An evolutionary view of the Fusarium core genome.

Fusarium, a member of the Ascomycota fungi, encompasses several pathogenic species significant to plants and animals. Some phytopathogenic species have received special attention due to their negative economic impact on the agricultural industry around the world. Traditionally, identification and taxonomic analysis of Fusarium have relied on morphological and phenotypic features, including the fungal host, leading to taxonomic conflicts that have been solved using molecular systematic technologies. In this work, we applied a phylogenomic approach that allowed us to resolve the evolutionary history of the species complexes of the genus and present evidence that supports the F. ventricosum species complex as the most basal lineage of the genus. Additionally, we present evidence that proposes modifications to the previous hypothesis of the evolutionary history of the F. staphyleae, F. newnesense, F. nisikadoi, F. oxysporum, and F. fujikuroi species complexes. Evolutionary analysis showed that the genome GC content tends to be lower in more modern lineages, in both, the whole-genome and core-genome coding DNA sequences. In contrast, genome size gain and losses are present during the evolution of the genus. Interestingly, core genome duplication events positively correlate with genome size. Evolutionary and genome conservation analysis supports the F3 hypothesis of Fusarium as a more compact and conserved group in terms of genome conservation. By contrast, outside of the F3 hypothesis, the most basal clades only share 8.8% of its genomic sequences with the F3 clade.

Fungal taxonomy: A puzzle with many missing pieces / Taxonomía de los hongos: un rompecabezas al que le faltan muchas piezas

Fungi are multifaceted organisms found in almost all ecosystems on Earth, where they establish various types of symbiosis with other living beings. Despite being recognized by humans since ancient times, and the high number of works delving into their biology and ecology, much is still unknown about these organisms. Some criteria classically used for their study are nowadays limited, generating confusion in categorizing them, and even more, when trying to understand their genealogical relationships. To identify species within Fungi, phenotypic characters to date are not sufficient, and to construct a broad phylogeny or a phylogeny of a particular group, there are still gaps affecting the generated trees, making them unstable and easily debated. For health professionals, fungal identification at lower levels such as genus and species, is enough to select the most appropriate therapy for their control, understand the epidemiology of clinical pictures associated, and recognize outbreaks and antimicrobial resistance. However, the taxonomic location within the kingdom, information with apparently little relevance, can allow phylogenetic relationships to be established between fungal taxa, facilitating the understanding of their biology, distribution in nature, and pathogenic potential evolution. Advances in molecular biology and computer science techniques from the last 30 years have led to crucial changes aiming to establish the criteria to define a fungal species, allowing us to reach a kind of stable phylogenetic construction. However, there is still a long way to go, and it requires the joint work of the scientific community at a global level and support for basic research.

Los hongos son organismos polifacéticos presentes en casi todos los ecosistemas de la tierra, donde establecen diversos tipos de simbiosis con otros seres vivos. A pesar de ser reconocidos por los humanos desde la antigüedad -y de la cantidad de trabajos que han profundizado sobre su biología y ecología-, aún falta mucho por conocer sobre estos organismos. Algunos de los criterios que clásicamente se han utilizado para su estudio, hoy resultan limitados y hasta cierto punto permiten un agrupamiento de los aislamientos según algunas características, pero generan confusión en su clasificación y, más aún, cuando se pretende comprender sus relaciones genealógicas. Los caracteres fenotípicos no son suficientes para identificar una especie de hongos y, menos aún, para construir una filogenia amplia o de un grupo particular. Hay grandes vacíos que hacen que los árboles generados sean inestables y fácilmente debatidos. Para los profesionales de la salud, parece que la identificación de los hongos hasta niveles inferiores como género y especie es suficiente para elegir el tratamiento más adecuado para su control, comprender la epidemiología de los cuadros clínicos asociados y reconocer los brotes y los factores determinantes de la resistencia a los antimicrobianos. No obstante, la ubicación taxonómica dentro del reino permitiría establecer relaciones filogenéticas entre los taxones fúngicos, facilitando la comprensión de su biología, su distribución en la naturaleza y la evolución de su potencial patogénico.

Phenotypic and genotypic characterization of Colombian clinical isolates of Sporothrix spp. / Caracterización fenotípica y genotípica de aislamientos clínicos colombianos de Sporothrix spp.

INTRODUCTION: For over a century, Sporothrix schenckii was considered the sole species responsible for sporotrichosis. In 2007, scientific community confirmed the disease could be caused by various Sporothrix species. These species differed in their virulence factors and their antifungal sensitivity. OBJECTIVE: This study aims to characterize 42 Colombian clinical isolates of Sporothrix spp. phenotypically and genotypically. MATERIAL AND METHODS: Forty-two clinical isolates were characterized using phenotypic methods. It involved various culture media to determine their growth range at different temperatures and to assess the type and distribution of pigment and colony texture. Microscopic morphology was evaluated through microcultures, as well as the conidia diameter, type of sporulation, and morphology. Additionally, the assimilation of carbohydrates was selected as a physiological trait for species identification. Genotyping of 40 isolates was performed through partial amplification of the calmodulin gene, followed by sequence analysis. RESULTS: Molecular studies enabled the identification of 32 isolates of S. schenckii and 8 isolates of S. globosa. The combination of phenotypic and genotypic methods eased these species characterizations and the recognition keys development based on parameters such as growth diameter at 25 and 30 ºC, colony texture (membranous or velvety) on potato dextrose agar, and microscopic morphology with predominance of pigmented triangular, elongated oval globose, or subglobose conidia. CONCLUSIONS: Confirmation of the phenotypic characteristics and molecular analysis is crucial for identifying Sporothrix species and determining adequate treatment. This study represents the first phenotypical and genotypical characterization of clinical isolates of Sporothrix spp. reported in Colombia.

