RESUMO
OBJECTIVE: To describe the genotypes of the carbapenemases reported from microbiological isolates of patients in Peru. METHODS: A systematic search of the biomedical literature about carbapenemases with genotypic confirmation was carried out. It included literature published from 1 January 2000 through 15 September 2019 in the PubMed, SCOPUS, Virtual Health Library, CONCYTEC Virtual Library, and Google Scholar databases, and other sources for the publication of abstracts or posters from national or international meetings. Two reviewers carried out the data selection and extraction. RESULTS: Fourteen studies, which carried out the genotypic characterization of 313 carbapenemases, were included. Of the total 313 reports, 103 analyzed enterobacteria: 74 were of Klebsiella pneumoniae, 11 of Proteus mirabilis, 7 of Enterobacter cloacae, and 11 of other enterobacteria; and 61 corresponded to bla NDM , 39 to bla KPC, and 3 to bla IMP . According to their molecular structure, 64 were metallo-ß-lactamases and 39 were serine-ß-lactamases. Of the total reports, 84 analyzed Pseudomonas aeruginosa: 79 corresponded to bla IMP , 4 to bla VIM , and 1 to bla GES. Of the total reports, 126 analyzed Acinetobacter baumannii: 55 corresponded to bla OXA-23 , 66 to bla OXA-24 , 3 to bla NDM, and 2 to bla OXA-143 . CONCLUSIONS: There is a limited number of publications about carbapenemases among patients in Peru. The genotype reports come primarily from hospitals in the country's capital. This is the first review that aims to identify the types of carbapenemases reported in enterobacteria, P. aeruginosa, and A. baummani.
OBJETIVO: Descrever os genótipos das carbapenemases relatadas a partir de isolados microbiológicos de pacientes no Peru. MÉTODOS: Fizemos uma pesquisa sistemática da literatura biomédica publicada de 1º de janeiro de 2000 a 15 de setembro de 2019 nas bases de dados PubMed, SCOPUS, Biblioteca Virtual de Saúde, Biblioteca Virtual CONCYTEC, Google Scholar e outras fontes de publicações de resumos ou pôsteres em conferências nacionais ou internacionais sobre carbapenemases com confirmação genotípica; a seleção e extração de dados foi feita por pares. RESULTADOS: Incluímos 14 estudos nos quais foi feita a caracterização genotípica de 313 carbapenemases. Ao todo, 103 destes relatos vieram de testes efetuados em enterobactérias; destes, 74 foram em Klebsiella pneumoniae, 11 em Proteus mirabilis, 7 em Enterobacter cloacae e 11 em outros organismos. Destes 103 relatos, 61 correspondem a bla NDM, 39 a bla KPC e 3 a bla IMP. Segundo a estrutura molecular, 64 foram metalo-betalactamases e 39 foram serino-betalactamases. Foram incluídos 84 relatos sobre Pseudomonas aeruginosa, dos quais 79 corresponderam a bla IMP, 4 a bla VIM e 1 a bla GES. Também houve 126 relatos sobre Acinetobacter baumannii, dos quais 55 corresponderam a bla OXA-23, 66 a bla OXA-24, 3 a bla NDM e 2 a bla OXA-143. CONCLUSÕES: Existem poucas publicações sobre carbapenemases em pacientes no Peru; os relatos genotípicos provêm, em sua maioria, de hospitais da capital do país. Esta é a primeira revisão que procura estabelecer os tipos de carbapenemases relatadas em enterobactérias, P. aeruginosa e A. baumannii.
RESUMO
[RESUMEN]. Objetivo. Describir los genotipos de las carbapenemasas reportadas de aislamientos microbiológicos de pacientes en Perú. Métodos. Se realizó una búsqueda sistemática de la literatura biomédica publicada desde el 1 enero de 2000 hasta el 15 de setiembre de 2019 en las bases de datos PubMed, SCOPUS, Biblioteca Virtual de Salud, Biblioteca Virtual de CONCYTEC, Google Scholar y otras fuentes de publicaciones de resúmenes o póster en congresos nacionales o internacionales sobre carbapenemasas con confirmación genotípica; la selección y extracción de datos fue por pares. Resultados. Se incluyeron 14 estudios en los que se realizó la caracterización genotípica de 313 carbapenemasas. Ciento tres de estos reportes pertenecían a estudios efectuados en enterobacterias; de estos, 74 fueron en Klebsiella pneumoniae, 11 en Proteus mirabilis, 7 en Enterobacter cloacae y 11 en otras. Sesenta y una de estas 103 corresponden a blaNDM, 39 a blaKPC y 3 a blaIMP. Según su estructura molecular, 64 son metalobetalactamasas y 39 son serinbetalactamasas. En Pseudomonas aeruginosa se incluyeron 84 reportes, 79 corresponden a blaIMP, 4 a blaVIM, y 1 a blaGES. En Acinetobacter baumannii 126 reportes, 55 corresponden a blaOXA-23, 66 a blaOXA24, 3 a blaNDM y 2 a blaOXA-143. Conclusiones. Existe un número escaso de publicaciones respecto a carbapenemasas de pacientes en Perú; los reportes genotípicos provienen en su mayoría de hospitales de la capital del país. Esta es la primera revisión que intenta conocer los tipos de carbapenemasas reportadas en enterobacterias, P. aeruginosa y A. baumannii.
