Modeling the transmission mitigation impact of testing for infectious diseases.

A fundamental question of any program focused on the testing and timely diagnosis of a communicable disease is its effectiveness in reducing transmission. Here, we introduce testing effectiveness (TE)-the fraction by which testing and post-diagnosis isolation reduce transmission at the population scale-and a model that incorporates test specifications and usage, within-host pathogen dynamics, and human behaviors to estimate TE. Using TE to guide recommendations, we show that today's rapid diagnostics should be used immediately upon symptom onset to control influenza A and respiratory syncytial virus but delayed by up to two days to control omicron-era severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Furthermore, while rapid tests are superior to reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) to control founder-strain SARS-CoV-2, omicron-era changes in viral kinetics and rapid test sensitivity cause a reversal, with higher TE for RT-qPCR despite longer turnaround times. Last, we illustrate the model's flexibility by quantifying trade-offs in the use of post-diagnosis testing to shorten isolation times.

Metagenomic next-generation sequencing as a diagnostic tool in the clinical routine of an infectious diseases department: a retrospective cohort study.

BACKGROUND: Metagenomic next-generation sequencing (mNGS) of circulating cell-free DNA from plasma is a hypothesis-independent broadband diagnostic method for identification of potential pathogens. So far, it has only been investigated in special risk populations (e.g. patients with neutropenic fever). PURPOSE: To investigate the extent to which mNGS (DISQVER® platform) can be used in routine clinical practice. METHODS: We collected whole blood specimens for mNGS testing, blood cultures (BC), and pathogen-specific PCR diagnostics. Clinical data and pathogen diagnostics were retrospectively reviewed by an infectious disease expert panel regarding the adjustment of anti-infective therapy. RESULTS: In 55 selected patients (median age 53 years, 67% male) with heterogeneous diagnoses, a total of 66 different microorganisms and viruses were detected using mNGS (51% viruses, 38% bacteria, 8% fungi, 3% parasites). The overall positivity rate of mNGS was 53% (29/55). Fifty-two out of 66 (79%) potential pathogens detected by mNGS were found in patients with primary or secondary immunodeficiency. The concordance rates of BC and pathogen-specific PCR diagnostics with mNGS testing were 14% (4/28) and 36% (10/28), respectively (p < 0.001). An additional bacterial pathogen (Streptococcus agalactiae) could only be detected by BC. Therapeutic consequences regarding anti-infective therapy were drawn from 23 pathogens (35% of detections), with 18 of these detections occurring in patients with immunodeficiency. CONCLUSIONS: We conclude that mNGS is a useful diagnostic tool, but should only be performed selectively in addition to routine diagnostics of infectious diseases. The limited number of patients and the retrospective study design do not allow any further conclusions.

Occurrence of viral diseases in donkeys (Equus asinus) in São Paulo State, Brazil / Ocorrência de enfermidades virais em asininos (Equus asinus) no estado de São Paulo, Brasil

Among the diseases that affect equines, viral diseases play an important role from a health and economic point of view, especially influenza, viral arteritis, herpes infections and vesicular stomatitis. In the Brazilian literature, there is little or no account of the occurrence of infectious diseases in donkeys. Given the importance of donkeys in different activities and the lack of information on infections that may occur in these animals, the aim of this study was to determine the frequency of anti-equine herpesvirus (EHV), anti-equine arteritis virus (EAV), anti-vesicular stomatitis, and anti-equine influenza (H3N8) antibodies in the serum of 85 donkeys bred in some regions of the state of São Paulo. We found the following antibody frequencies: 50.6% (43/85) antibodies against influenza virus subtype H3N8, 47% (40/85) anti-EHV, and 20% (17/85) anti-EAV. The donkeys were not seropositive for vesicular stomatitis. The results suggested that the agents EHV, EAV, and equine influenza subtype H3N8 circulate among donkeys in some regions of the state of São Paulo, Brazil, reinforcing the importance of establishing a routine diagnosis and epidemiological study of this species (AU).

Dentre as doenças que acometem os equídeos, as enfermidades virais assumem um papel importante do ponto de vista sanitário e econômico, especialmente a influenza, arterite viral, as infecções herpéticas e a estomatite vesicular. Na literatura nacional, existe pouco ou nenhum relato sobre a ocorrência de enfermidades infecciosas nos asininos. Tendo em vista a importância dos asininos para diferentes atividades e a falta de informações sobre as doenças que acometem esses animais, este trabalho teve como objetivo estudar a frequência de anticorpos anti-EHV, antivírus da arterite equina, anti-estomatite vesicular e anti-influenza equina (H3N8) em 85 soros de jumentos criados no estado de São Paulo. Estimou-se que 50,6% apresentavam anticorpos contra o subtipo H3N8 do vírus da influenza; 47% (40/85) apresentavam anticorpos contra o EHV e 20% apresentavam anticorpos contra o vírus da arterite. Os jumentos não foram soro reagentes contra a estomatite vesicular. Os resultados obtidos sugerem que os agentes EHV, vírus da arterite equina e influenza equina subtipo H3N8, circulam entre os jumentos do estado de São Paulo, caracterizando a importância do estabelecimento de uma rotina diagnóstica e estudos epidemiológicos na espécie (AU).