Introducción: Por más de un siglo se creyó que Sporothrix schenckii era la única especie responsable de la esporotricosis. Sin embargo, en el 2007, se consideró que podría ser causada por diferentes especies de Sporothrix, que difieren en sus factores de virulencia y su sensibilidad a los antifúngicos. Objetivo: Caracterizar fenotípica y genotípicamente 42 aislamientos clínicos colombianos de Sporothrix spp. Materiales y métodos: Se caracterizaron 42 aislamientos clínicos mediante métodos fenotípicos. Se usaron varios medios de cultivo para determinar el rango de crecimiento a diferentes temperaturas, el tipo y la distribución del pigmento, y la textura de las colonias. Se evaluó la morfología microscópica por microcultivos mediante la determinación del diámetro, el tipo de esporulación y la morfología de las conidias. La asimilación de carbohidratos se usó como una característica fisiológica para identificar las especies. La genotipificación de los 40 aislamientos se llevó a cabo mediante la amplificación parcial del gen que codifica para la calmodulina y se confirmó por secuenciación. Resultados: Mediante estudios moleculares, se identificaron 32 aislamientos de S. schenckii y ocho de S. globosa. La combinación de métodos fenotípicos y genotípicos permitió caracterizar las especies y construir claves para su reconocimiento, con base en parámetros como el diámetro de crecimiento a 25 y 30 ºC, la textura de las colonias (membranosa, aterciopelada) en agar papa dextrosa y la morfología microscópica con predominio de conidias (triangulares pigmentadas, ovales globosas elongadas, subglobosas). Conclusiones: La caracterización fenotípica y los análisis moleculares son necesarios para identificar las especies de Sporothrix y, de esta forma, elegir el tratamiento indicado. Esta es la primera caracterización fenotípica y genotípica reportada de aislamientos clínicos colombianos de Sporothrix spp.

Phenotypic and genotypic characterization of Colombian clinical isolates of Sporothrix spp

Introduction. For over a century, Sporothrix schenckii was considered the sole species responsible for sporotrichosis. In 2007, scientific community confirmed the disease could be caused by various Sporothrix species. These species differed in their virulence factors and their antifungal sensitivity. Objective. This study aims to characterize 42 Colombian clinical isolates of Sporothrix spp. phenotypically and genotypically. Material and methods. Forty-two clinical isolates were characterized using phenotypic methods. It involved various culture media to determine their growth range at different temperatures and to assess the type and distribution of pigment and colony texture. Microscopic morphology was evaluated through microcultures, as well as the conidia diameter, type of sporulation, and morphology. Additionally, the assimilation of carbohydrates was selected as a physiological trait for species identification. Genotyping of 40 isolates was performed through partial amplification of the calmodulin gene, followed by sequence analysis. Results. Molecular studies enabled the identification of 32 isolates of S. schenckii and 8 isolates of S. globosa. The combination of phenotypic and genotypic methods eased these species characterizations and the recognition keys development based on parameters such as growth diameter at 25 and 30 °C, colony texture (membranous or velvety) on potato dextrose agar, and microscopic morphology with predominance of pigmented triangular, elongated oval globose, or subglobose conidia. Conclusions. Confirmation of the phenotypic characteristics and molecular analysis is crucial for identifying Sporothrix species and determining adequate treatment. This study represents the first phenotypical and genotypical characterization of clinical isolates of Sporothrix spp. reported in Colombia.

Introducción. Por más de un siglo se creyó que Sporothrix schenckii era la única especie responsable de la esporotricosis. Sin embargo, en el 2007, se consideró que podría ser causada por diferentes especies de Sporothrix, que difieren en sus factores de virulencia y su sensibilidad a los antifúngicos. Objetivo. Caracterizar fenotípica y genotípicamente 42 aislamientos clínicos colombianos de Sporothrix spp. Materiales y métodos. Se caracterizaron 42 aislamientos clínicos mediante métodos fenotípicos. Se usaron varios medios de cultivo para determinar el rango de crecimiento a diferentes temperaturas, el tipo y la distribución del pigmento, y la textura de las colonias. Se evaluó la morfología microscópica por microcultivos mediante la determinación del diámetro, el tipo de esporulación y la morfología de las conidias. La asimilación de carbohidratos se usó como una característica fisiológica para identificar las especies. La genotipificación de los 40 aislamientos se llevó a cabo mediante la amplificación parcial del gen que codifica para la calmodulina y se confirmó por secuenciación. Resultados. Mediante estudios moleculares, se identificaron 32 aislamientos de S. schenckii y ocho de S. globosa. La combinación de métodos fenotípicos y genotípicos permitió caracterizar las especies y construir claves para su reconocimiento, con base en parámetros como el diámetro de crecimiento a 25 y 30 °C, la textura de las colonias (membranosa, aterciopelada) en agar papa dextrosa y la morfología microscópica con predominio de conidias (triangulares pigmentadas, ovales globosas elongadas, subglobosas). Conclusiones. La caracterización fenotípica y los análisis moleculares son necesarios para identificar las especies de Sporothrix y, de esta forma, elegir el tratamiento indicado. Esta es la primera caracterización fenotípica y genotípica reportada de aislamientos clínicos colombianos de Sporothrix spp.

Taxonomía de los hongos: un rompecabezas al que le faltan muchas piezas

Los hongos son organismos polifacéticos presentes en casi todos los ecosistemas de la tierra, donde establecen diversos tipos de simbiosis con otros seres vivos. A pesar de ser reconocidos por los humanos desde la antigüedad -y de la cantidad de trabajos que han profundizado sobre su biología y ecología-, aún falta mucho por conocer sobre estos organismos. Algunos de los criterios que clásicamente se han utilizado para su estudio, hoy resultan limitados y hasta cierto punto permiten un agrupamiento de los aislamientos según algunas características, pero generan confusión en su clasificación y, más aún, cuando se pretende comprender sus relaciones genealógicas. Los caracteres fenotípicos no son suficientes para identificar una especie de hongos y, menos aún, para construir una filogenia amplia o de un grupo particular. Hay grandes vacíos que hacen que los árboles generados sean inestables y fácilmente debatidos. Para los profesionales de la salud, parece que la identificación de los hongos hasta niveles inferiores como género y especie es suficiente para elegir el tratamiento más adecuado para su control, comprender la epidemiología de los cuadros clínicos asociados y reconocer los brotes y los factores determinantes de la resistencia a los antimicrobianos. No obstante, la ubicación taxonómica dentro del reino permitiría establecer relaciones filogenéticas entre los taxones fúngicos, facilitando la comprensión de su biología, su distribución en la naturaleza y la evolución de su potencial patogénico. Los avances de las técnicas de biología molecular y las ciencias de la computación en los últimos 30 años han permitido cambios importantes dirigidos a establecer los criterios para definir una especie fúngica y alcanzar una construcción filogenética más o menos estable. Sin embargo, el camino por recorrer aún es largo, y supone un trabajo mancomunado de la comunidad científica a nivel global y el apoyo a la investigación básica.

