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Structure ; 21(3): 365-75, 2013 Mar 05.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-23415559

RESUMO

NusG is a conserved regulatory protein interacting with RNA polymerase (RNAP) and other proteins to form multicomponent complexes that modulate transcription. The crystal structure of Thermotoga maritima NusG (TmNusG) shows a three-domain architecture, comprising well-conserved amino-terminal (NTD) and carboxy-terminal (CTD) domains with an additional, species-specific domain inserted into the NTD. NTD and CTD directly contact each other, occluding a surface of the NTD for binding to RNAP and a surface on the CTD interacting either with transcription termination factor Rho or transcription antitermination factor NusE. NMR spectroscopy confirmed the intramolecular NTD-CTD interaction up to the optimal growth temperature of Thermotoga maritima. The domain interaction involves a dynamic equilibrium between open and closed states and contributes significantly to the overall fold stability of the protein. Wild-type TmNusG and deletion variants could not replace endogenous Escherichia coli NusG, suggesting that the NTD-CTD interaction of TmNusG represents an autoinhibited state.


Assuntos
Proteínas de Bactérias/química , Proteínas de Escherichia coli/química , Fatores de Alongamento de Peptídeos/química , Thermotoga maritima/química , Fatores de Transcrição/química , Proteínas de Bactérias/genética , Sítios de Ligação , Cristalografia por Raios X , RNA Polimerases Dirigidas por DNA/química , RNA Polimerases Dirigidas por DNA/genética , Escherichia coli/química , Escherichia coli/genética , Escherichia coli/crescimento & desenvolvimento , Proteínas de Escherichia coli/genética , Teste de Complementação Genética , Simulação de Dinâmica Molecular , Fatores de Alongamento de Peptídeos/genética , Ligação Proteica , Domínios e Motivos de Interação entre Proteínas , Estabilidade Proteica , Estrutura Secundária de Proteína , Proteínas Recombinantes/química , Proteínas Recombinantes/genética , Fator Rho/química , Fator Rho/genética , Proteínas Ribossômicas/química , Proteínas Ribossômicas/genética , Especificidade da Espécie , Relação Estrutura-Atividade , Thermotoga maritima/genética , Fatores de Transcrição/genética
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