Diversity and genetic structure of mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), a fruit species from Cerrado / Diversidade e estrutura genética de mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), uma fruteira do Cerrado

Hancornia speciosa Gomes, popularly known as mangabeira, is a fruit tree belonging to the Apocynaceae family, native to the Brazilian Cerrado. The fruit is widely used by the local population as an alternative source of income. Limited information is available about this species, which increases the difficulty of conserving its genetic resources and exploiting mangabeira as an economic resource. The objective of this research was to evaluate the genetic diversity and genetic structure of H. speciosa from Chapada dos Guimarães. Twenty-four trees and ten inter simple sequence repeats (ISSR) primers were evaluated. Of the 57 bands obtained, 33 (57.89%) presented polymorphism. The analysis using Structure defined two different clusters (K = 2), which were consistent with the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) clustering analysis. The number of observed alleles (Na = 1.58), number of effective alleles (Ne = 1.29), Neis genetic distance (He = 0.18) and Shannon index (I = 0.27) were considered low among the population. The analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the variability within the cluster (83.39%) was higher than among clusters (16.61%). ISSR primers proved effective for detection of genetic polymorphism in H. speciosa, and could be utilized for strategies that aim at conservation, plant breeding programs, and commercial use.(AU)

Hancornia speciosa Gomes, conhecida popularmente como mangabeira, é uma fruteira pertencente à família Apocynaceae que ocorre espontaneamente no Cerrado brasileiro. O fruto da mangabeira é bastante utilizado pela população local como fonte alternativa de renda e sua exploração é feita de forma extrativista. As informações sobre esta espécie são escassas, o que dificulta a conservação dos recursos genéticos e sua exploração econômica. Neste trabalho foi estudada a diversidade e estrutura genética de uma população de mangabeira, tendo sido avaliada um total de 24 árvores matrizes localizadas em Chapada dos Guimarães-MT por meio de 10 primers ISSR (inter repetições de sequências simples) que revelaram 57 bandas. Destas, 33 (57,89%) apresentaram polimorfismo. A análise utilizando o Structure definiu dois grupos diferentes (K = 2), resultados que foram consistentes com os da análise de agrupamento UPGMA. O número de alelos observados (Na = 1,58), número de alelos efetivos (Ne = 1,29), índice de diversidade de Nei (He = 0,18) e o índice de Shannon (I = 0,27) foram relativamente baixos dentro da população. A AMOVA revelou que a variabilidade dentro dos grupos (83,39%) foi mais alta do que entre os grupos (16,61%). A utilização de iniciadores ISSR mostrou-se eficaz para detecção de polimorfismo genético em mangabeira, servindo de aporte para estratégias que visem à conservação, melhoramento genético e exploração econômica da espécie.(AU)

Diversity and genetic structure of mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), a fruit species from Cerrado / Diversidade e estrutura genética de mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), uma fruteira do Cerrado

Hancornia speciosa Gomes, popularly known as mangabeira, is a fruit tree belonging to the Apocynaceae family, native to the Brazilian Cerrado. The fruit is widely used by the local population as an alternative source of income. Limited information is available about this species, which increases the difficulty of conserving its genetic resources and exploiting mangabeira as an economic resource. The objective of this research was to evaluate the genetic diversity and genetic structure of H. speciosa from Chapada dos Guimarães. Twenty-four trees and ten inter simple sequence repeats (ISSR) primers were evaluated. Of the 57 bands obtained, 33 (57.89%) presented polymorphism. The analysis using Structure defined two different clusters (K = 2), which were consistent with the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) clustering analysis. The number of observed alleles (Na = 1.58), number of effective alleles (Ne = 1.29), Neis genetic distance (He = 0.18) and Shannon index (I = 0.27) were considered low among the population. The analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the variability within the cluster (83.39%) was higher than among clusters (16.61%). ISSR primers proved effective for detection of genetic polymorphism in H. speciosa, and could be utilized for strategies that aim at conservation, plant breeding programs, and commercial use.