Fungi are multifaceted organisms found in almost all ecosystems on Earth, where they establish various types of symbiosis with other living beings. Despite being recognized by humans since ancient times, and the high number of works delving into their biology and ecology, much is still unknown about these organisms. Some criteria classically used for their study are nowadays limited, generating confusion in categorizing them, and even more, when trying to understand their genealogical relationships. To identify species within Fungi, phenotypic characters to date are not sufficient, and to construct a broad phylogeny or a phylogeny of a particular group, there are still gaps affecting the generated trees, making them unstable and easily debated. For health professionals, fungal identification at lower levels such as genus and species, is enough to select the most appropriate therapy for their control, understand the epidemiology of clinical pictures associated, and recognize outbreaks and antimicrobial resistance. However, the taxonomic location within the kingdom, information with apparently little relevance, can allow phylogenetic relationships to be established between fungal taxa, facilitating the understanding of their biology, distribution in nature, and pathogenic potential evolution. Advances in molecular biology and computer science techniques from the last 30 years have led to crucial changes aiming to establish the criteria to define a fungal species, allowing us to reach a kind of stable phylogenetic construction. However, there is still a long way to go, and it requires the joint work of the scientific community at a global level and support for basic research.

Gene expression profiles of ERG11, MDR1 and AFR1 in Cryptococcus neoformans var.grubbi from HIV patients / Perfiles de expresión de los genes ERG11, MDR1 y AFR1 en Cryptococcus neoformans var. grubii aislados de pacientes con VIH

Introduction: Fluconazole is the most used antifungal drug for prevention and treatment of Cryptococcus spp. infections, the etiological agent of cryptococcosis. Resistance to fluconazole among Cryptococcus neoformans isolates can lead to treatment failure and generate relapses. Objective: To evaluate the expression profiles of the AFR1, MDR1 and ERG11 genes in C. neoformans var. grubii clinical isolates during the in vitro response to fluconazole induction. Materials and methods: Fourteen C. neoformans var. grubii isolates recovered from HIV patients were studied, in which 6 showed sensitivities to fluconazole and 8 decreased sensitivity. The expression levels of ERG11, AFR1 and MDR1 genes were determined by real-time PCR from extracted mRNA. Results: AFR1 and MDR1 genes from C. neoformans var. grubii were overexpressed in fluconazole resistant isolates, whereas ERG11 maintains homogeneous expression in all the evaluated resistance phenotypes of C. neoformans var. grubii isolates. Conclusions: The overexpression of AFR1 and MDR1 genes, which codify for efflux pumps, contributes to fluconazole resistance in the studied isolates. However, the resistance patterns in this fungus and the relapse cases in HIV patients cannot be attributed solely to the exposure to the drug. Heteroresistance and the emerging resistance (resistance through other ERG genes), might be other mechanisms involved in this phenomenon, which must be studied in these isolations.

Introducción. El fluconazol es el antifúngico más utilizado para la prevención y el tratamiento de infecciones causadas por el género Cryptococcus, agente etiológico de la criptococosis. La resistencia al fluconazol en los aislamientos de Cryptoccocus neoformans puede hacer fracasar el tratamiento y generar recaídas de la infección. Objetivo. Evaluar los perfiles de expresión de los genes AFR1, MDR1 y ERG11 en aislamientos clínicos de C. neoformans var. grubii, durante la respuesta in vitro a la inducción con fluconazol. Materiales y métodos. Se estudiaron 14 aislamientos de C. neoformans var. grubii provenientes de pacientes con HIV, de los cuales 6 eran sensibles al fluconazol y 8 presentaban sensibilidad disminuida. Los niveles de expresión de los genes ERG11, AFR1 y MDR1 se determinaron mediante PCR en tiempo real. Resultados. Los aislamientos resistentes al fluconazol mostraron sobreexpresión de los genes AFR1 y MDR1, mientras que la expresión de los fenotipos de resistencia evaluados se mantuvo homogénea en ERG11, en todos los aislamientos de C. neoformans var. grubii. Conclusiones. La sobreexpresión de los genes AFR1 y MDR1 que codifican las bombas de eflujo, contribuye a la resistencia al fluconazol en los aislamientos estudiados. Sin embargo, los patrones de resistencia que se registran en este hongo, sumado a los casos de recaídas en pacientes con HIV, no pueden atribuirse únicamente a los casos de resistencia por exposición al fármaco. Otros mecanismos podrían también estar involucrados en este fenómeno, como la resistencia emergente (resistencia mediante otros genes ERG) y la heterorresistencia, los cuales deben ser estudiados en estos aislamientos.

Perfiles de expresión de los genes ERG11, MDR1 y AFR1 en Cryptococcus neoformans var. grubii aislados de pacientes con HIV / Gene expression profiles of ERG11, MDR1 y AFR1 in Cryptococcus neoformans var. grubbi isolated from HIV patients

Introducción. El fluconazol es el antifúngico más utilizado para la prevención y el tratamiento de infecciones causadas por el género Cryptococcus, agente etiológico de la criptococosis. La resistencia al fluconazol en los aislamientos de Cryptoccocus neoformans puede hacer fracasar el tratamiento y generar recaídas de la infección. Objetivo. Evaluar los perfiles de expresión de los genes AFR1, MDR1 y ERG11 en aislamientos clínicos de C. neoformans var. grubii, durante la respuesta in vitro a la inducción con fluconazol. Materiales y métodos. Se estudiaron 14 aislamientos de C. neoformans var. grubii provenientes de pacientes con HIV, de los cuales 6 eran sensibles al fluconaol y 8 presentaban sensibilidad disminuida. Los niveles de expresión de los genes ERG11, AFR1 y MDR1 se determinaron mediante PCR en tiempo real. Resultados. Los aislamientos resistentes al fluconazol mostraron sobreexpresión de los genes AFR1 y MDR1, mientras que la expresión de los fenotipos de resistencia evaluados se mantuvo homogénea en ERG11, en todos los aislamientos de C. neoformans var. grubii. Conclusiones. La sobreexpresión de los genes AFR1 y MDR1 que codifican las bombas de eflujo, contribuye a la resistencia al fluconazol en los aislamientos estudiados. Sin embargo, los patrones de resistencia que se registran en este hongo, sumado a los casos de recaídas en pacientes con HIV, no pueden atribuirse únicamente a los casos de resistencia por exposición al fármaco. Otros mecanismos podrían también estar involucrados en este fenómeno, como la resistencia emergente (resistencia mediante otros genes ERG) y la heterorresistencia, los cuales deben ser estudiados en estos aislamientos.

