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Comput Math Methods Med ; 2018: 5490513, 2018.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-29666661

RESUMO

The selection of feature genes with high recognition ability from the gene expression profiles has gained great significance in biology. However, most of the existing methods have a high time complexity and poor classification performance. Motivated by this, an effective feature selection method, called supervised locally linear embedding and Spearman's rank correlation coefficient (SLLE-SC2), is proposed which is based on the concept of locally linear embedding and correlation coefficient algorithms. Supervised locally linear embedding takes into account class label information and improves the classification performance. Furthermore, Spearman's rank correlation coefficient is used to remove the coexpression genes. The experiment results obtained on four public tumor microarray datasets illustrate that our method is valid and feasible.


Assuntos
Biologia Computacional , Perfilação da Expressão Gênica , Modelos Lineares , Neoplasias/genética , Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos , Análise Serial de Tecidos , Algoritmos , Teorema de Bayes , Interpretação Estatística de Dados , Bases de Dados Genéticas , Reações Falso-Positivas , Humanos , Reprodutibilidade dos Testes , Software
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