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J Mol Biol ; 426(13): 2500-19, 2014 Jun 26.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-24768993

RESUMO

Misfolded protein aggregates, characterized by a canonical amyloid fold, play a central role in the pathobiology of neurodegenerative diseases. Agents that bind and sequester neurotoxic intermediates of amyloid assembly, inhibit the assembly or promote the destabilization of such protein aggregates are in clinical testing. Here, we show that the gene 3 protein (g3p) of filamentous bacteriophage mediates potent generic binding to the amyloid fold. We have characterized the amyloid binding and conformational remodeling activities using an array of techniques, including X-ray fiber diffraction and NMR. The mechanism for g3p binding with amyloid appears to reflect its physiological role during infection of Escherichia coli, which is dependent on temperature-sensitive interdomain unfolding and cis-trans prolyl isomerization of g3p. In addition, a natural receptor for g3p, TolA-C, competitively interferes with Aß binding to g3p. NMR studies show that g3p binding to Aß fibers is predominantly through middle and C-terminal residues of the Aß subunit, indicating ß strand-g3p interactions. A recombinant bivalent g3p molecule, an immunoglobulin Fc (Ig) fusion of the two N-terminal g3p domains, (1) potently binds Aß fibers (fAß) (KD=9.4nM); (2); blocks fAß assembly (IC50~50nM) and (3) dissociates fAß (EC50=40-100nM). The binding of g3p to misfolded protein assemblies is generic, and amyloid-targeted activities can be demonstrated using other misfolded protein systems. Taken together, our studies show that g3p(N1N2) acts as a general amyloid interaction motif.


Assuntos
Peptídeos beta-Amiloides/química , Peptídeos beta-Amiloides/metabolismo , Bacteriófago M13/metabolismo , Proteínas do Capsídeo/química , Proteínas do Capsídeo/metabolismo , Proteínas da Membrana Bacteriana Externa/química , Proteínas da Membrana Bacteriana Externa/metabolismo , Bacteriófago M13/genética , Proteínas do Capsídeo/genética , Proteínas de Escherichia coli/química , Proteínas de Escherichia coli/metabolismo , Humanos , Cinética , Proteínas de Membrana Transportadoras/química , Proteínas de Membrana Transportadoras/metabolismo , Modelos Moleculares , Doenças Neurodegenerativas/etiologia , Doenças Neurodegenerativas/metabolismo , Ligação Proteica , Conformação Proteica , Dobramento de Proteína , Domínios e Motivos de Interação entre Proteínas , Multimerização Proteica , Proteínas Recombinantes de Fusão/química , Proteínas Recombinantes de Fusão/genética , Proteínas Recombinantes de Fusão/metabolismo , alfa-Sinucleína/química , alfa-Sinucleína/metabolismo , Proteínas tau/química , Proteínas tau/metabolismo
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