Introduction: Fluconazole is the most used antifungal drug for prevention and treatment of Cryptococcus spp. infections, the etiological agent of cryptococcosis. Resistance to fluconazole among Cryptococcus neoformans isolates can lead to treatment failure and generate relapses. Objective: To evaluate the expression profles of the AFR1, MDR1 and ERG11 genes in C. neoformans var. grubii clinical isolates during the in vitro response to fluconazole induction. Materials and methods: Fourteen C. neoformans var. grubii isolates recovered from HIV patients were studied, in which 6 showed sensitivities to fluconazole and 8 decreased sensitivity. The expression levels of ERG11, AFR1 and MDR1 genes were determined by real-time PCR from extracted mRNA. Results: AFR1 and MDR1 genes from C. neoformans var. grubii were overexpressed in fluconazole resistant isolates, whereas ERG11 maintains homogeneous expression in all the evaluated resistance phenotypes of C. neoformans var. grubii isolates. Conclusions: The overexpression of AFR1 and MDR1 genes, which codify for efflux pumps, contributes to fluconazole resistance in the studied isolates. However, the resistance patterns in this fungus and the relapse cases in HIV patients cannot be attributed solely to the exposure to the drug. Heteroresistance and the emerging resistance (resistance through other ERG genes), might be other mechanisms involved in this phenomenon, which must be studied in these isolations.

Modelos de promoción de la salud y determinantes sociales: una revisión narrativa / Health promotion models and social determinants of health: a narrative review / Modelos de promoção da saúde e determinantes sociais: uma revisão narrativa

Resumen Objetivo: este artículo se propone identificar diferentes modelos de promoción de la salud (PS), y analizar cómo ha evolucionado la promoción de la salud a partir de los lineamientos de los determinantes sociales de la salud (DSS) y su aplicabilidad en los países. Metodología: se parte de una revisión temática, de los artículos en Pubmed, Lilac y Scielo, mediante los operadores booleanos ((promoción salud) or (atención primaria)) and ((determinantes sociales) or (determinación social)), en los últimos 5 años; se obtuvieron 178 artículos en Lilac, 69 en Scielo, 132 en Pubmed; 33 en scholar.google.com, gracias a los descriptores: "modelos, enfoques y teorías" and PS. Resultados: las principales áreas identificadas fueron: atención primaria, DSS, políticas públicas, salud bucal, políticas de salud, servicios de salud, accesibilidad, enfermedades crónicas. Se analiza la lógica de la prevención y su diferenciación con la racionalidad de PS, a partir de un análisis del contexto de la práctica internacional. Se discute la confusión entre promoción y prevención y la falta de desarrollo de los niveles colectivos y comunitarios de la PS basados en la atención primaria en salud. Conclusiones: la PS y la prevención no lograron ser desarrolladas en los sistemas de salud. Muchos de los postulados teóricos de la PS han sido relegados. Se proponen varios niveles de intervención en PS: contextual, macro, meso, micro, individual, y acciones globales, estratégicas, comunitarias, interpersonales e intrapersonales. Hace falta más investigación sobre DSS, que establezca el balance entre lo individual y lo colectivo en PS.

Abstract Objective: This article intends to identify different models of health promotion (HP), and analyze how health promotion has evolved from the guidelines of social determinants (SDH) and its applicability in the countries. Methodology: starting from a thematic review of the articles in Pubmed, Lilac and Scielo, using the Boolean operators (PS) or (primary care) and (SDH) or (social determinants of health) in the last 5 years. A total of 178 articles were obtained in Lilac, 69 in Scielo, 132 in Pubmed. A total of 33 articles were found in scholar.google.com, thanks to the descriptors, "models, approaches and theories" and PS. Results: the main areas identified are: primary care, SDH, public policies, oral health, health policies, health services, accessibility. The logic of prevention and its differentiation with the rationality of PS is analyzed, based on an analysis of the context of international practice. The confusion between promotion and prevention and the lack of development of the collective and community levels of HP based on primary health care, are discussed. Conclusions: PS and prevention failed to be developed in health systems. Many of the theoretical postulates of PS have been relegated. Several levels of intervention in PS are proposed: contextual, macro, meso, micro, individual, and global, strategic, community, interpersonal and intrapersonal actions. More research is needed on SDH, which establishes the balance between the individual and the collective, in PS.

Resumo Objetivo: este artigo se propõe identificar diferentes modelos de promoção da saúde (PS), e analisar como tem evolucionado a promoção da saúde a partir dos lineamentos dos determinantes sociais da saúde (DSS) e sua aplicabilidade nos países. Metodologia: parte-se de uma revisão temática, dos artigos em Pubmed, Lilac e Scielo, mediante os operadores booleanos ((promoção saúde) ou (atenção primaria)) e ((determinantes sociais) ou (determinação social)), nos últimos 5 anos; se obtiveram 178 artigos em Lilac, 69 em Scielo, 132 em Pubmed; 33 em scholar.google.com, graças aos descritores: "modelos, enfoques e teorias" e PS. Resultados: as principais áreas identificadas foram: atenção primaria, DSS, políticas públicas, saúde bucal, políticas de saúde, serviços de saúde, acessibilidade, doenças crônicas. Analisa-se a lógica da prevenção e sua diferenciação com a racionalidade de PS, a partir de uma análise do contexto da prática internacional. Discute-se a confusão entre promoção e prevenção e a falta de desenvolvimento dos níveis coletivos e comunitários da PS baseados na atenção primaria em saúde. Conclusões: a PS e a prevenção não conseguiram ser desenvolvidas nos sistemas de saúde. Muitos dos postulados teóricos da PS tem sido relegados. Propõem-se vários níveis de intervenção em PS: contextual, macro, micro, individual, e ações globais, estratégicas, comunitárias, interpessoais e intrapessoais. Faz falta mais pesquisa sobre DSS, que estabeleçam o balanço entre o individual e o coletivo em PS.