Hancornia speciosa Gomes, conhecida popularmente como mangabeira, é uma fruteira pertencente à família Apocynaceae que ocorre espontaneamente no Cerrado brasileiro. O fruto da mangabeira é bastante utilizado pela população local como fonte alternativa de renda e sua exploração é feita de forma extrativista. As informações sobre esta espécie são escassas, o que dificulta a conservação dos recursos genéticos e sua exploração econômica. Neste trabalho foi estudada a diversidade e estrutura genética de uma população de mangabeira, tendo sido avaliada um total de 24 árvores matrizes localizadas em Chapada dos Guimarães-MT por meio de 10 primers ISSR (inter repetições de sequências simples) que revelaram 57 bandas. Destas, 33 (57,89%) apresentaram polimorfismo. A análise utilizando o Structure definiu dois grupos diferentes (K = 2), resultados que foram consistentes com os da análise de agrupamento UPGMA. O número de alelos observados (Na = 1,58), número de alelos efetivos (Ne = 1,29), índice de diversidade de Nei (He = 0,18) e o índice de Shannon (I = 0,27) foram relativamente baixos dentro da população. A AMOVA revelou que a variabilidade dentro dos grupos (83,39%) foi mais alta do que entre os grupos (16,61%). A utilização de iniciadores ISSR mostrou-se eficaz para detecção de polimorfismo genético em mangabeira, servindo de aporte para estratégias que visem à conservação, melhoramento genético e exploração econômica da espécie.

Diversity and genetic structure of mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), a fruit species from Cerrado / Diversidade e estrutura genética de mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), uma fruteira do Cerrado

Hancornia speciosa Gomes, popularly known as mangabeira, is a fruit tree belonging to the Apocynaceae family, native to the Brazilian Cerrado. The fruit is widely used by the local population as an alternative source of income. Limited information is available about this species, which increases the difficulty of conserving its genetic resources and exploiting mangabeira as an economic resource. The objective of this research was to evaluate the genetic diversity and genetic structure of H. speciosa from Chapada dos Guimarães. Twenty-four trees and ten inter simple sequence repeats (ISSR) primers were evaluated. Of the 57 bands obtained, 33 (57.89%) presented polymorphism. The analysis using Structure defined two different clusters (K = 2), which were consistent with the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) clustering analysis. The number of observed alleles (Na = 1.58), number of effective alleles (Ne = 1.29), Neis genetic distance (He = 0.18) and Shannon index (I = 0.27) were considered low among the population. The analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the variability within the cluster (83.39%) was higher than among clusters (16.61%). ISSR primers proved effective for detection of genetic polymorphism in H. speciosa, and could be utilized for strategies that aim at conservation, plant breeding programs, and commercial use.

Hancornia speciosa Gomes, conhecida popularmente como mangabeira, é uma fruteira pertencente à família Apocynaceae que ocorre espontaneamente no Cerrado brasileiro. O fruto da mangabeira é bastante utilizado pela população local como fonte alternativa de renda e sua exploração é feita de forma extrativista. As informações sobre esta espécie são escassas, o que dificulta a conservação dos recursos genéticos e sua exploração econômica. Neste trabalho foi estudada a diversidade e estrutura genética de uma população de mangabeira, tendo sido avaliada um total de 24 árvores matrizes localizadas em Chapada dos Guimarães-MT por meio de 10 primers ISSR (inter repetições de sequências simples) que revelaram 57 bandas. Destas, 33 (57,89%) apresentaram polimorfismo. A análise utilizando o Structure definiu dois grupos diferentes (K = 2), resultados que foram consistentes com os da análise de agrupamento UPGMA. O número de alelos observados (Na = 1,58), número de alelos efetivos (Ne = 1,29), índice de diversidade de Nei (He = 0,18) e o índice de Shannon (I = 0,27) foram relativamente baixos dentro da população. A AMOVA revelou que a variabilidade dentro dos grupos (83,39%) foi mais alta do que entre os grupos (16,61%). A utilização de iniciadores ISSR mostrou-se eficaz para detecção de polimorfismo genético em mangabeira, servindo de aporte para estratégias que visem à conservação, melhora

Diversity and genetic structure of mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), a fruit species from Cerrado / Diversidade e estrutura genética de mangabeira (Hancornia speciosa Gomes), uma fruteira do Cerrado

Hancornia speciosa Gomes, popularly known as mangabeira, is a fruit tree belonging to the Apocynaceae family, native to the Brazilian Cerrado. The fruit is widely used by the local population as an alternative source of income. Limited information is available about this species, which increases the difficulty of conserving its genetic resources and exploiting mangabeira as an economic resource. The objective of this research was to evaluate the genetic diversity and genetic structure of H. speciosa from Chapada dos Guimarães. Twenty-four trees and ten inter simple sequence repeats (ISSR) primers were evaluated. Of the 57 bands obtained, 33 (57.89%) presented polymorphism. The analysis using Structure defined two different clusters (K = 2), which were consistent with the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) clustering analysis. The number of observed alleles (Na = 1.58), number of effective alleles (Ne = 1.29), Neis genetic distance (He = 0.18) and Shannon index (I = 0.27) were considered low among the population. The analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the variability within the cluster (83.39%) was higher than among clusters (16.61%). ISSR primers proved effective for detection of genetic polymorphism in H. speciosa, and could be utilized for strategies that aim at conservation, plant breeding programs, and commercial use.

