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J Mol Biol ; 425(2): 444-56, 2013 Jan 23.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-23159556

RESUMO

gp120 is a substrate for protein engineering both for human immunodeficiency virus (HIV) immunogen design and as a bait for isolating anti-HIV antibodies from patient samples. In this work, we describe the display of a stripped core gp120 on the yeast cell surface. Validation against a panel of neutralizing antibodies confirms that yeast-displayed gp120 presents the CD4 binding site in the correct conformation. We map the epitope of the broadly neutralizing anti-gp120 antibody VRC01 using both a random mutagenesis library and a defined mutant panel and find that the resultant epitope maps are consistent with one another and with the crystallographically identified contact residues. Mapping the VRC01-competitive antibodies b12 and b13 reveals energetic differences in their epitopes that are not obvious from existing crystal structures. These data suggest mutation sets that abrogate binding to broadly neutralizing antibodies with greater specificity than the canonical mutation D368R, useful in rapidly assessing the nature of a vaccine response.


Assuntos
Anticorpos Anti-Idiotípicos/imunologia , Anticorpos Neutralizantes/imunologia , Desenho de Fármacos , Mapeamento de Epitopos , Epitopos/imunologia , Anticorpos Anti-HIV/imunologia , Proteína gp120 do Envelope de HIV/imunologia , Saccharomyces cerevisiae/imunologia , Anticorpos Anti-Idiotípicos/química , Anticorpos Anti-Idiotípicos/metabolismo , Anticorpos Neutralizantes/genética , Anticorpos Neutralizantes/isolamento & purificação , Antígenos CD4/genética , Antígenos CD4/imunologia , Antígenos CD4/metabolismo , Células Cultivadas , Epitopos/genética , Epitopos/metabolismo , Citometria de Fluxo , Anticorpos Anti-HIV/genética , Anticorpos Anti-HIV/metabolismo , Proteína gp120 do Envelope de HIV/genética , Proteína gp120 do Envelope de HIV/metabolismo , Humanos , Rim/citologia , Rim/metabolismo , Mutagênese , Proteínas Mutantes/genética , Proteínas Mutantes/imunologia , Proteínas Mutantes/metabolismo , Biblioteca de Peptídeos , Conformação Proteica , Engenharia de Proteínas , Saccharomyces cerevisiae/metabolismo
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