La salud pública en Colombia (1991-2021). Promoción de la salud y prevención: una revisión

Objetivo Este artículo se propone realizar un balance de la promoción de la salud durante el desempeño del sistema de salud, a partir de la reforma constitucional de 1991. Métodos Se parte de una revisión temática, en bases de datos de PubMed, Scielo, Google Scholar, a través de los términos y operadores booleanos ("promoción de la salud" or "prevención") and ("Colombia"), en los últimos 10 años (2011-2021); y la legislación sobre promoción de la salud de los últimos 30 años en Colombia, seleccionando la más relevante. Discusión Se analiza la trayectoria regulatoria de la salud pública, derivada de la Ley 100 de 1993, destacando la confusión que entre promoción y prevención se dio en el sistema. Se discuten varias fases de desarrollo de la salud pública en este período, con grandes falencias en la primera década de la reforma, mejorando después del 2005, pero sin lograr su cometido, dadas las contradicciones con el modelo de mercado que rige el sistema. No se logran desarrollar los niveles colectivos y comunitarios de la promoción de la salud, como tampoco la perspectiva estratégica de la atención primaria en salud (APS). Conclusión La promoción de la salud y la prevención no lograron ser desarrolladas de manera cabal en Colombia, a pesar del entorno internacional proclive a su implementación mediante la atención primaria en salud. Muchos de los postulados teóricos de la legislación se han quedado en la retórica y pendientes de aplicación, muy a pesar del amplio marco regulatorio que se dio en estos treinta años.

Objective This article carries out a balance of health promotion during the performance of the health system, starting from the constitutional reform of 1991. Methods It is part of a thematic review, in databases, Pubmed, Scielo, google scholar, through boolean terms and operators (health promotion or prevention) and (Colombia), in the last 10 years (2011 - 2021); and the legislation on health promotion of the last 30 years in Colombia, selecting the most relevant. Discussion The regulatory trajectory of public health, derived from Law 100 of 1993, is analyzed, highlighting the confusion between promotion and prevention occurred in the system. Various phases of public health development are discussed in this period, with major flaws in the first decade of the reform, improving after 2005 but without achieving its mission, given the contradictions with the market model that governs the system. It was not possible to develop the collective and community levels of health promotion, as well as the strategic perspective of primary health care (PHC). Conclusion Health promotion and prevention could not be fully developed in Colombia, despite the international environment prone to its implementation through primary health care. Many of the theoretical postulates of the legislation have remained in rhetoric and pending application, despite the broad regulatory framework that has occurred in these 30 years.

La salud bucal, entre la salud sistémica y la salud pública / Oral health between systemic health and public health

Resumen Introducción: A pesar de la implementación de diversas estrategias para atender la problemática en salud bucal, aun esta adolece de una visión de integralidad del ser humano y la práctica sanitaria. Objetivo: Analizar desde una perspectiva interpretativa y crítica la salud bucal, con énfasis en el caso colombiano, como práctica sanitaria y profesional, siguiendo la lógica de su relación con la salud sistémica y la salud pública. Materiales y métodos: Se realizó una revisión narrativa de tipo documental, mediante la búsqueda en las bases de datos Pubmed y Google escolarship (GS) en los últimos 5 años con los términos booleanos (periodontitis or oral pahology) and (systemic diseases), para la pregunta guía: ¿Cómo la patología bucal influye en las enfermedades crónicas no transmisibles? Resultados: Se identificaron asociaciones de la patología bucal con la salud sistémica, con las ECNT (diabetes, enfermedades cardiovasculares, embarazo y eclampsia, enfermedad perinatal, Alzheimer), entre otras. Conclusiones: Es consistente en la literatura la relación biunívoca de la enfermedad periodontal con las enfermedades crónicas no transmisibles, aunque no se concluye sobre relaciones de causalidad. Se proponen algunas estrategias de salud pública y articulación de la práctica sanitaria interprofesional.

Abstract Introduction: Despite the implementation of diverse strategies to address oral health problems, they still lack an integral vision of both the human being and health practice. Objective: To analyze oral health as a medical and professional practice from an interpretative and critical perspective. The Colombian context was highlighted as well as the association of oral health with systemic and public health. Materials and methods: A documentary narrative review was conducted, searching the Boolean terms: (periodontitis or oral pathology) and (systematic diseases). The guiding question used was, "How does oral pathology affect chronic non-communicable diseases?" and the search included the last five years. Results: Associations of oral health with systemic health, CNCDs (diabetes, cardiovascular diseases, eclampsia, perinatal disease, and Alzheimer's), among others, were identified. Conclusions: A biunivocal relationship between periodontal disease and chronic non-communicable diseases is consistent in the literature, but causal relationships are difficult to conclude. Both public health strategies and an articulation of the interprofessional health practice are proposed.

Modelos para el análisis de políticas públicas en salud reportados en publicaciones científicas / Models for public health policy analysis reported in scientific publications

Objetivo: Sintetizar los modelos para el análisis de políticas públicas en salud reportados en investigaciones publicadas en el periodo 2002-2017. Método: Utilizando términos MesH se realizó una búsqueda sistemática de artículos en inglés, portugués y español en las bases de datos PubMed, Scielo, Jstor, ProQuest y Google Académico publicados en el periodo de estudio. La evaluación de la calidad se realizó mediante la herramienta para entender un estudio cualitativo desarrollada por CASPe. Resultados: La mayor proporción de investigaciones se realizaron en países del continente africano. Las políticas relacionadas con la atención en salud fueron objeto de investigación con mayor frecuencia. El modelo de análisis de políticas de Walt y Gilson, seguido del marco de corrientes múltiples de Kingdon, fueron los modelos que con mayor regularidad se reportaron. Conclusiones: En los artículos se enuncia el modelo de análisis de política pública, pero no el enfoque que la orienta. Se requiere construir un corpus teórico más robusto que permita la discusión sobre los enfoques y modelos para el análisis de políticas públicas. Su distinción es relevante, ya que puede ordenar las propuestas metodológicas para el estudio de las políticas. (AU)

Objective: To summarize public health policy models reported in studies published between 2002-2017. Method: Using MesH vocabulary, we systematically searched articles in English, Spanish and Portuguese in the PubMed, Scielo, Jstor, ProQuest and Google Scholar data-bases. The quality of the articles was assessed using the tool for understanding a qualitative study by CASPe. Results: A higher proportion of scientific studies were conducted in the African continent. The policies relating to health care were most frequently investigated. Walt and Gilson's model and Kingdon's multiple streams framework were more frequently reported. Conclusions: The articles set out the public policy analysis model, but not the approach to guide it. A more robust theoretical body needs to be built to enable discussion about the approaches and models for the analysis of public policies. Its distinction is relevant, since it can order methodological proposals for the study of policies. (AI)

[Models for public health policy analysis reported in scientific publications]. / Modelos para el análisis de políticas públicas en salud reportados en publicaciones científicas.

