RESUMO
BACKGROUND: HOXA1 is a prognostic marker and a potential predictive biomarker for radioresistance in head and neck tumors. Its overexpression has been associated with promoter methylation and a worse prognosis in oral squamous cell carcinoma (OSCC) patients. However, opposite outcomes are also described. The effect of the methylation of this gene on different gene regions, other than the promoter, remains uncertain. We investigated the methylation profile at different genomic regions of HOXA1 in OSCC and correlated differentially methylated CpG sites with clinicopathological data. METHODS: The HOXA1 DNA methylation status was evaluated by analyzing data from The Cancer Genome Atlas and three Gene Expression Omnibus datasets. Significant differentially methylated CpG sites were considered with a |∆ß| ≥ 0.10 and a Bonferroni-corrected p-value < 0.01. Differentially methylated CpGs were validated by pyrosequencing using two independent cohorts of 15 and 47 OSCC patients, respectively. RESULTS: Compared to normal tissues, we found significantly higher DNA methylation levels in the 3'UTR region of HOXA1 in OSCC. Higher methylation levels in tumor samples were positively correlated with smoking habits and patients' overall survival. CONCLUSIONS: Our findings suggest that HOXA1 gene body methylation is a promising prognostic biomarker for OSCC with potential clinical applications in patient monitoring.
RESUMO
The need for new teaching-learning strategies stems from the great change society is going through. The so-called digital natives are part of a generation that lives in a hyperactive rhythm making it increasingly difficult to adapt to traditional classrooms. In Dentistry Courses, new strategies and pedagogical tools have been used, suchas active learning methodologies. In this context, the Discipline of Histology of the Dentistry Course has been proposing the use of some innovative pedagogical strategies. This work will present the experience with team-based learning (TBL), which articulates individual (iRAT) and group activities (gRAT), stimulates the application of concepts and can articulate with other methodologies such as flipped classroom, case study and problematization. This study alsoanalysedstudents' performance in iRAT and gRAT with the application of TBLand discussed the results achieved. Itwas conducted by analysingthe scoresof 240 first-year students of the Histology course in 2016, 2017 and 2018. Student scores, individually and in groups, were statistically analysedby the paired student t-test. Comparisons were made between the iRAT and gRAT activities about gender and the full-time and night classes by the one-way ANOVA and Kruskal-Wallis test. All students obtained higher group scores when compared to individual test results (p <0.001). There was no significant difference between sexes and study period. Group performanceexceeds individual performance. From this, it can be inferred that TBL can be a good strategy to use in dentistry, as an interaction between students leads to higher performance and problem-solving capacity (AU).
A necessidade de novas estratégias de ensino-aprendizagem decorre da grande mudança pela qual a sociedade está passando. Os chamados nativos digitais fazem parte de uma geração que vive em um ritmo hiperativo tornando cada vez mais difícil a adaptação às salas de aula tradicionais. Nos cursos de Odontologia, novas estratégias e ferramentas pedagógicas têm sido utilizadas, como metodologias ativas de aprendizagem. Nesse contexto, a Disciplina de Histologia do Curso de Odontologia tem proposto a utilização de algumas estratégias pedagógicas inovadoras. Este trabalho apresentará a experiência com a aprendizagem baseada em equipe (TBL), que articula atividades individuais (iRAT) e em grupo (gRAT), estimula a aplicação de conceitos e pode se articular com outras metodologias como aula invertida, estudo de caso e problematização. Este estudo também analisou o desempenho dos alunos no iRAT egRAT com a aplicação da TBL e discutiu os resultados alcançados. Foi realizado por meio da análise das notas de 240 alunos do primeiro ano do curso de Histologia em 2016, 2017 e 2018. As notas dos alunos, individualmente e em grupos, foram analisadas estatisticamente por meio do teste t-student pareado. As comparações foram feitas entre as atividades iRAT e gRAT sobre gênero e as aulas em período integral e noturno pelo teste ANOVA one waye teste de Kruskal-Wallis. Todos os alunos obtiveram pontuações mais altas do grupo quando comparados aos resultados dos testes individuais (p <0,001). Não houve diferença significativa entre os sexos e o período de estudo. O desempenho do grupo excede o desempenho individual. A partir disso, pode-se inferirque o TBL pode ser uma boa estratégia para uso em odontologia, pois uma interação entre os alunos leva a um maior desempenho e capacidade de resolução de problemas (AU).
Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Adolescente , Adulto , Estudantes de Odontologia , Aprendizagem Baseada em Problemas/métodos , Educação em Odontologia , Histologia , Brasil , Análise de Variância , Estatísticas não Paramétricas , Difusão de InovaçõesRESUMO
O carcinoma de células escamosas bucal (CCEB) apresenta alterações epigenéticas, como a metilação de DNA, na região promotora de genes supressores de tumor (GST), mas pouco se sabe em relação a outras regiões gênicas. Este estudo teve como objetivo investigar o perfil de metilação de diferentes regiões de um grupo de GSTs, validar dados significativos por meio de análises in silico e experimental, e correlacionar estes achados aos dados clínicopatológicos dos pacientes. Na plataforma HumanMethylation450 Beadchip, foram utilizadas 53 amostras de CCEB e 53 de tecidos não-neoplásicos adjacentes ao tumor (TA). O nível de metilação destes tecidos foram comparados considerando ∆ß ≤ -0,10 ou ≥ 0,10, p < 0,01 e FDR < 0,01. Os resultados obtidos foram validados no TCGA e por pirosequenciamento utilizando 15 amostras independentes de CCEB e 15 TA. Os genes BRCA1, FHIT, MGMT, RASSF1 e RUNX3 apresentaram sítios hipermetilados na região promotora, 5'UTR e/ou 1º éxon, enquanto CDH13, DAPK1, HOXA1, PDLIM4, RARB, TIMP3, TP73 e VHL mostraram hipermetilação no corpo gênico e/ou 3'UTR. Foram identificados sítios diferencialmente metilados entre o CCEB e TA para os genes BRCA1, FHIT e HOXA1. Na validação experimental, apenas o sítio CpG na região 3'UTR do gene HOXA1 mostrou diferença significativa (p < 0,01) entre o CCEB e TA, 55,5% e 36,9% respectivamente, estando sua metilação e maior expressão (FC = 10,58) positivamente correlacionada à carga tabágica (p = 0,04) e recidiva (p = 0,03). A análise in silico utilizada mostrou-se efetiva na identificação dos alvos e comparação entre os grupos. A metilação de diferentes regiões de genes supressores de tumor é um evento frequente no CCEB, entretanto pouca diferença é encontrada entre o perfil de metilação tumoral e as margens da lesão. A metilação do sítio CpG na região 3'UTR do HOXA1 em CCEB está correlacionada a expressão aberrante deste gene e maiores episódios de recorrência(AU)
Oral squamous cell carcinoma (OSCC) presents epigenetic changes, such as DNA methylation, in tumor suppressor genes (GST) promoter regions, but little is known about other gene regions. This study aimed to investigate the methylation profile of different regions of a group of GSTs, to validate significant data through in silico and experimental analyzes, and to correlate these findings with the patients' clinical-pathological data. In the HumanMethylation450 Beadchip platform, 53 samples of CCEB and 53 of non-neoplastic tissues adjacent to the tumor (AT) were used. The methylation level of these tissues was compared considering ∆ß ≤ -0.10 or ≥ 0.10, p <0.01 and FDR < 0.01. The results obtained were validated at TCGA and by pyrosquencing using 15 independent samples of CCEB and 15 TA. The BRCA1, FHIT, MGMT, RASSF1 and RUNX3 genes showed hypermethylated sites in the promoter region, 5'UTR and / or 1st exon, while CDH13, DAPK1, HOXA1, PDLIM4, RARB, TIMP3, TP73 and VHL showed hypermethylation in the gene body and / or 3'UTR. Differently methylated sites were identified between the OSCC and AT for the BRCA1, FHIT and HOXA1 genes. In experimental validation, only the CpG site in the 3'UTR region of the HOXA1 gene showed a significant difference (p < 0.01) between OSCC and AT, 55.5% and 36.9% respectively, with its methylation and greater expression ( FC = 10.58) positively correlated with smoking burden (p = 0.04) and recurrence (p = 0.03). The in silico analysis used was effective in identifying the targets and comparing the groups. Methylation of different regions of GST is a frequent event in the OSCC, however little difference is found between the tumor methylation profile and the lesion margins. Methylation of the CpG site in the 3'UTR region of HOXA1 in CCEB is correlated with the aberrant expression of this gene and with greater recurrence episodes(AU)