An analysis of the association between genotype and antimicrobial resistance in methicillin-resistant Staphylococcus aureus clinical isolates / Análisis de la asociación entre genotipos y resistencia a múltiples antimicrobianos en aislados de Staphylococcus aureus resistente a meticilina

Genotyping methods are useful resources for the surveillance, detection, prevention and control of multidrug-resistant nosocomial agents, such as methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). An understanding of the association between genotype and antibiotic susceptibility in MRSA clones may be useful in the surveillance of MRSA and to avoid inappropriate treatment future resistance. We genotyped MRSA clinical isolates from the Extremadura region of Spain using pulsed field electrophoresis (PFGE) and analyzed the spectrum of antibiotic susceptibility for each isolate to determine whether resistance is associated with specific genotypes. PFGE revealed six major genotypes: E8a (25%), E7b (17%), E7a (12%), E8B (8%), E10 (6%), and E20 (4%). Isolates with the genotypes E8a and E10 exhibit higher resistance ratios for levofloxacin than isolates with the other major pulsotypes. Similar results were obtained for isolates with the E20 pulsotype with respect to mupirocin. Although we identified no vancomycin-, tigecycline-, linezolid- or daptomycin-resistant strains, we observed significant differences in the mean MIC values obtained for some of these drugs among the major genotypes. Specifically, isolates with the E7b, E8b, and E20 genotypes have significantly higher MICs of tigecycline, vancomycin and linezolid, respectively, than the most sensitive pulsotypes. Isolates with the E8b profile also exhibit a significantly higher rate of reduced vancomycin susceptibility (RVS) (i.e., MIC between 1 and 2 mg/L) than clones with the E10 and E8a profiles. In conclusion, we report associations between genotype and antibiotic sensitivity that should be considered in programs for monitoring and controlling MRSA in health care settings (AU)

Los métodos de genotipaje son un recurso útil para la vigilancia, detención, prevención y control de agentes nosocomiales con multirresistencia antibiótica, como es Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SARM). Nuestro grupo lleva a cabo el genotipaje mediante Electroforesis en Campo Pulsado (PFGE) de cepas SARM productoras de infección en la región de Extremadura (España), y realiza un estudio de asociación de los clones obtenidos, con respecto a la sensibilidad antibiótica mostrada por las cepas genotipadas, con el objetivo de conocer si existen resistencias que puedan asociarse específicamente a genotipos concretos. PFGE revela la existencia de 6 genotipos mayoritarios: E8a (25%), E7b (17%), E7a (12%), E8b (8%), E10 (6%), E20 (4%). A través del test Exacto de Fisher determinamos que los genotipos E8a y E10 se inclinan hacia ratios de resistencia mayores para levofloxacino en comparación a los mostrados por otros pulsotipos mayoritarios. De manera análoga ocurre para el pulsotipo E20 con mupirocina. Aunque no se encuentran cepas resistentes para vancomicina, tigeciclina, linezolid y daptomicina, encontramos en los tres primeros, diferencias significativas en el valor medio de CMI obtenido en los diferentes genotipos mayoritarios. Concretamente E7b, E8b y E20 presentan CMI significativamente más altas con respecto a tigeciclina, vancomicina y linezolid, respectivamente, en relación a los pulsotipos más sensibles. Además el perfil E8b muestra un mayor número de cepas con sensibilidad disminuida a vancomicina (SDV) (CMI entre 1 y 2 mg/L) que los clones E10 y E8a, de manera significativa. Creemos que esta información puede resultar útil en la vigilancia de la sensibilidad antibiótica de SARM en nuestro medio, para evitar tratamientos inadecuados y/o futuras resistencias (AU)

Situación actual de la infección por Staphylococcus aureus resistente a meticilina en Extremadura: sensibilidad, clonalidad, y protagonismo de la adquisición extrahospitalaria / State of infection caused by methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) in Extremadura: susceptibility, clonality and role of community-associated MRSA

La correcta vigilancia y control de la infección por Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SARM) pasa por el conocimiento actualizado de las propiedades específicas que la caracterizan en cada lugar. El objetivo de este trabajo es describir las características actuales de la infección por SARM en Extremadura. Durante el año 2010 se recogieron 309 SARM, procedentes de muestras clínicas en nuestra comunidad. A cada uno de los aislados se le realizó un estudio de sensibilidad que engloba 17 antibióticos, ensayados mediante tarjeta AST-588 Vitek 2® y método E-test. Además se genotipa mediante Electroforesis en Campo Pulsado (PFGE) una muestra de 100 cepas, escogidas por muestreo aleatorio estratificado. Se obtienen los siguientes resultados: la prevalencia de SARM en Extremadura es 20,2%. Don Benito-Villanueva es el área con mayor prevalencia y una de las de mayor incidencia. Mérida presenta la situación más favorable, con ratios relativamente bajos de prevalencia e incidencia. La adquisición extrahospitalaria alcanza el 44% en la región, mostrando claro predominio en las áreas de menor población (Navalmoral de la Mata y Coria). El patrón de multirresistencia más frecuente es tobramicina-levofloxacino-eritromicina (44%), seguido de tobramicina-eritromicina-clindamicina (20%). No se obtienen cepas resistentes a linezolid, daptomicina o tigeciclina, sin embargo el 42% presentan sensibilidad disminuida a vancomicina. El análisis por PFGE revela la existencia de 27 genotipos, con 3 genotipos mayoritarios: E8a (25%), E7b (17%) y E7a (12%). El estudio estadístico post-hoc, no revela diferencias significativas en la distribución de genotipos entre las diferentes áreas, pero si algunas tendencias que deben tenerse en consideración (AU)

The correct surveillance and control of infection caused by methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) needs of update knowledge of its specific properties in each place. Our study aims to describe the current characteristics of infection due to MRSA in Extremadura. During 2010, 309 MRSA were collected from clinical samples in our region. A susceptibility test that included 17 antibiotics tested by AST -588 card Vitek 2 ® and E -test method was performed on all isolates. A sample of 100 strains, selected by stratified random sampling, were genotyped by pulsed field electrophoresis (PFGE). The prevalence of MRSA in Extremadura was 20.2%. Don Benito-Villanueva area showed the most prevalence and a higher incidence. Merida reported the most favourable situation, with a relatively low ratios of prevalence and incidence. The community acquired reached 44 % in the region, showing predominantly in less populated areas (Navalmoral and Coria). The most common multiresistant pattern was tobramycin-levofloxacin-erythromycin (44%), followed tobramycin-erythromycin-clindamycin (20%). No linezolid, daptomycin and tigecycline resistant strains were observed, but 42 % of the MRSA strains showed decreased susceptibility vancomycin (DSV). PFGE analysis reported 27 genotypes, with 3 major genotypes: E8a (25%), E7b (17%) and E7a (12%). The post-hoc statistical analysis did not reveal significant differences in the distribution of genotypes between different areas. However it revealed some trends that should be considered (AU)