Hancornia speciosa Gomes, conhecida popularmente como mangabeira, é uma fruteira pertencente à família Apocynaceae que ocorre espontaneamente no Cerrado brasileiro. O fruto da mangabeira é bastante utilizado pela população local como fonte alternativa de renda e sua exploração é feita de forma extrativista. As informações sobre esta espécie são escassas, o que dificulta a conservação dos recursos genéticos e sua exploração econômica. Neste trabalho foi estudada a diversidade e estrutura genética de uma população de mangabeira, tendo sido avaliada um total de 24 árvores matrizes localizadas em Chapada dos Guimarães-MT por meio de 10 primers ISSR (inter repetições de sequências simples) que revelaram 57 bandas. Destas, 33 (57,89%) apresentaram polimorfismo. A análise utilizando o Structure definiu dois grupos diferentes (K = 2), resultados que foram consistentes com os da análise de agrupamento UPGMA. O número de alelos observados (Na = 1,58), número de alelos efetivos (Ne = 1,29), índice de diversidade de Nei (He = 0,18) e o índice de Shannon (I = 0,27) foram relativamente baixos dentro da população. A AMOVA revelou que a variabilidade dentro dos grupos (83,39%) foi mais alta do que entre os grupos (16,61%). A utilização de iniciadores ISSR mostrou-se eficaz para detecção de polimorfismo genético em mangabeira, servindo de aporte para estratégias que visem à conservação, melhora

Diversidade genética estimada com marcadores entre sequências simples repetidas em cultivos comerciais de Cupuaçuzeiro / Genetic diversity estimated using inter-simple sequence repeat markers in commercial crops of cupuassu tree

RESUMO:Quinze primers ISSR (entre sequências simples repetidas) foram utilizados para avaliar a diversidade genética entre e dentro de pomares comerciais de Theobroma grandiflorum (Willd. ex Spreng.) K. Schum. Para isso, foram analisados sessenta indivíduos, distribuídos nos três cultivos. Um total de 102 bandas foi amplificado, com uma porcentagem de 52,0% de polimorfismo em nível de espécie e média de 6,8 alelos por primer ISSR. A média do Índice de Conteúdo Polimórfico (PIC) foi de 0,55. Em relação aos índices de diversidade gênica de Nei (H) e de Shannon (I), os cultivos analisados apresentaram os valores: SAR H = 0,114 e I = 0,177; SSL H = 0,108 e I = 0,162 e SEC H = 0,104 e I = 0,156, considerados valores de moderados a baixos. A AMOVA revelou 34,91% da variância total entre os cultivos e 65,09% dentro deles. Os marcadores moleculares ISSR revelaram que há diversidade genética dentro de cada cultivo comercial estudado, portanto é possível selecionar genótipos superiores que poderão ser utilizados para originar cultivos mais uniformes. Esse resultado tem sido considerado de grande relevância, por fornecer ferramentas para a implementação de programas de melhoramento e delineamento de estratégias de conservação ex situ e in situ.

ABSTRACT:Fifteen ISSR (inter-simple sequence repeat) primers were used to evaluate the genetic diversity among and within commercial crops of T. grandiflorum (Willd. ex Spreng.) K. Schum. For this, 60 specimens were analyzed, distributed in three crops. A total of 102 bands were amplified, with a polymorphism percentage of 52.0% at species level and an average of 6.8 alleles per ISSR primer. The average for polymorphism information content (PIC) index was 0.55. In relation to the genetic diversity index of Nei (H), and Shannon (I), crops analyzed showed the following values: : SAR H = 0,114 e I = 0,177; SSL H = 0,108 e I = 0,162 e SEC H = 0,104 e I = 0,156, considered moderate to low values. AMOVA showed 34.91% of total variance among the crops, and 65.09% within them. The ISSR molecular markers revealed that there is genetic diversity within each commercial crops studied, thus is possible to select superior genotypes that can be used to give more uniform crops. This result has been considered of great relevance, to provide tools for breding implementation programs and design conservation strategies ex situ and in situ.