we estimated home-range areas with global positioning system (GPS) locations from 757 individuals across 61 globally distributed mammalian species with body masses ranging from 0.4 to 4000 kg. We then applied block cross-validation to quantify bias in empirical home-range estimates. Area requirements of mammals <10 kg were underestimated by a mean approximately15%, and species weighing approximately100 kg were underestimated by approximately50% on average. Thus, we found area estimation was subject to autocorrelation-induced bias that was worse for large species. Combined with the fact that extinction risk increases as body mass increases, the allometric scaling of bias we observed suggests the most threatened species are also likely to be those with the least accurate home-range estimates. As a correction, we tested whether data thinning or autocorrelation-informed home-range estimation minimized the scaling effect of autocorrelation on area estimates. Data thinning required an approximately93% data loss to achieve statistical independence with 95% confidence and was, therefore, not a viable solution. In contrast, autocorrelation-informed home-range estimation resulted in consistently accurate estimates irrespective of mass. When relating body mass to home range size, we detected that correcting for autocorrelation resulted in a scaling exponent significantly >1, meaning the scaling of the relationship changed substantially at the upper end of the mass spectrum.

Efectos del Tamaño Corporal sobre la Estimación de los Requerimientos de Área de Mamíferos Resumen La cuantificación precisa de los requerimientos de área de una especie es un prerrequisito para que la conservación basada en áreas sea efectiva. Esto comúnmente implica la recolección de datos de rastreo de la especie de interés para después realizar análisis de la distribución local. De manera problemática, la autocorrelación en los datos de rastreo puede resultar en una subestimación grave de las necesidades de espacio. Con base en trabajos previos, formulamos una hipótesis en la que supusimos que la magnitud de la subestimación varía con la masa corporal, una relación que podría tener implicaciones serias para la conservación. Para probar esta hipótesis en mamíferos terrestres, estimamos las áreas de distribución local con las ubicaciones en GPS de 757 individuos de 61 especies de mamíferos distribuidas mundialmente con una masa corporal entre 0.4 y 4,000 kg. Después aplicamos una validación cruzada en bloque para cuantificar el sesgo en estimaciones empíricas de la distribución local. Los requerimientos de área de los mamíferos <10 kg fueron subestimados por una media ∼15% y las especies con una masa ∼100 kg fueron subestimadas en ∼50% en promedio. Por lo tanto, encontramos que la estimación del área estaba sujeta al sesgo inducido por la autocorrelación, el cual era peor para las especies de talla grande. En combinación con el hecho de que el riesgo de extinción incrementa conforme aumenta la masa corporal, el escalamiento alométrico del sesgo que observamos sugiere que la mayoría de las especies amenazadas también tienen la probabilidad de ser aquellas especies con las estimaciones de distribución local menos acertadas. Como corrección, probamos si la reducción de datos o la estimación de la distribución local informada por la autocorrelación minimizan el efecto de escalamiento que tiene la autocorrelación sobre las estimaciones de área. La reducción de datos requirió una pérdida de datos del ∼93% para lograr la independencia estadística con un 95% de confianza y por lo tanto no fue una solución viable. Al contrario, la estimación de la distribución local informada por la autocorrelación resultó en estimaciones constantemente precisas sin importar la masa corporal. Cuando relacionamos la masa corporal con el tamaño de la distribución local, detectamos que la corrección de la autocorrelación resultó en un exponente de escalamiento significativamente >1, lo que significa que el escalamiento de la relación cambió sustancialmente en el extremo superior del espectro de la masa corporal.

Neotropical carnivores: a data set on carnivore distribution in the Neotropics

Mammalian carnivores are considered a key group in maintaining ecological health and can indicate potential ecological integrity in landscapes where they occur. Carnivores also hold high conservation value and their habitat requirements can guide management and conservation plans. The order Carnivora has 84 species from 8 families in the Neotropical region: Canidae; Felidae; Mephitidae; Mustelidae; Otariidae; Phocidae; Procyonidae; and Ursidae. Herein, we include published and unpublished data on native terrestrial Neotropical carnivores (Canidae; Felidae; Mephitidae; Mustelidae; Procyonidae; and Ursidae). NEOTROPICAL CARNIVORES is a publicly available data set that includes 99,605 data entries from 35,511 unique georeferenced coordinates. Detection/non‐detection and quantitative data were obtained from 1818 to 2018 by researchers, governmental agencies, non‐governmental organizations, and private consultants. Data were collected using several methods including camera trapping, museum collections, roadkill, line transect, and opportunistic records. Literature (peerreviewed and grey literature) from Portuguese, Spanish and English were incorporated in this compilation. Most of the data set consists of detection data entries (n = 79,343; 79.7%) but also includes non‐detection data (n = 20,262; 20.3%). Of those, 43.3% also include count data (n = 43,151). The information available in NEOTROPICAL CARNIVORES will contribute to macroecological, ecological, and conservation questions in multiple spatio‐temporal perspectives. As carnivores play key roles in trophic interactions, a better understanding of their distribution and habitat requirements are essential to establish conservation management plans and safeguard the future ecological health of Neotropical ecosystems. Our data paper, combined with other largescale data sets, has great potential to clarify species distribution and related ecological processes within the Neotropics. There are no copyright restrictions and no restriction for using data from this data paper, as long as the data paper is cited as the source of the information used. We also request that users inform us of how they intend to use the data.

