Correlation between rainfall and the prevalence of scrub typhus: an observation from a tropical endemic country / Correlación entre las precipitaciones y la prevalencia del tifus de matorral: una observación de un país endémico para enfermedades tropicales

The effect of climatological parameter on infectious disease is an interesting issue in clinical epidemiology. Of several parameters, rainfall is reported for its interrelationship with many tropical diseases such as malaria. In this short communication, the authors report the observation on correlation between rainfall and the prevalence of scrub typhus from a tropical endemic country.

El efecto del parámetro climatológico en las enfermedades infecciosas es un tema interesante en la epidemiología clínica. De varios parámetros, se reportan precipitaciones por su interrelación con muchas enfermedades tropicales como el paludismo. En esta breve comunicación, los autores informan de la observación sobre la correlación entre las precipitaciones y la prevalencia del tifus de matorral de un país endémico tropical.

Vegetation and seed bank of an open-scrub bush restinga formation in the Southeastern coast of Brazil / Vegetación y banco de semillas en una formación de matorral abierto de restinga en el sureste de Brasil

Introduction: Restingas are coastal plain ecosystems located along Eastern Brazil, corresponding to about 5 000 km.The restinga vegetation is associated with the Atlantic rainforest biome and comprises four distinct main formation zones: coastal grasslands, shrublands, open-forests and marsh zones. Especially due to coastal urbanization, this is a threatened ecosystem that, through its different shrub formations, exhibits a unique mosaic as a result of the vegetation distribution in nuclei of different covering, physiognomy and floristic composition. Objective: We aimed to characterize the above and belowground composition of a conserved, non-flooded, open-scrub, nuclei (patches of bushes) formation of restinga in Linhares, ES, southeastern Brazil. Methods: The vegetation survey was conducted using the line intercept method. Diameter and height of the first six nuclei were measured in five transects separated by 50 m, totaling 30 nuclei up to 350 m away from the shore line. The phytosociology and Shannon Index of the aboveground vegetation community were calculated. In the same 30 nuclei, leaf litter and topsoil layer (15 x 15 x 10 cm) samples were collected to survey the viable seed bank, which was later placed in a greenhouse for germination and seedling identification. The Sørensen Similarity index (SSi) was used to compare the floristic composition between the leaf litter and topsoil layer seed banks. Nuclei volume and number of species were calculated as well. Results: In the aboveground vegetation, 54 plant species belonging to 32 families were identified, totaling 1 098 individuals. The nuclei showed a diversity (H') of 3.08 nats, and an average diameter of 11.5 m (s = 9.1), area of 526.4 m2 (s = 1 081.7), and height of 2.9 m (s = 1.1). Davilla flexuosa, followed by Smilax rufescens, presented the highest IVI (Importance Value Index). A total of 1 839 seedlings from 32 species and 19 families were identified in the seed bank. Enydra sessilis (Asteraceae) had the highest seed density (544), while the family with highest species richness was Cyperaceae. A low similarity between the vegetation surveyed and the seed bank composition was found (only 5 species in common, SSi = 0.10). Conclusions: The results indicate that a post-disturbance early community, established from the seed bank, would have a substantially different species composition, but with other potential species to restore vegetation over the long-term succession.

Introducción: Las restingas son ecosistemas llanos costeros ubicados a lo largo del este de Brasil, que corresponden a unos 5 000 km de la costa atlántica brasileña. La vegetación de restinga está asociada con el bioma de la selva tropical atlántica y comprende cuatro zonas de formación principales: praderas costeras, matorrales, bosques abiertos y zonas pantanosas. Especialmente debido a la urbanización costera, este es un ecosistema amenazado, que, a través de sus formaciones arbustivas, exhibe un mosaico único, como resultado de la distribución de la vegetación en núcleos de diferentes coberturas, fisonomía y composición florística. Objetivo: Caracterizar la composición florística superficial y subterránea de una formación conservada, no inundada, de núcleos de matorral abierto de restinga en Linhares, ES, costa del sureste de Brasil. Métodos: La vegetación se muestreó utilizando el método de la línea de intercepción. El diámetro y la altura de los primeros seis núcleos se midieron en cinco transectos instalados cada 50 m, con un total de 30 núcleos distantes hasta 350 m de la línea de costa. Se muestreó la comunidad de vegetación y se calculó su fitosociología e índice de Shannon. En los mismos 30 núcleos, se recogió la hojarasca más la capa superior del suelo (15 x 15 x 10 cm) para examinar el banco de semillas viable, que luego se colocó en un invernadero para germinar e identificar las plántulas. El índice de similitud de Sørensen se usó para comparar la composición florística entre la hojarasca y el banco de semillas de la capa superficial del suelo y también se calculó la regresión entre el volumen del núcleo y el número de especies. Resultados: En la vegetación superficial se identificaron 54 especies de plantas pertenecientes a 32 familias, con un total de 1 098 plantas. Los núcleos registraron una diversidad (H') de 3.08 nats, y un diámetro promedio de 11.5 m (s = 9.1), área de 526.4 m² (s = 1 081.7) y altura de 2.9 m (s = 1.1). Davilla flexuosa, seguida de Smilax rufescens, presentó el VI (Valor de Importancia) más alto. Se identificaron un total de 1 839 plántulas de 32 especies y 19 familias en el banco de semillas. Enydra sessilis (Asteraceae) tuvo la mayor densidad de semillas viables (544), pero la familia con mayor riqueza de especies fue Cyperaceae. Se encontró una baja similitud entre la vegetación y la composición del banco de semillas (solo 5 especies en común, índice de Sørensen = 0.10). Conclusiones: Los resultados indican que una comunidad recién establecida después de una alteración podría tener una composición de especies sustancialmente diferente, pero con otras especies potenciales para restaurar la vegetación a largo plazo.

