Isolation and identification of mycobacteria responsible for tuberculosis of dromedaries in Algeria. / Isolement et identification de mycobactéries responsables de la tuberculose du dromadaire en Algérie.

Tuberculosis in dromedaries in Algeria has been little studied to date. The purpose of this study is to determine the prevalence of tuberculosis in dromedaries in three Algerian slaughterhouses using samples from suspected tuberculosis lesions, which were detected on carcasses during a post-mortem visual inspection. The study also uses laboratory diagnosis to isolate and identify the agents responsible for the infection. Between 2016 and 2018, 102 carcasses (3.05%; with a confidence interval [CI] of 95% from 2.05 to 3.69) were suspected of tuberculosis out of a total of 3,342 dromedary carcasses inspected. The lesions were located as follows in the carcasses: 64 of 102 were in the lungs, 37 in the liver and 1 in a bronchial ganglion. Five and six samples respectively of suspected tuberculosis lesions were found to be positive by bacilloscopy (4.9%; with a CI of 95% from 1.61 to 11.1) and in culture (5.88%; with a CI of 95% from 2.19 to 12.36). The concordance between bacilloscopy and culture was good (kappa coefficient of 0.71) and the probability of finding a positive culture was 184 times greater when the bacilloscopy was positive (value of p = 0.01). Molecular characterisation by polymerase chain reaction of extracts of DNA gave a positive signal, indicating that the isolated strains belonged to a mycobacterium genus. An enzymatic restriction on DNA extracts indicated the presence of mycobacterium DNA belonging to the Mycobacterium tuberculosis complex. Spoligotyping on the same DNA extracts confirmed the presence of four strains of Mycobacterium bovis with the same spoligotype SB0941 and another strain with spoligotype SB2562, a newly described profile in this study, which is phylogenetically close to the previous profile. Using suspected tuberculosis lesions in dromedaries, a non-tuberculosis mycobacterium was identified as Mycobacterium virginiense MO-233 (sequence ID: Nr149186) using the sequencing technique on the region 16SrDNA. Having demonstrated the presence of tuberculosis with M. bovis in the Algerian dromedary population, it is now necessary to implement measures to control it in order to reduce transmission between animals and humans.

À ce jour, la tuberculose a été peu étudiée chez les camélidés en Algérie. L'objectif de cette étude est de déterminer la prévalence de la tuberculose cameline dans trois abattoirs algériens à partir de prélèvements de lésions suspectes de cette maladie qui ont été détectées sur des carcasses lors de l'examen à l'inspection visuelle post-mortem. L'étude vise aussi à isoler et à identifier les agents responsables de cette infection par un diagnostic de laboratoire. Durant la période de 2016 à 2018, 102 carcasses (3,05 % ; avec un intervalle de confiance [IC] à 95 % de 2,05 à 3,69) ont été déclarées suspectes de tuberculose sur un total de 3 342 carcasses de dromadaires inspectées. Concernant la localisation des lésions sur ces 102 carcasses, 64 présentaient des lésions aux poumons, 37 au niveau du foie et 1 dans un ganglion bronchique. Respectivement cinq et six échantillons de lésions suspectes de tuberculose cameline ont été trouvés positifs à la bacilloscopie (4,90 % ; avec un IC à 95 % de 1,61 à 11,10) et en culture (5,88 % ; avec un IC à 95 % de 2,19 à 12,36). La concordance entre la bacilloscopie et la culture était bonne (coefficient kappa de 0,71) et la probabilité de trouver une culture positive était 184 fois plus élevée lorsque la bacilloscopie était positive (valeur de p = 0,01). La caractérisation moléculaire par réaction de polymérisation en chaîne (PCR) des extraits d'ADN a montré un signal positif, signifiant que les souches isolées appartenaient au genre mycobactérien. Une restriction enzymatique réalisée sur des extraits d'ADN a indiqué la présence d'ADN d'une mycobactérie appartenant au complexe Mycobacterium tuberculosis. Une technique de spoligotypage réalisée sur les mêmes extraits d'ADN a permis de confirmer la présence de quatre souches de Mycobacterium bovis avec un même spoligotype SB0941 et d'une autre souche avec un spoligotype SB2562, un profil nouvellement décrit dans cette étude et qui est phylogénétiquement proche du profil précédent. Au départ de lésions suspectes de tuberculose chez le dromadaire, une souche de mycobactérie non tuberculeuse a été identifiée comme étant un Mycobacterium virginiense MO-233 (séquence ID : Nr149186) par la technique de séquençage de la région 16SrDNA. La présence de la tuberculose à M. bovis ayant été démontrée dans la population cameline algérienne, il est dès lors nécessaire de mettre en oeuvre des mesures visant à la contrôler en vue de réduire la transmission entre l'animal et l'homme.

A día de hoy, la tuberculosis está poco estudiada en los camélidos de Argelia. Los autores presentan un estudio encaminado a determinar la prevalencia de la tuberculosis de los camélidos en tres mataderos argelinos a partir de muestras de lesiones sospechosas, detectadas en las canales durante la inspección visual post-mortem. El estudio consistía pues en aislar e identificar, mediante técnicas de diagnóstico de laboratorio, a los agentes responsables de la infección. Entre 2016 y 2018, de un total de 3 342 canales de dromedarios inspeccionadas, 102 fueron declaradas sospechosas de tuberculosis (un 3,05%; intervalo de confianza [IC] del 95%: 2,05-3,69). En cuanto a la localización de las lesiones, en 64 de los 102 animales, estas se encontraban en los pulmones, en 37 de los 102 en la región del hígado y 1 de los animales presentaba una lesión en un ganglio bronquial. De las muestras de lesiones sospechosas de tuberculosis de los camélidos, cinco resultaron positivas por baciloscopia (un 4,90%; IC del 95%: 1,61-11,10) y seis en cultivo (un 5,88%; IC del 95%: 2,19-12,36). Entre la baciloscopia y el cultivo hubo una estrecha concordancia (coeficiente kappa: 0,71) y la probabilidad de encontrar un cultivo positivo fue 184 veces mayor cuando la baciloscopia era positiva (p = 0,01). La caracterización molecular de extractos de ácido desoxirribonucleico (ADN) por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) deparó una señal positiva, lo que significa que las cepas aisladas pertenecían al género Mycobacterium. La aplicación de una técnica de restricción enzimática a extractos de ADN puso de relieve la presencia de ADN de una micobacteria perteneciente al complejo Mycobacterium tuberculosis. Aplicando una técnica de espoligotipificación a los mismos extractos de ADN se pudo confirmar la presencia de cuatro cepas de Mycobacterium bovis con un mismo espoligotipo, SB0941, y de otra cepa con el espoligotipo SB2562, patrón nuevo y filogenéticamente cercano al anterior que se describe aquí por primera vez. A partir de lesiones sospechosas de tuberculosis detectadas en dromedarios se pudo caracterizar una cepa de micobacteria no tuberculosa, identificada como Mycobacterium virginiense MO-233 (secuencia ID: Nr149186), con la técnica de secuenciación de la región 16S rDNA. Habiendo quedado demostrada la presencia de tuberculosis por M. bovis en la población de camélidos argelina, se impone la necesidad de implantar medidas para controlarla, a fin de reducir la transmisión entre los animales y el ser humano.