Componente web para el análisis de información clínica usando la técnica de Minería de Datos por agrupamiento / Web component for the analysis of clinical information using the technique of clustering data mining

La digitalización de los diferentes procesos y la automatización de los servicios generan grandes volúmenes de información. La Minería de Datos (MD) es una técnica de Inteligencia Artificial que permite encontrar la información no trivial que reside en los datos almacenados. La presente investigación pretende desarrollar una vista de análisis para el Sistema Integral para la Atención Primaria de Salud (SIAPS), usando la técnica de agrupamiento enmarcada en el algoritmo Simple K-Means, con el objetivo de realizar un análisis de la información clínica de los pacientes; para ello se plantea la extracción del conocimiento del almacén de datos alimentado del repositorio de historias clínicas electrónicas. La investigación se sustenta en la herramienta de libre distribución WEKA, esta funciona de forma aislada al SIAPS; la interfaz, así como las vistas, modelos e informes generados por WEKA en ocasiones resultan de difícil comprensión por los profesionales de la salud, los que no necesariamente tienen que poseer conocimientos avanzados de las nuevas tecnologías de la información. Para el desarrollo de la solución se empleó el lenguaje de programación Java 1,6, como servidor de aplicación JBoss 4,2 y Eclipse 3,4 como plataforma de desarrollo, como Sistema Gestor de Bases de Datos PostgreSQL 8,4 y SEAM como framework de integración. Durante todo el proceso se hizo uso de la plataforma Java Enterprise Edition 5, 0. Como resultado se espera obtener una vista de análisis que facilite la comprensión de los modelos generados, apoyando de esta forma el proceso de toma de decisiones clínicas(AU)

The digitization of the different processes and automation services generate large volumes of information. Data mining (DM) is an artificial intelligence technique that allows finding non-trivial information residing in stored data. This research aims to develop a view of analysis for the Integral System for Primary Health Care (SIAPS), using grouping technique framed on Simple K-Meansalgorithm, with the goal of completing an analysis of the patients' clinical information, for it raises the extraction of knowledge from data warehouse powered by the repository of electronic medical records. The research is based on the free distribution tool WEKA, it works in isolation of SIAPS, the interface, as well as the views, models and reports generated by WEKA are sometimes difficult to understand by health professionals, who do not necessarily have to possess advanced knowledge of new information technologies. For the development of the solution was used Java 1.6 as a programming language, JBoss 4.2 as the application Server and Eclipse 3.4 as a development platform. PostgreSQL 8.4 was used as Database Management System and the integration framework SEAM. Java Enterprise Edition 5.0 platform was used during the whole process. An analysis view to facilitate the understanding of the generated models is expected as a result, to support the process of making clinical decisions(AU)

Componente web para el análisis de información clínica usando la técnica de Minería de Datos por agrupamiento / Web component for the analysis of clinical information using the technique of clustering data mining

La digitalización de los diferentes procesos y la automatización de los servicios generan grandes volúmenes de información. La Minería de Datos (MD) es una técnica de Inteligencia Artificial que permite encontrar la información no trivial que reside en los datos almacenados. La presente investigación pretende desarrollar una vista de análisis para el Sistema Integral para la Atención Primaria de Salud (SIAPS), usando la técnica de agrupamiento enmarcada en el algoritmo Simple K-Means, con el objetivo de realizar un análisis de la información clínica de los pacientes; para ello se plantea la extracción del conocimiento del almacén de datos alimentado del repositorio de historias clínicas electrónicas. La investigación se sustenta en la herramienta de libre distribución WEKA, esta funciona de forma aislada al SIAPS; la interfaz, así como las vistas, modelos e informes generados por WEKA en ocasiones resultan de difícil comprensión por los profesionales de la salud, los que no necesariamente tienen que poseer conocimientos avanzados de las nuevas tecnologías de la información. Para el desarrollo de la solución se empleó el lenguaje de programación Java 1.6, como servidor de aplicación JBoss 4.2 y Eclipse 3.4 como plataforma de desarrollo, como Sistema Gestor de Bases de Datos PostgreSQL 8.4 y SEAM como framework de integración. Durante todo el proceso se hizo uso de la plataforma Java Enterprise Edition 5.0. Como resultado se espera obtener una vista de análisis que facilite la comprensión de los modelos generados, apoyando de esta forma el proceso de toma de decisiones clínicas(AU)

The digitization of the different processes and automation services generate large volumes of information. Data mining (DM) is an artificial intelligence technique that allows finding non-trivial information residing in stored data. This research aims to develop a view of analysis for the Integral System for Primary Health Care (SIAPS), using grouping technique framed on Simple K-Means algorithm, with the goal of completing an analysis of the patients' clinical information, for it raises the extraction of knowledge from data warehouse powered by the repository of electronic medical records. The research is based on the free distribution tool WEKA, it works in isolation of SIAPS, the interface, as well as the views, models and reports generated by WEKA are sometimes difficult to understand by health professionals, who do not necessarily have to possess advanced knowledge of new information technologies. For the development of the solution was used Java 1.6 as a programming language, JBoss 4.2 as the application Server and Eclipse 3.4 as a development platform. PostgreSQL 8.4 was used as Database Management System and the integration framework SEAM. Java Enterprise Edition 5.0 platform was used during the whole process. An analysis view to facilitate the understanding of the generated models is expected as a result, to support the process of making clinical decisions(AU)

A classifier system for predicting RNA secondary structure.

Finding the secondary structures of ribonucleic acid sequences is a very important task. The secondary structure helps determine their functionalities which in turn plays a role in the proteins production. Manual laboratory methods use X-ray diffraction to predict secondary structures but it is complex, slow and expensive. Therefore, different computational approaches are used to predict RNA secondary structure in order to reduce the time and cost associated with the manual process. We propose a system called IsRNA to predict a single element, internal loop, of the RNA secondary structure. IsRNA experiments with different classifiers such as SVM, KNN, Naive Bayes and Simple K means to find the most accurate classifier. We present a through experimental evaluation of 24 features, classified into five groups, to determine the most relevant feature groups. The system is evaluated using Rfam sequences and achieves an overall sensitivity, selectivity, and accuracy of 96.1%, 98%, and 96.1%, respectively.