RESUMO
We analyzed gp120V3 HIV-1 env region genetic diversity of 27 patients failing antiretrovirals and subjected to 12-week structured treatment interruption (STI). Based on heteroduplex mobility assays, eight patients presented low pre- and post-STI genetic diversity (G1); five presented high pre-STI but low post-STI diversity (G2); five presented low pre-STI and high post-STI diversity (G3); and nine, high pre- and post-STI diversity (G4). One patient from G1, two from G2 and two from G3 were subjected to proviral DNA end-point PCR and sequencing. In three patients, the dramatic disturbance caused by STI resulted in ancestral viral progeny activation, which repopulated the cell reservoir. In two patients presenting highly homogeneous sequences and low immune selective pressure (dN/dS ratio <1), this phenomenon was not observed. The mechanisms involved in viral evolution, in which antiretroviral therapy also applies selective pressure, sometimes affects coreceptor usage of circulating viruses, leading to the suppression of x4 strains.
Assuntos
Fármacos Anti-HIV/administração & dosagem , Proteína gp120 do Envelope de HIV/genética , Infecções por HIV/virologia , HIV-1/genética , Fragmentos de Peptídeos/genética , Sequência de Aminoácidos , Fármacos Anti-HIV/farmacologia , Fármacos Anti-HIV/uso terapêutico , Análise por Conglomerados , DNA Viral/genética , Evolução Molecular , Variação Genética , Proteína gp120 do Envelope de HIV/química , Infecções por HIV/tratamento farmacológico , HIV-1/efeitos dos fármacos , HIV-1/isolamento & purificação , Humanos , Dados de Sequência Molecular , Hibridização de Ácido Nucleico , Fragmentos de Peptídeos/química , Reação em Cadeia da Polimerase , Provírus/genética , Seleção Genética , Alinhamento de Sequência , Análise de Sequência de DNARESUMO
As dificuldades de um tratamento com HAART têm levado alguns pesquisadores considerar a necessidade de desenvolver novas estratégias terapêuticas. A interrupção estruturada de tratamento (STI) anti-retroviral poderia considerar-se como o método mais simples para re-população com cepas viras teoricamente sensíveis aos anti-retrovirais em pacientes com extensa resistência genotípica aos mesmos. Após a interrupção do tratamento anti-retroviral em 27 pacientes por 12 semanas, uma taxa mais elevada da replicação viral e um declínio rápido nas células T CD4 + foi observado neste estudo. O objetivo deste estudo foi analisar a evolução das quase-espécies de HIV-1 durante STI. Através da análise da região C2/V3/C3 da gp 120 inicialmente feito pelo HMA, sendo que cinco pacientes foram selecionadas para análise detalhada da diversidade genética pelo sequenciamento genômico desta região. Os resultados do HMA mostraram todos os padrões possíveis: 8 pacientes apresentaram baixa diversidade genética na amostra pré e pós-STI, 5 apresentaram diversidade na amostra pré-STI mas não na amostra após a interrupção, em outros 5 encontramos o inverso e finalmente encontramos grande diversidade genética tanto na amostra pré quanto pós-STI em 9 pacientes. A diversidade genética analisada nos 5 pacientes selecionados para estudos evolucionários revelou-nos que o processo de evolução molecular é muito específico e ocorre de forma muito peculiar em cada paciente. Para três pacientes (03, 04 e 05) a dinâmica das quase-espécies mostrou-nos uma tendência clara para uma homogeneidade nas seqüências após STI. Nós encontramos forte pressão seleção positiva em alguns códons nas quase-espécies de três pacientes (03, 05 e 19), o que coincidia com a presença de cepas com perfil R5 (não indutor de sincício) e X4 (indutor de sincício), com prevalência de cepas R5 após STI. Em um destes pacientes (paciente 19), a coroa GWGR da alça V3 foi substituída por GGGR ( que é uma evolução de GWGR) após STI. Entretanto, os pacientes 0 1 e 04, que apresentaram a diversidade genética baixa antes e após STI, tiveram as cepas HIV-1 com um perfil genético compatível com R5 antes e após STI. Nós concluímos que o distúrbio causado por STI pode ter um impacto no perfil do gene env, com uma tendência para a re-emergência de vírus filogeneticamente mais antigos...
Assuntos
Evolução Molecular , Variação Genética , HIV-1 , Estratégias de SaúdeRESUMO
We describe HIV-1 incidence and the prevalence of genetic subtypes among cocaine users in São Paulo, Brazil. A cross-sectional HIV-1 survey was carried out among 839 current cocaine users attending seven drug treatment units in the São Paulo metropolitan area from 1997 to 1998. HIV-1 subtyping was performed among 41 positive individuals using the heteroduplex mobility assay and DNA sequencing. Participants were mainly male (95.7%) with a history of previous imprisonment (54%), and the mean age was 26.9 years (SD = 7.2). The majority (64.4%) were current crack cocaine users, and 82.1% of the total participants were noninjectors. HIV-1 seroprevalence was 4.9% (95% confidence interval [CI], 3.6%-6.6%), and the incidence (estimated by the sensitive/less-sensitive immunoassay testing strategy) was 0.71% per year (95% CI, 0.07-3.03). HIV-1 subtype B was predominant (90.3%), followed by subtype F. There was no statistically significant association between HIV-1 subtype and specific route of drug administration. Our incidence data show evidence of recent HIV-1 transmission among cocaine users, mainly among noninjectors. Detection of recently infected HIV-1 cases linked to genetic diversity analysis may provide baseline information for public health interventions in this sentinel group.
