APOA4 polymorphism as a risk factor for unfavorable lipid serum profile and depression: a cross-sectional study.

INTRODUCTION: APOA1/C3/A4/A5 gene cluster is closely involved in lipid metabolism, and its polymorphisms have been associated with coronary heart disease and lipid plasma levels. Here, we aimed to investigate associations of APOC3 (3238C>G, -482C>T, 1100C>T) and APOA4 (Gln360His, Thr347Ser) polymorphisms in 382 individuals from a cohort of a Longitudinal Brazilian Elderly Study with major age-related morbidities and with lipid and protein serum levels. MATERIALS AND METHODS: The whole sample was genotyped by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism. Descriptive statistics, logistic regression analysis, Student t test, deviation from Hardy-Weinberg, Bonferroni correction for multiple testing, and haplotype analyses were performed. RESULTS: Although APOC3 1100T allele carriers presented lower triglyceride and very low density lipoprotein levels than non-T carriers, these associations disappeared after Bonferroni correction (P > 0.05). Moreover, APOA4 360His allele was associated with depression (P = 0.03), increased triglyceride (P = 0.035) and very low density lipoprotein (P = 0.035) levels, and reduced HDL levels (P = 0.0005). Haplotype analyses found an association between His/C/C haplotype (Gln360His/-482C>T/1100C>T) with depression, but this result was due to Gln360His polymorphism. CONCLUSIONS: Our data suggest that 360His allele might be a risk factor for depression and unfavorable lipid profile and depression for elderly people in the Brazilian population.

Polimorfismo do gene da apolipoproteína A-IV: 360 Gln/His em idosos e fenótipos associadosao envelhecimento / Apolipoprotein A-IV: 360 Gln/His polymorphism in elderly people and phenotypes associated to aging

Objetivo: Determinar a freqüência gênica do polimorfismo da apolipoproteína A-IV:360 Gln/His em uma população brasileira de idosos e analisar sua associação com doenças relacionadas ao envelhecimento e com aneuploidia do cromossomo X em idosas. Analisar a diferença de expressão gênica em hipocampo de camundongos submetidos a estresse crônico de retenção. Métodos: O genótipo da apolipoproteína A-IV:360 (apoA-IV) foi determinado em 383 idosos brasileiros por PCR seguida de digestão enzimática. As associações do polimorfismo com morbidades presentes nesta população foram avaliados por regressão logística. Realizamos experimentos de hibridação in situ fluorescente (FISH) com sonda centromérica do cromossomo X em linfócitos de 24 idosas, portadoras ou não do alelo His. As diferenças no padrão de expressão gênica em hipocampo de camundongos submetidos a estresse de retenção foram observadas por cDNA microarray em comparação a camundongos controles. Resultados: A freqüência do alelo His da apoA-IV:360 foi de 0,056 e esta população se mostrou em equilíbrio de Hardy-Weinberg. A análise por regressão logística mostrou uma associação significativa entre a presença do alelo raro e a ocorrência de doença cerebrovascular e/ou ataque isquêmico transitório, obesidade e depressão. Observamos uma proporção significativamente maior de células aneuploides em relação ao cromossomo X em idosas portadoras do alelo His quando comparadas a homozigotas para o alelo Gln. Quanto à diferença na expressão gênita em hipocampo de camundongos submetidos ao estresse, observamos que dentre as 15 mil seqüências contidas nas lâminas de microarray, 444 se mostraram diferencialmente expressas, mas apenas 230 delas eram conhecidas. Escolhemos seis destas para posterior análise e confirmamos por PCR em tempo real que os genes Gstp2, Grb2 e Pip5k1 b estão menos expressos no hipocampo de camundongos submetidos ao estresse...

Asociacion entre la pérdida del cromosoma x en mujeres de edad avanzada y el polimorfismo de la apolipoproteina a-iv: 360 gln/his / Association of chromosome x loss in elderly women with apolipoprotein a-iv: 360 polymorphism

La pérdida del cromosoma X en mujeres, asociada a la edad avanzada, es un fenómeno ya reconocido hace décadas. Los factores genéticos que llevan a esta pérdida o a la no-disyunción cromosómica, son poco conocidos. Polimorfismos de apolipoproteinas fueron asociados a la ocurrencia de sindromes cromosómicos como las trisomias del 18 y 21 y fue sugerida su participación en la segregación cromosómica. Polimorfismos de la apolipoproteina AIV:360 fueron asociados a molestias cardiovasculares en la población brasile¤a. Veinticuatro mujeres entre 72 a 87 a¤os, fueron seleccionadas para estudiar la presencia o ausencia del alelo 2 (HIS) y analizar la pérdida del cromosoma X. El analisis citogenético fue realizado en núcleos interfásicos de cultivos de linfocitos por técnica de hibridación in situ con sonda fluorescente centromérica del cromosoma X. El análisis genotipico fue realizado a partir de ADN extraido de la sangre, amplificado por PCR y digerido por la enzima de restricción Fnu4HI. Se observó una proporción significantemente mayor de células con la perdida del cromosoma X, en mujeres con alelo 2 (HIS). Estos resultados indican la participación del gen de la ApoA-IV en la no-disyunción cromosómica. Los mecanismos de su actuación pueden estar relacionados a da¤os oxidativos producto de alteraciones en la microcirculación e inducción de muerte celular. La comprensión de este mecanismo todavia necesita de mayor investigación.

The largest subunit of the RNA polymerase II of Trypanosoma cruzi lacks the repeats in the carboxy-terminal domain and is encoded by several genes.

The largest subunit of eukaryotic RNA polymerase II (RNA Pol II) of several members of Kinetoplastida order and other early diverging eukaryote contains a serine, tyrosine and proline-rich domain in the carboxyl-terminal instead of the typical heptapeptides repeats found in most eukaryotes. The lack of these repeats seems to reflect the different control of gene transcription found in these organisms. To provide further understanding in these mechanisms, we have characterized the largest subunit of RNA polymerase II (RNA Pol II LSU) in Trypanosoma cruzi. We found that it also lacks the heptapeptide repeats in the carboxy-terminal domain, but is quite similar to the same region in the Trypanosoma brucei enzyme, suggesting a conserved role for this domain. In addition, we found several genes encoding the RNA Pol II in T. cruzi, distributed in different chromosomal bands in several isolates. Two of these genes were entirely sequenced and shown to be quite similar. The presence of several gene copies of the RNA Pol II LSU, also described in African trypanosomes might reflect a gene amplification requirement that appeared early in the evolution of these organisms.