La enfermedad producida por el virus chikungunya. ¿Qué esperar luego del estadio agudo? / Chikungunya virus (CHIKV): what can be expected after the acute phase?

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Diversidad antigénica de las vacunas antiparotiditicas / Antigenic diversity of vaccines againts mumps

La parotiditis es una enfermedad infecciosa inmunoprevenible  causada por el virus de la parotiditis, miembro del género Rubulavirus, familia Paramyxoviridae, del cual se conocen 12 genotipos confirmados, designados como A-L y otro nuevo genotipo designado como M. Las vacunas anti-parotiditis por lo general,  se fabrican empleando virus vivo atenuado de alguno de estos genotipos y están  disponibles como monovalente (parotiditis) y trivalente (sarampión-rubéola-parotiditis). A pesar de los programas de vacunación implementados por muchos países, se han presentado brotes de parotiditis en forma epidémica en la cual se ha detectado co-circulación de genotipos entre poblaciones vacunadas. Entre las posibles explicaciones  están: el fracaso primario a la vacunación, pérdida de efectividad secundaria e infección por virus heterólogos. Como consecuencia la Organización Mundial de la Salud (OMS) ha recomendado estudios moleculares epidemiológicos, que incluya la genotipificación de cepas circulantes del virus de la parotiditis, como parte del programa de vigilancia. Esto permitirá una mayor información de la distribución de los genotipos en todo el mundo, contribuyendo a la vigilancia de la parotiditis y posiblemente en la reformulación de vacunas más eficaces. Esta revisión muestra la importancia que tiene la caracterización molecular  o genotipificación del virus de la parotiditis, con el propósito de comprender y explicar el comportamiento epidemiológico de esta enfermedad que ha sido ampliamente controlada por la aplicación sistemática de la vacuna a nivel mundial.

Mumps is a vaccine-preventable infectious disease, caused by mumps virus, member of Rubulavirus genus, Paramyxoviridae family, has been classified into 12 confirmed genotypes, designated as A-L and one proposed genotype, M. Usually the anti-mumps vaccines are manufactured using attenuated live virus genotypes and any of these are available as monovalent (mumps) and trivalent (measles-mumps-rubella). Although vaccination programs implemented by many countries, there have been outbreaks of mumps in epidemic form, in which has been detected co-circulation of genotypes among vaccinated populations. Possible explanations are: the primary vaccination failure, loss of high effectiveness and heterologous virus infection. Because of this, the World Health Organization (WHO) has recommended molecular epidemiological studies, including genotyping of circulating strains of mumps virus as part of the monitoring program. This information will allow greater distribution of genotypes worldwide, contributing to monitoring and possibly mumps reformulating more effective vaccines. This review shows the importance of molecular characterization and genotyping of mumps virus, in order to understand and explain the epidemiological behavior of the disease has been largely controlled by the systematic application of the vaccine worldwide.

Morcegos na área urbana:doença adquirida na moradia.

1. Em infectologia a importância não está apenas no diagnóstico o mais rápido possível, mas, sobretudo, em acionar a prevenção e o controle das doenças transmissíveis, em colaboração com o Centro de Vigilância Epidemiológica. 2. Até na instituição universitária conceituada, a anamnese − primeira e fundamental etapa da relação interno/paciente − perdeu a excelência que já foi marca no ensino médico do passado. 3. O inquérito epidemiológico excepcionalmente é detalhista, o que só se verifica se o preceptor dos futuros médicos for hábil e paciente para revisão e complementação adequada dos informes no prontuário. 4. Morbidades tais como a histoplasmose e a criptococose, antes raras, tornaram-se comuns. 5. É conhecida a vulnerabilidade de crianças ao ataque de morcegos, o que decorre da maior profundidade do sono e da inadvertência. 6. Contato com morcegos, ataque ao homem e acidentes por eles provocados já descolaram de territórios agropecuários ou amazônicos; podem ser observados na área metropolitana. 7. A raiva humana, no extremo da gravidade, volta à discussão desde que o morcego adquiriu visibilidade epidemiológica, de grande aumento, como o transmissor mais viável. 8. No casebre, a criatura humana pode ser a vítima preferencial − como acontece com o animal de pasto −, submetida a ataques repetidos e, consequentemente, padecer de anemia espoliativa. 9. À notável capacidade de adaptação do morcego ao ambiente que o homem lhe proporciona dá-se o nome de sinantropia. O animal é dito sinantrópico.

