RESUMO
Introdução: os métodos moleculares de diagnóstico apresentam como uma das principais vantagens a detecção de microrganismos por meio do DNA bacteriano, levando a uma caracterização microbiana mais acurada. Objetivo: o presente estudo visou investigar a diversidade bacteriana presente nas infecções endodônticas primárias e secundárias/persistentes, comparando o perfil das comunidades microbianas existentes antes e após a terapia endodôntica. Métodos: as amostras microbiológicas foram coletadas antes (T1) e após terapia endodôntica (T2), utilizando cone de papel estéril/apirogênico em dentes com infecções endodônticas primárias (n = 10) e secundárias / persistentes (n = 10). A presença e os níveis de 40 espécies bacterianas nas infecções endodônticas foram investigados por meio da técnica de Checkerboard DNA-DNA Hybridization. Resultados: nas infecções endodônticas primárias em T1, as espécies encontradas em maiores níveis foram P. micra, F. nucleatum sp. nucleatum, S. constellatus, P. gingivalis, G. morbillorum, P. endodontalis, T. denticola, P. acnes, S. gordonii, S. mitis, V. parvula e C. rectus. Em T2, as bactérias mais encontradas foram P. micra, S. oralis e P. acnes. Nas infecções endodônticas secundárias em T1, as espécies mais frequentemente encontradas foram P. acnes, P. micra, S. constellatus, G. morbillorum, C. rectus, A. naeslundii, S. mitis e S. oralis. Em T2, as espécies mais encontradas foram Enterococcus faecalis e Propionibacterium acnes. Conclusão: o presente estudo confirmou comunidades microbianas distintas em infecções endodônticas primárias e secundárias. Além disso, os procedimentos clínicos endodônticos mostraram-se eficazes na redução significativa da prevalência, dos níveis de detecção e na diversidade bacteriana.