OBJECTIVE: To summarize public health policy models reported in studies published between 2002-2017. METHOD: Using MesH vocabulary, we systematically searched articles in English, Spanish and Portuguese in the PubMed, Scielo, Jstor, ProQuest and Google Scholar data-bases. The quality of the articles was assessed using the tool for understanding a qualitative study by CASPe. RESULTS: A higher proportion of scientific studies were conducted in the African continent. The policies relating to health care were most frequently investigated. Walt and Gilson's model and Kingdon's multiple streams framework were more frequently reported. CONCLUSIONS: The articles set out the public policy analysis model, but not the approach to guide it. A more robust theoretical body needs to be built to enable discussion about the approaches and models for the analysis of public policies. Its distinction is relevant, since it can order methodological proposals for the study of policies.

Caracterización de Candida spp. aisladas a partir de urocultivos en la ciudad de Medellín / Characterization of Candida spp isolated from urine cultures of Medellín

Resumen Candida spp. es un agente etiológico importante en infecciones del tracto urinario, principalmente en población con terapia antimicótica de amplio espectro y con catéteres urinarios. Candida albicans es la especie más frecuente, pero otras especies han surgido como patógenos emergentes. En este trabajo se recolectaron aislamientos de Candida spp. de urocultivos de pacientes que consultaron en Dinamica IPS entre enero 2016 y noviembre 2017. Para estimar la frecuencia de las especies y observar los patrones de sensibilidad, se realizó la identificación fenotípica y su perfil de sensibilidad con el sistema comercial Vitek 2® (BioMérieux, Inc.), adicionalmente se evaluaron mediante análisis de las secuencia y filogenética ITS1-5.8S-ITS2. En el estudio se incluyeron 78 aislamientos de Candida spp. Las frecuencias de especies de Candida identificadas empleando las herramientas moleculares fueron: C. albicans (38,5%), C. tropicalis (23,1%), C. glabrata (21,8%), C. parapsilosis (10,3%), C. metapsilosis y C. krusei (2,5%) y C. guillermondi (1,3%). La identificación por métodos moleculares y por el sistema Vitek 2 fue: C. albicans (93,3%), C. glabrata (94,1%), C. tropicalis (83,3%), C. parapsilosis (75%) C. guilliermondii y C. krusei (100%). La sensibilidad de todos los aislamientos al fluconazol fue 93,6%.

Abstract Candida spp is an important etiologic agent in urinary tract infections, mainly in patients in broad-spectrum antifungal therapy, with urinary catheters. Candida albicans is the most frequent specie; but other species have arised as emerging pathogens. In this study, isolates of Candida spp. of urine cultures from patients who consulted in Dinamica IPS between January 2016 and November 2017 were evaluated. To estimate the frequency of the species and to observe the sensitivity patterns, the phenotypic identification and its sensitivity profile was performed employed the Vitek 2® commercial system. (BioMérieux, Inc) In addition the isolates were evaluated by sequence analysis and phylogenetics ITS1-5.8S-ITS2. This study included 78 isolates of Candida spp. The frequencies of Candida species identified using the molecular tools were: C. albicans (38.5%), C. tropicalis (23.1%), C. glabrata (21.8%), C. parapsilosis (10.3%), C. guillermondi (1.3%) and C. metapsilosis and C. krusei (2.5%). The identification by molecular methods and by Vitek 2 system were: C. albicans (93.3%), for C. glabrata (94.1%), C. tropicalis (83.3%), C. parapsilosis (75%) and 100% for C. guilliermondii and C. krusei.. fluconazole sensitivity of all isolates was 93.6%

La salud pública en discusión

Este ensayo reflexivo discurre alrededor de la salud pública, en torno a temas discutibles, como su dimensión epistémica, su perspectiva frente a la dialéctica territorial local-global, su relación con la medicina social en Latinoamérica, su pretensión de cientificidad, su posición ante el asunto de la determinación y los determinantes sociales de la salud, su lugar en la contradicción entre el sujeto y la estructura, y cómo se ve afectada por la tensión del capitalismo cognitivo y la universidad. El texto considera el fracaso de las políticas en salud y de las políticas públicas globales, y propone la construcción académica y política de una transdisciplinariedad, basados en las teorías de la complejidad y otras concepciones novedosas, en interacción con otras áreas del conocimiento y actores diversos. Asimismo, defiende el rescate de la interculturalidad; propende por el debate teórico, junto a las ciencias sociales y humanas, sobre temas y problemas comunes; reconoce el pluralismo metodológico, validando los instrumentos de la epidemiología poblacional y otras modalidades de la misma, así como los avances de la investigación cualitativa y la comprensión de las intersubjetividades. Finalmente, el artículo recomienda que los salubristas asuman la salud pública como una opción con sentido de vida.

This reflective essay discusses public health topics such as its epistemic dimension, how it is affected by the local-global territory dialectics, its relationship with social medicine in Latin America, its pretense of scientificity, its stance regarding the issue of determination and social determinants of health, its place in the contradiction between subject and structure and how it is affected by the tension of cognitive capitalism and the university. The text discusses the failure of healthcare policies and global public policies, and proposes the academic and political construction of a transdisciplinarity based on the theories of complexity, interaction with other fields of knowledge and various actors. Likewise, it defends recovering interculturality and leans towards a theoretical debate, alongside social and human sciences, on common topics and problems. Similarly, it acknowledges methodological pluralism, thus validating the instruments of population epidemiology and other forms of it as well as the advancements in the field of qualitative research and the understanding of intersubjectivities. Finally, the paper recommends that healthcare professionals perceive public health as an option with a sense of life.

