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Sci Rep ; 11(1): 21705, 2021 11 04.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34737331

RESUMO

RNA-seq has matured and become an important tool for studying RNA biology. Here we compared two RNA-seq (MGI DNBSEQ and Illumina NextSeq 500) and two microarray platforms (GeneChip Human Transcriptome Array 2.0 and Illumina Expression BeadChip) in healthy individuals administered recombinant human erythropoietin for transcriptome-wide quantification of differential gene expression. The results show that total RNA DNB-seq generated a multitude of target genes compared to other platforms. Pathway enrichment analyses revealed genes correlate to not only erythropoiesis and oxygen transport but also a wide range of other functions, such as tissue protection and immune regulation. This study provides a knowledge base of genes relevant to EPO biology through cross-platform comparisons and validation.


Assuntos
Perfilação da Expressão Gênica/métodos , Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos/métodos , Análise de Sequência de RNA/métodos , Eritropoese/genética , Eritropoetina/genética , Expressão Gênica/genética , Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos , Humanos , RNA/genética , RNA-Seq/métodos , Transcriptoma/genética
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