[ABSTRACT]. Objective. To describe the genotypes of the carbapenemases reported from microbiological isolates of patients in Peru. Methods. A systematic search of the biomedical literature about carbapenemases with genotypic confirmation was carried out. It included literature published from 1 January 2000 through 15 September 2019 in the PubMed, SCOPUS, Virtual Health Library, CONCYTEC Virtual Library, and Google Scholar databases, and other sources for the publication of abstracts or posters from national or international meetings. Two reviewers carried out the data selection and extraction. Results. Fourteen studies, which carried out the genotypic characterization of 313 carbapenemases, were included. Of the total 313 reports, 103 analyzed enterobacteria: 74 were of Klebsiella pneumoniae, 11 of Proteus mirabilis, 7 of Enterobacter cloacae, and 11 of other enterobacteria; and 61 corresponded to blaNDM, 39 to blaKPC, and 3 to blaIMP. According to their molecular structure, 64 were metallo-ß-lactamases and 39 were serine-ß-lactamases. Of the total reports, 84 analyzed Pseudomonas aeruginosa: 79 corresponded to blaIMP, 4 to blaVIM, and 1 to blaGES. Of the total reports, 126 analyzed Acinetobacter baumannii: 55 corresponded to blaOXA-23, 66 to blaOXA-24, 3 to blaNDM, and 2 to blaOXA-143. Conclusions. There is a limited number of publications about carbapenemases among patients in Peru. The genotype reports come primarily from hospitals in the country’s capital. This is the first review that aims to identify the types of carbapenemases reported in enterobacteria, P. aeruginosa, and A. baummani.
[RESUMO]. Objetivo. Descrever os genótipos das carbapenemases relatadas a partir de isolados microbiológicos de pacientes no Peru. Métodos. Fizemos uma pesquisa sistemática da literatura biomédica publicada de 1º de janeiro de 2000 a 15 de setembro de 2019 nas bases de dados PubMed, SCOPUS, Biblioteca Virtual de Saúde, Biblioteca Virtual CONCYTEC, Google Scholar e outras fontes de publicações de resumos ou pôsteres em conferências nacionais ou internacionais sobre carbapenemases com confirmação genotípica; a seleção e extração de dados foi feita por pares. Resultados. Incluímos 14 estudos nos quais foi feita a caracterização genotípica de 313 carbapenemases. Ao todo, 103 destes relatos vieram de testes efetuados em enterobactérias; destes, 74 foram em Klebsiella pneumoniae, 11 em Proteus mirabilis, 7 em Enterobacter cloacae e 11 em outros organismos. Destes 103 relatos, 61 correspondem a blaNDM, 39 a blaKPC e 3 a blaIMP. Segundo a estrutura molecular, 64 foram metalobetalactamases e 39 foram serino-betalactamases. Foram incluídos 84 relatos sobre Pseudomonas aeruginosa, dos quais 79 corresponderam a blaIMP, 4 a blaVIM e 1 a blaGES. Também houve 126 relatos sobre Acinetobacter baumannii, dos quais 55 corresponderam a blaOXA-23, 66 a blaOXA-24, 3 a blaNDM e 2 a blaOXA-143. Conclusões. Existem poucas publicações sobre carbapenemases em pacientes no Peru; os relatos genotípicos provêm, em sua maioria, de hospitais da capital do país. Esta é a primeira revisão que procura estabelecer os tipos de carbapenemases relatadas em enterobactérias, P. aeruginosa e A. baumannii.