Este ensaio cogitativo discorre ao redor da saúde pública, circundando aos tópicos discutíveis, como a sua dimensão epistémica, como a afeta a dialética territorial local-global, o seu relacionamento com a medicina social na Latino américa, a sua pretensão de cientificidade, a sua postura diante do assunto da determinação e os determinantes sociais da saúde, o seu lugar na contradição entre o sujeito e a estrutura, e como se vê afetada pela tensão do capitalismo cognitivo e a universidade. O texto considera o fracasso das políticas em saúde e das políticas públicas globais, e propõe a construção académica e política duma trans. disciplinariedade, baseados nas teorias da complexidade, em interação com outras vertentes do conhecimento e atores diversos. Assim mesmo, defende o resgate da Inter cultural idade; promove o debate teórico, enxuto com as ciências sociais e humanas, alusivo a temas e dificuldades comuns; reconhece a pluralidade metodológica, avaliando os instrumentos, a epidemiologia populacional e outras modalidades da mesma, assim como os avanços da investigação qualitativa e a compreensão das Intersubjetividades. Finalmente, o artigo dica que o pessoal da saúde assuma a saúde pública como uma opção com sentido de vida.

[Global health: a Latin American vision]. / Salud global: una visión latinoamericana.

This article presents a Latin American vision of global health from a counterhegemonic perspective, applicable to various countries of the world in similar circumstances. It begins by reviewing several concepts and trends in global health and outlining the differences between conventional public health, international health, and global health, but without seeing them as antagonistic, instead situating them in a model that is based on global health and also includes the other two disciplines. It is understood that global factors influenced earlier theories, schemes, and models of classic international health. The article emphasizes the importance of several aspects of world-geopolitics and economic globalization that impose constraints on world health; it also underscores the theory of social and environmental determinants of the health-disease spectrum, which have impacts beyond those of epidemiologic risk factors. The suggested approach is based on cosmopolitanism and holism: global philosophical and political currents that allow for a better interpretation of world phenomena and are more relevant because they give rise to lines of action. Structurally, the theoretical foundations of global health are presented in three analytical areas: global justice and equity, governance and the supranational protection of rights, and holism and a new global consciousness. The article concludes by underscoring the need to construct an approach to the existence and praxis of global public health that is based on the Latin American perspective, an approach that highlights grassroots social movements as an alternative way to secure a new order and global awareness of rights and to redefine the architecture of global health governance.

Concepto de calidad en salud: resultado de las experiencias de la atención. Medellin,Colombia / The concept of health quality: results of the experiences of care.Medellín, Colombia / O conceito de qualidade em saúde: resultado das experiências da atenção. Medellín,Colombia

Este trabajo se realizó con usuarios del régimen subsidiado residentes en la comuna 16 de la ciudad de Medellín, Colombia, 2010. Objetivo: comprender las experiencias y significados que tienen los beneficiarios del régimen subsidiado de la comuna 16 sobre calidad de la atención en los servicios de salud. Metodología: investigación cualitativa - etnográfica. Se entrevistaron 10 beneficiarios del régimen subsidiado, mayores de 18 años, de ambos sexos. Resultados: el significado de calidad surge por las experiencias de los usuarios al recurrir a los servicios de salud. Para facilitar su comprensión se dividió el proceso de atención en 4 fases: pre- atención, atención inicial, atención como tal y la post- atención. Para los usuarios la calidad depende de qué tan humano fue el trato que recibieron, si el problema fue resuelto o no y hasta qué punto sus expectativas se cumplieron. Conclusión: Las experiencias son diferentes en las distintas etapas del proceso y según sean ellas, serán los significados que a la calidad le dan los usuarios. Para los usuarios son fundamentales el trato humanizado, la equidad y la participación.

This study was conducted with users from the subsidized health regime living in district 16, in the city of Medellin, Colombia, 2010. Objective: to understand the experiences and meanings that users of the subsidized health regime living in district 16 have regarding the quality of care in health services. Methodology: qualitative and ethnographic research. Ten users of the subsidized regime were interviewed. They were over 18 and from either sex. Results: the meaning of quality emerges from the experiences of these users when using health care services. To facilitate their understanding, the health care process was divided into 4 stages: pre-care, initial care, care per se and post-care. For users, quality is dictated by three factors: how humanely they have been treated, whether the problem was solved or not and the extent to which their expectations have been met. Conclusion:Experiences vary throughout the stages of the process and condition the users' meaning of quality. For users, humane treatment, equity and participation are vital.

Este projeto realizou-se com usuários do regime subsidiado residentes na comuna 16 da cidade de Medellín, Colômbia, 2010. Objetivo: compreender as experiências e significados que têm os beneficiários do regime subsidiado da comuna 16 sobre qualidade da atenção nos serviços de saúde. Metodologia: pesquisa qualitativa - etnográfica. Entrevistaram-se 10 beneficiários do regime subsidiado, com mais de 18 anos, de ambos sexos. Resultados: o significado de qualidade surge pelas experiências dos usuários ao recorrer aos serviços de saúde. Para facilitar a compreensão do processo de atenção dividiu-se em 4 fases: pré- atenção, atenção inicial, atenção como tal e a pós- atenção. Para os usuários a qualidade depende de que tão humano foi o trato que receberam, se o problema foi resolvido ou não e até que ponto suas expectativas se cumpriram. Conclusão: As experiências são diferentes nas diferentes fases do processo e segundo sejam elas, serão os significados que à qualidade lhe dão os usuários. Para os usuários são essenciais o trato humanizado, a equidade e a participação.

Salud global: una visión latinoamericana

En este artículo se presenta una visión latinoamericana de la salud global desde una perspectiva contrahegemónica, extensiva a varios países del mundo que viven circunstancias parecidas. Se parte del reconocimiento de varias concepciones y tendencias de la salud global y de las contradicciones entre la salud pública convencional, la salud internacional y la salud global sin antagonizarlas y logrando ubicarlas en un modelo construido desde la salud global que incluye las otras dos disciplinas. Se supone que lo global condiciona teorías, esquemas y modelos antecedentes de la salud internacional clásica y se subraya la importancia de varios hechos de la geopolítica mundial y de la globalización económica que confinan la salud mundial, así como la teoría de los determinantes sociales y ambientales del binomio salud– enfermedad, que inciden más allá del riesgo epidemiológico. El presente enfoque se apoya en el cosmopolitismo y en el holismo, corrientes filosóficas y políticas mundiales que permiten interpretar mejor los fenómenos mundiales y son más plausibles porque generan vertientes para la acción. Estructuralmente, se presentan las bases teóricas de la salud global en tres ejes analíticos: la justicia global y la equidad, la gobernanza y la preservación supranacional de los derechos, y el holismo y una nueva conciencia global. Se concluye resaltando la importancia de construir un enfoque acerca del ser y la praxis de la salud pública global desde la perspectiva latinoamericana, que destaca los movimientos sociales ciudadanos como una alternativa para conseguir un nuevo orden y una conciencia global por los derechos y redefinir la arquitectura de gobernanza global de la salud.