The forgotten habitats in conservation: early successional vegetation

Conservation efforts in terrestrial environments have focused on preserving patches of natural habitats and restoring disturbed habitats, with the main goal of transforming them into forests or habitats that resemble the original conditions. This approach tends to overlook the importance of conserving early successional vegetation (e.g., riverside vegetation, natural regeneration, young secondary forests), which often includes a large number of species (e.g., plants and animals) associated with or restricted to these habitats. In this paper we want to bring to attention the importance of preserving early successional vegetation, and to encourage scientists to investigate, e.g., the diversity, distribution, and species interactions occurring in these habitats. To address these goals, we focus on two main objectives: (1) to identify the common types of early successional vegetation in the Costa Rican Central Valley; and (2) to use some case studies to draw attention to the importance that such areas have as reservoirs of a large portion of the diversity unique to early successional stages. We first include an example to show the diversity of plants in small forest patches immersed in a large urbanized area. We provide general information on the insects that occur in early successional vegetation in urban areas, and in further detail examples of butterflies. Additionally, we provide examples of birds and mammals that are restricted to early successional vegetation, and how the reduction of this vegetation type affects species conservation. Finally, we encourage scientists to investigate these early successional habitats, particularly those species exclusive to early successional stages. Special attention should be paid to endemic species and those with a restricted distribution. Information of this type will make conservation of the diversity contained in these habitats possible.

Los esfuerzos de conservación en ambientes terrestres se han centrado principalmente en la preservación de ambientes naturales y la restauración de diferentes hábitats, con la meta principal de transformar estos ambientes en bosques maduros o hábitats que asemejen las condiciones originales. Este enfoque tiende a pasar por alto la importancia de conservar la vegetación de estados de regeneración temprana (e.g., vegetación riparia, regeneración natural, bosque secundario joven), la cual incluye un gran número de especies (e.g., plantas y animales) asociadas o restringidas a estos hábitats. Con este artículo queremos llamar la atención sobre la importancia de preservar áreas cubiertas con vegetación de sucesión temprana, e instar a científicos y naturalistas a investigar, e.g., la diversidad, distribución, e interacciones entre las especies presentes en estos ambientes. Para apoyar esta meta, nos enfocamos en dos objetivos principales: (1) identificar los tipos más comunes de vegetación pionera en el Valle Central de Costa Rica; y (2) utilizar algunos casos de estudio para llamar la atención sobre la importancia que tales áreas tienen como reservorio de gran parte de la diversidad, mucha de la cual es única de los estados de sucesión temprana. Primero se incluye un ejemplo particular en el cual se muestra la diversidad de plantas en pequeños fragmentos de bosque y matorral inmersos en una gran área urbanizada. Después se presenta una revisión general de los insectos que habitan en la vegetación de sucesión temprana en áreas urbanas, para luego discutir en mayor detalle ejemplos de mariposas. Además, proporcionamos ejemplos de especies de aves y mamíferos que están restringidos a vegetación de sucesión temprana, y cómo la reducción de este ambiente afecta su conservación. Finalmente, instamos a los científicos de diferentes áreas a investigar los diversos procesos ecológicos e interacciones biológicas inherentes a los estados de regeneración temprana. Especial atención requieren aquellas especies exclusivas o endémicas de estos ambientes. Sin esta información es imposible conservar la diversidad de estos hábitats.