Population density and primate conservation in the Noroeste Biosphere Reserve, Tumbes, Peru / Densidad poblacional y conservación de los primates de la Reserva de Biosfera del Noroeste, Tumbes, Perú

The Noroeste Biosphere Reserve (NBR) is home to at least 22 species of medium and large mammals including the primates Alouatta palliata aequatorialis and Cebus albifrons aequatorialis. Previous estimates of A. p. aequatorialis population density vary from 2.3-8.6 ind/km² in 1983 to 17-19 ind/km² in 2005 and 2006, respectively. While for C. a. aequatorialis there are no estimates of population density in the NBR. In order to calculate the population density estimates for both species we installed six transects in 10.5 km² within the Cerros de Amotape National Park (belonging to the NBR) from August 2012 to March 2013. Based on 112.3 km of transects we obtained a population density of 8.3 ± 3.6 ind/km² for A. p. aequatorialis. However, for the reduced number of Cebus albifrons aequatorialis sightings we were only able to calculate a group size from three to 12 individuals and an encounter rate of 0.3 ind/km. Even though A. p. aequatorialis has potentially increased in population density, it is not feasible to make comparisons with previous estimates in the same area because of the different employed methodologies and the lack of randomness in the data collection. We recommend a long-term monitoring plan, including C. a. aequatorialis which makes it a conservation priority for the NBR, this monitoring plan should include mitigation of potential threats such as illegal hunting and trapping for the pet trade.

La Reserva de Biósfera del Noroeste (RBN) alberga por lo menos 22 especies de mamíferos medianos y grandes entre las cuales se encuentran los primates Alouatta palliata aequatorialis y Cebus albifrons aequatorialis. Los estimados previos de la densidad poblacional de A. p. aequatorialis varían de 2.3‒8.6 ind/km² en 1983 a 17‒19 ind/km² en 2005 y 2006, respectivamente. Mientras que para C. a. aequatorialis no existen estimados poblacionales para la RBN. Para calcular la densidad poblacional de estas dos especies instalamos seis transectos lineales en 10.5 km² dentro del Parque Nacional Cerros de Amotape (perteneciente a la RBN) de agosto del 2012 a marzo del 2013. En base a 112.3 km de transectos se obtuvo una densidad poblacional de 8.3 ± 3.6 ind/km² para A. p. aequatorialis; sin embargo, por el reducido número de avistamientos de Cebus albifrons aequatorialis solo se pudo calcular el tamaño de grupo que varió de tres a 12 individuos y la tasa de encuentro de 0.3 ind/km. A pesar que la población del A. p. aequatorialis aparentemente ha aumentado, no es factible hacer comparaciones con los estimados anteriores debido a las diferentes metodologías empleadas y a la falta de aleatoriedad en la toma de datos. Recomendamos un plan de monitoreo a largo plazo, que incluya a C. a. aequatorialis como objeto y prioridad de conservación para la RBN, el cual debería incluir la mitigación de posibles amenazas como caza y captura para comercio de mascotas.

New mammalian records in the Parque Nacional Cerros de Amotape, northwestern Peru

The Pacific Tropical Rainforest and Equatorial Dry Forest are found only in southern Ecuador and northern Peru, and are among the most poorly known ecosystems of South America. Even though these forests are protected in Parque Nacional Cerros de Amotape (PNCA), they are threatened by fragmentation because of farming and agriculture. The aim of this study was to determine the medium and large mammalian species richness, using transect census, camera trapping, and specimen bone collection. Nine transects were established and 21 camera trap stations were placed along 16 km² in three localities of PNCA, from August 2012 to April 2013. Total sampling effort was 215 km of transects and 4077 camera-days. We documented 22 species; including 17 with camera trapping, 11 with transect census, and 10 with specimen collection. Camera traps were the most effective method, and four species (Dasyprocta punctata, Cuniculus paca, Leopardus wiedii and Puma concolor) were documented only with this method. This comprised the first Peruvian record for Dasyprocta punctata, and the first record for the western slope of the Peruvian Andes for Cuniculus paca. Also, both specimen collections and sightings confirm the presence of Potos flavus, first record in the western slope of the Peruvian Andes. Panthera onca, Tremarctos ornatus and Saimiri sciureus are considered locally extinct, while several species are in need of further research. We highlight the importance of the high diversity of this rainforests and encourage local authorities to give the area the highest priority in conservation.

El Bosque Tropical de Pacífico y el Bosque Seco Ecuatorial, solo se encuentran desde el Sur de Ecuador hasta el Norte de Perú y están dentro de los ecosistemas más pobremente estudiados de Sudamérica. A pesar que estos bosques se encuentran protegidos dentro del Parque Nacional Cerros de Amotape (PNCA), están amenazados por fragmentación de hábitat debido a la agricultura y la ganadería. El objetivo de esta investigación fue determinar la riqueza de mamíferos medianos y grandes utilizando censos por transecto, cámaras trampa y colecta de especímenes. Se establecieron nueve transectos y se colocaron 21 estaciones con cámaras trampa en tres localidades del PNCA (16 km²) de agosto del 2012 a abril del 2013. El esfuerzo de muestreo acumulado fue 215 km de censos por transecto y 4077 cámara-días. Registramos 22 especies de mamíferos, 17 registradas con cámaras trampa, 11 con censos por transecto y diez con colecta de especímenes. El uso de cámaras trampa fue el método más efectivo y cuatro especies (Dasyprocta punctata, Cuniculus paca, Leopardus wiedii y Puma concolor) fueron registradas únicamente con este método. El registro de Dasyprocta punctata, es el primero para Perú y Cuniculus paca, el primer registro para la vertiente occidental de los Andes peruanos. Además, con avistamientos y colecta de especímenes se confirmó la presencia de Potos flavus para el PNCA siendo también el primer registro para la vertiente occidental de los Andes peruanos. A Panthera onca, Tremarctos ornatus y Saimiri sciureus se les considera localmente extintos, mientras que varias especies más necesitan mayor investigación para confirmar su presencia. Se resalta la importancia y alta diversidad de estos bosques y se recomienda a las autoridades locales darle prioridad en conservación.