Salud global: una visión latinoamericana / Global health: a Latin American vision

RESUMEN En este artículo se presenta una visión latinoamericana de la salud global desde una perspectiva contrahegemónica, extensiva a varios países del mundo que viven circunstancias parecidas. Se parte del reconocimiento de varias concepciones y tendencias de la salud global y de las contradicciones entre la salud pública convencional, la salud internacional y la salud global sin antagonizarlas y logrando ubicarlas en un modelo construido desde la salud global que incluye las otras dos disciplinas. Se supone que lo global condiciona teorías, esquemas y modelos antecedentes de la salud internacional clásica y se subraya la importancia de varios hechos de la geopolítica mundial y de la globalización económica que confinan la salud mundial, así como la teoría de los determinantes sociales y ambientales del binomio salud– enfermedad, que inciden más allá del riesgo epidemiológico. El presente enfoque se apoya en el cosmopolitismo y en el holismo, corrientes filosóficas y políticas mundiales que permiten interpretar mejor los fenómenos mundiales y son más plausibles porque generan vertientes para la acción. Estructuralmente, se presentan las bases teóricas de la salud global en tres ejes analíticos: la justicia global y la equidad, la gobernanza y la preservación supranacional de los derechos, y el holismo y una nueva conciencia global. Se concluye resaltando la importancia de construir un enfoque acerca del ser y la praxis de la salud pública global desde la perspectiva latinoamericana, que destaca los movimientos sociales ciudadanos como una alternativa para conseguir un nuevo orden y una conciencia global por los derechos y redefinir la arquitectura de gobernanza global de la salud.

ABSTRACT This article presents a Latin American vision of global health from a counterhegemonic perspective, applicable to various countries of the world in similar circumstances. It begins by reviewing several concepts and trends in global health and outlining the differences between conventional public health, international health, and global health, but without seeing them as antagonistic, instead situating them in a model that is based on global health and also includes the other two disciplines. It is understood that global factors influenced earlier theories, schemes, and models of classic international health. The article emphasizes the importance of several aspects of world—geopolitics and economic globalization that impose constraints on world health; it also underscores the theory of social and environmental determinants of the health-disease spectrum, which have impacts beyond those of epidemiologic risk factors. The suggested approach is based on cosmopolitanism and holism: global philosophical and political currents that allow for a better interpretation of world phenomena and are more relevant because they give rise to lines of action. Structurally, the theoretical foundations of global health are presented in three analytical areas: global justice and equity, governance and the supranational protection of rights, and holism and a new global consciousness. The article concludes by underscoring the need to construct an approach to the existence and praxis of global public health that is based on the Latin American perspective, an approach that highlights grassroots social movements as an alternative way to secure a new order and global awareness of rights and to redefine the architecture of global health governance.

El rol de los profesionales de la salud en la atención primaria en salud (APS) / The role of health professionals in primary health care (PHC) / O papel dos profissionais da saúde na atenção primária à saúde (APS)

OBJETIVO: este artículo presenta una revisión crítica para desentrañar el rol de los profesionales de la salud en atención primaria en salud. METOLOGIA: mediante revisión narrativa se analizan conceptos de atención primaria en salud, sus conexiones con diferentes modelos de salud, el papel del equipo de salud tanto en la Atención Primaria en Salud como en sus diferentes enfoques. La revisión se amplía a las funciones del profesional de la salud en este campo y del médico general, en particular, así como sobre su accionar y capacitación. DISCUSION: se argumenta a partir de algunas preguntas sobre cuál es el papel de los profesionales de la salud en el sistema y el rol que deben jugar en la atención primaria y en la organización de los servicios de salud. Se particulariza en el sistema de salud colombiano y se hace énfasis en el cambio que se requiere del médico general, históricamente más ligado a la clínica y al hegemonismo del modelo biomédico. CONCLUSION: se presenta un boceto sobre la formación para las nuevas demandas en el actual momento, en tres dimensiones macro, meso y micro de la realidad sociosanitaria, sin desconocer las limitaciones estructurales del sistema colombiano que lo afectarán.

OBJECTIVE: this paper presents a critical review of the role of health professionals in primary health care. Methodology: narrative review concepts of primary health care, their connections with different models of health, the role of the health team in both the Primary Health Care and its various approaches. The revision expands the functions of the healthcare professional in this field and the general practitioner, in particular, as well as their actions and training. DISCUSSION: it is argued from some questions about what the role of health professionals in the system and the role it should play in primary care and the organization of health services. It is particularized in the Colombian health system and the emphasis is on the change that is required of the general practitioner, historically linked to the clinic and the hegemony of the biomedical model. CONCLUSION: a sketch is presented of the formation to the new realities and demands at the present time, three-dimensional macro, meso and micro levels of the socio healthcare.

Objetivo: este artigo apresenta uma revisão crítica para descobrir o papel dos profissionais da saúde em atenção primária à saúde. Metodologia: por meio de revisão narrativa analisam-se os conceitos de atenção primária à saúde, as suas conexões com diferentes modelos de saúde, o papel da equipe de saúde tanto na APS quanto nas suas diferentes abordagens. A revisão amplia-se às funções do profissional da saúde neste campo e do clínico geral, em particular, bem como sobre o seu agir e capacitação. Resultados : argumenta-se a partir de algumas perguntas sobre qual é o papel dos profissionais da saúde no sistema e o papel que devem desempenhar na atenção primária e na organização dos serviços de saúde. Particularizase no sistema de saúde colombiano e se enfatiza na mudança requerida do clínico geral, historicamente mais ligado à clínica e à hegemonia do modelo biomédico. Conclusões: apresentase um esboço sobre a formação para as novas demandas no momento atual, em três dimensões macro, meso e micro da realidade sociossanitária, sem desconhecer as limitações estruturais do sistema colombiano que o afetarão.