Tifus de los matorrales, una enfermedad emergente en Chile / Scrub typhus, an emerging infectious disease in Chile

Resumen El tifus de los matorrales, causado por Orientia tsutsugamushi y transmitido por larvas de ácaros trombicúlideos de roedores silvestres es una rickettsiosis endémica en el Asia Pacífico. Luego del primer caso identificado en Chile en el año 2006, nuestro grupo ha identificado más de 30 casos a partir del año 2015. Los casos se han presentado con un marcado predominio en meses de verano, y su presentación clínica incluye fiebre, exantema y una mancha negra en el sitio de inoculación. Otros hallazgos frecuentes han sido cefalea intensa, sudoración nocturna, aumento de PCR, VHS y transaminasas hepáticas. La gran mayoría de los pacientes se han diagnosticado en el sur de Chile (principalmente la isla de Chiloé), pero recientemente también se han presentado casos en la Región Metropolitana, en personas volviendo de viajes al sur de Chile. Los médicos clínicos deben estar informados de esta enfermedad emergente en el país, de modo de sospecharla e iniciar terapia empírica con doxiciclina. La confirmación de estos casos con los métodos diagnósticos disponibles en Chile contribuirá a una mejor comprensión del rango epidemiológico y la relevancia clínica de esta infección nueva en el país.

Scrub typhus, caused by Orientia tsutsugamushi and transmitted by larvae of trombiculid mites, is an endemic rickettsiosis in the Asia Pacific region. After the first identification of a case in Chile in 2006, more than 30 cases have been diagnosed by our group since 2015. Cases were detected predominantly during the Chilean summer months. Patients presented with fever, rash, and a typical eschar at the inoculation site; other frequent findings were intense headache, night sweats, increased laboratory markers of inflammation and transaminases. The vast majority of cases have been diagnosed in southern Chile (mainly Chiloé Island), although recently some cases were also identified in the central Metropolitan Region in patients returning from trips to southern Chile. Physicians attending Chilean patients should be aware of this emerging infection to be able to initiate empirical therapy with doxycycline. The confirmation of cases by the diagnostic methods available in Chile will contribute to a better understanding of the epidemiological and clinical relevance of this emerging infection in South America.

Prosopis laevigata and Mimosa biuncifera (Leguminosae), jointly influence plant diversity and soil fertility of a Mexican semiarid ecosystem

Prosopis laevigata and Mimosa biuncifera are frequently found in arid and semiarid shrublands, but scarce information is available about their influence on plant community structure and soil fertility. We compared plant community structure, diversity and soil nutrients of three semiarid shrubland sites located in Mezquital Valley, Mexico. These sites differ in their dominant species: Site 1 (Bingu) P. laevigata, Site 2 (González) M. biuncifera, and Site 3 (Rincón) with the presence of both legumes. The results showed that the plant community with P. laevigata and M. biuncifera (Site 3) had more cover, taller plants and higher plant diversity than sites with only one legume (Site 1 and Site 2). Soil organic matter (SOM), soil organic carbon (SOC), total nitrogen (TN), phosphorus-Olsen (P) and C mineralization were higher in the soil under the canopy of both legumes than in bare soil. In contrast, soil cation concentrations were lower under the canopy of P. laevigata, but not for M. biuncifera. In addition, the density of arbuscular mycorrhizal fungi spores was higher within the soil under the canopy of M. biuncifera than in the soil under the canopy of P. laevigata. Thus, resource islands (RI) created by P. laevigata increased the amounts of SOC, TN and P when compared with the RI of M. biuncifera. This study provided evidences about the importance of species identity in order to expand the niche availability for the establishment of other plants, and highlights that P. laevigata and M. biuncifera jointly influencing plant colonization within semiarid ecosystems.

Prosopis laevigata y Mimosa biuncifera coexisten en los matorrales semiáridos; sin embargo, se desconoce su influencia sobre la diversidad de la comunidad vegetal y el suelo. Este estudio evaluó el efecto de P. laevigata y M. biuncifera sobre la estructura, diversidad vegetal y nutrimentos del suelo, en tres matorrales del Valle del Mezquital, México. Los sitios difieren en la especie dominante: Sitio 1, P. laevigata; Sitio 2, M. biuncifera y Sitio 3, ambas leguminosas. En cada sitio se recolectó suelo, tanto abajo y fuera del dosel de las leguminosas, además, se realizaron transectos para medir e identificar las plantas arbóreas y arbustivas, se calculó el índice de valor de importancia y la diversidad del matorral. Asimismo, se registró mayor riqueza y diversidad en el Sitio 3 (ICE 29 spp. y H’ 2.7), en comparación con el Sitio 1 (24 spp. y 2.4) y Sitio 2 (26 spp. y 2.1). La materia orgánica y el carbono orgánico del suelo, así como el N total, el P-Olsen y la mineralización de C fueron mayores en el suelo bajo dosel de ambas leguminosas. La abundancia de esporas de hongos micorrizógenos arbusculares fue favorecida por M. biunficera. La influencia de P. laevigata para crear islas más ricas en recursos fue mayor que en M. biunficera, lo anterior sugiere que cada leguminosa modifica de una forma diferente el microambiente, sin embargo, juntas aumentan la disponibilidad de nichos para el establecimiento de otras especies, lo queayuda a comprender el papel de P. laevigata y M. biuncifera sobre la colonización vegetal en ecosistemas semiáridos.