Assuntos
Enterobacteriaceae , Pseudomonas aeruginosa , Acinetobacter baumannii , Resistência beta-Lactâmica , Enterobacteriáceas Resistentes a Carbapenêmicos , Peru , beta-Lactamases , Enterobacteriáceas Resistentes a Carbapenêmicos , beta-Lactamases , Peru , Enterobacteriáceas Resistentes a CarbapenêmicosRESUMO
The global spread of carbapenemases is a significant public health concern. The aim of this report is to describe the presence of KPC-type carbapenem-resistant genes and enterobacteria isolated in 12 hospitals and forwarded to the Peruvian National Institute of Health's National Infection Reference Laboratory during the period between 2013 and 2017. The strains were identified by conventional methods; antimicrobial resistance was determined by phenotypic and biochemical methods. The presence of resistant genes was detected by conventional PCR. Eighty-three (83) strains harboring carbapenemases were identified: 26 (31.3%) carrying the blaKPC gene, 56 (67.5%) the blaNDM gene, and one strain (1.2%) with the blaIMP gene. This is the first report that shows the circulating carbapenemases genes in Hospitals in Peru of cases submitted for their confirmation to the National Reference Laboratory, so it is necessary to improve the surveillance to better understand their situation in our country.
La diseminación global de carbapenemasas es de importancia en la salud pública. El objetivo del estudio es describir la presencia de genes de resistencia a carbapenémicos tipo KPC y metalobetalactamasas en enterobacterias aisladas de 12 hospitales y remitidos al Laboratorio de Referencia Nacional de Infecciones Intrahospitalarias del Instituto Nacional de Salud de Perú durante los años 2013 al 2017. Las cepas fueron identificadas por métodos convencionales, la resistencia antimicrobiana fue determinada por métodos fenotípicos, bioquímicos y la presencia de genes de resistencia, se detectaron por PCR convencional. Se identificaron 83 cepas con carbapenemasas: 26 (31,3 %) portando el gen blaKPC, 56 (67,5 %) el gen blaNDM y una (1,2 %) cepa con el gen blaIMP. Es el primer reporte que da a conocer los genes de carbapenemasas circulantes en hospitales de Perú, por lo que se requiere mejorar la vigilancia para tener un mejor conocimiento de la situación en Perú.
Assuntos
Carbapenêmicos/farmacologia , Farmacorresistência Bacteriana/genética , Enterobacteriaceae/efeitos dos fármacos , Enterobacteriaceae/genética , Proteínas de Bactérias/genética , Enterobacteriaceae/enzimologia , Hospitais , Humanos , Peru , Fatores de Tempo , beta-Lactamases/genéticaRESUMO
RESUMEN La diseminación global de carbapenemasas es de importancia en la salud pública. El objetivo del estudio es describir la presencia de genes de resistencia a carbapenémicos tipo KPC y metalobetalactamasas en enterobacterias aisladas de 12 hospitales y remitidos al Laboratorio de Referencia Nacional de Infecciones Intrahospitalarias del Instituto Nacional de Salud de Perú durante los años 2013 al 2017. Las cepas fueron identificadas por métodos convencionales, la resistencia antimicrobiana fue determinada por métodos fenotípicos, bioquímicos y la presencia de genes de resistencia, se detectaron por PCR convencional. Se identificaron 83 cepas con carbapenemasas: 26 (31,3 %) portando el gen blaKPC, 56 (67,5 %) el gen blaNDM y una (1,2 %) cepa con el gen blaIMP. Es el primer reporte que da a conocer los genes de carbapenemasas circulantes en hospitales de Perú, por lo que se requiere mejorar la vigilancia para tener un mejor conocimiento de la situación en Perú.
ABSTRACT The global spread of carbapenemases is a significant public health concern. The aim of this report is to describe the presence of KPC-type carbapenem-resistant genes and enterobacteria isolated in 12 hospitals and forwarded to the Peruvian National Institute of Health's National Infection Reference Laboratory during the period between 2013 and 2017. The strains were identified by conventional methods; antimicrobial resistance was determined by phenotypic and biochemical methods. The presence of resistant genes was detected by conventional PCR. Eighty-three (83) strains harboring carbapenemases were identified: 26 (31.3%) carrying the blaKPC gene, 56 (67.5%) the blaNDM gene, and one strain (1.2%) with the blaIMP gene. This is the first report that shows the circulating carbapenemases genes in Hospitals in Peru of cases submitted for their confirmation to the National Reference Laboratory, so it is necessary to improve the surveillance to better understand their situation in our country.
Assuntos
Humanos , Carbapenêmicos/farmacologia , Farmacorresistência Bacteriana/genética , Enterobacteriaceae/efeitos dos fármacos , Enterobacteriaceae/genética , Peru , Fatores de Tempo , Proteínas de Bactérias/genética , beta-Lactamases/genética , Enterobacteriaceae/enzimologia , HospitaisRESUMO
El presente documento detalla: Introducción, generalidades, medidas de bioseguridad, procedimientos de obtención de muestra, envio y transporte de muestra, bibliografía(AU)
Assuntos
Infecção Hospitalar , Técnicas Bacteriológicas , PeruRESUMO
El presente documento detalla: Introducción, generalidades, medidas de bioseguridad, procedimientos de obtención de muestra, envio y transporte de muestra, bibliografía