Importancia de las pruebas específicas e inespecíficas para el diagnóstico de sífilis en donantes de sangre / Importance of specific and unspecific tests to diagnosis syphilis in blood donors

Con la finalidad de mejorar el diagnóstico de laboratorio de sífilis como enfermedad infecto contagiosa en donantes de sangre, se realizó el presente estudio cuyo objetivo es determinar las pruebas serológicas específicas: Inmunoanálisis Enzimático (ELISA), Inmunocromatografía (IC) e inespecíficas: Laboratorio de investigación de enfermedades venéreas (VDRL) y Reaginas séricas no calentadas (USR) más confiable para el descarte de sífilis en donantes de sangre del Hospital Dr. Adolfo Pons de Maracaibo, estado Zulia. Se analizaron 481 sueros de donantes de sangre aparentemente sanos, de ambos sexos en edades comprendidas entre 18 y 60 años. Del total de muestras analizadas por ELISA 10 resultaron positivas (2,07 por ciento) y 8 (1,66 por ciento) por IC. El VDRL captó 4 (0,82 por ciento) sueros con reactividad y USR sólo 2 sueros (0,41 por ciento). Se concluye que la prueba de ELISA conjuntamente con el VDRL son las herramientas más seguras y fidedignos para el descarte de sífilis en donantes de sangre, dado que proporcionan en paralelo resultados confiables, fidedigno que garantice la calidad de la misma al ser transfundida

In order to improve the laboratory diagnosis of syphilis as an infectious and contagious disease in blood donors, we performed this study to determine the reliability of the specific: Enzyme Immunoassay (Elisa) and Immune-chromatography (IC) tests, the unspecific: Venereal Disease Research Laboratory (VDRL) test and the Unheated serum regain (USR) Serologic tests to rule out syphilis from blood donors of the Dr Adolfo Pons Hospital in Maracaibo, Zulia state. We analyzed 481 sera from apparently healthy blood donors, male and female, 18 to 60 years of ages. From the samples analyzed by Elisa 10 were positive (2.07 percent) and 8 (1.66 percent) by IC. VDRL detected 4 (0.82 percent) reactive sera and USR just 2 (0.421 percent). We concluded that Elisa with VDRL are the safest and more reliable tests to rule out syphilis from blood donors, since they gave in parallel reliable results to assure the quality of blood to be transfused

La atención primaria debe avanzar con las técnicas de diagnóstico rápido / Primary care should advance with fast diagnostic techniques

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Avenir de l'homeopathie pediatrique / The future of pediatric homeopathy

Que de reflexions, de propos, d'emjeux exprimes pour le prochain millenaire. L'homeopathie pediatrique n'y echappe pas!

El riesgo de transmisión de enfermedades infecciosas por vía de la transfusión / The risk of transmision of infectious diseases via transfusion

La transfusión es una práctica frecuente en las pacientes obstétricas; el empleo de la sangre puede salvar la vida de una paciente, pero no está exento de riesgos, de los cuales la transmisión de infecciones es uno de los más importantes. A partir de la identificación de la transmisión del virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) por vía de la transfusión, a nivel mundial se ha incrementado el número de medidas preventivas para eliminar el riesgo de transmisión de enfermedades infecciosas por esta vía. Los microorganismos que se pueden transmitir por enfermedades infecciosas por esta vía. Los microorganismos que se pueden transmitir por enfermedades infecciosas por esta vía. Los microorganismos que se pueden transmitir por transfusión incluyen: virus linfotrópicos humanos de células T (HTLV) y II, VIH, virus de hepatitis B, virus de hepatitis C; virus de hepatitis D, virus de hepatitis G, citomegalovirus, Treponema pallidum, Brucella sp, Plasmodium sp, Toxoplasma gondii y Trypanosoma cruzi. La medida más importante para reducir los riesgos que conlleva la transfusión es el uso adecuado y cauteloso de la misma. El presente artículo revisa las indicaciones de la transfusión, describe las infecciones más comunes asociadas a este procedimiento y analiza las medidas de prevención a poner en práctica

Estudio de infecciones virales en el lactante menor transfundido en la etapa neonatal / Post-neonatal transfusion. Viral infectins in infants

Objetivo. Evaluar si el antecedente de transfusión se asocia a la conversión serológica de enfermedades virales en el primer año de vida. Material y métodos. Se evaluaron a lactantes de 6-12 meses de edad, divididos en 2 grupos según el antecedente de transfusión neonatal. En la madre y los lactantes se determinaron los anticuerpos contra: citomegalovirus (anti-CMV), Epstein-Barr (anti-VEB), virus de la inmunodeficiencia humana (anti-VIH) 1+2, hepatitis C(anti-VCH), virus linfotrópico de células T humanas tipo I+II (HTLV I+II), antígeno de superficie del virus de la hepatitis B (AgsHB) y porción central del antígeno B (anti-HBc). Resultados. Se incluyeron 37 madres y 41 lactantes. El grupo 1 (transfundidos) se formó por 23 niños y el grupo 2 con 18 controles. La menor edad gestacional fue la única variable que se asoció al antecedente transfusional (P=0.03). Los resultados serológicos entre el grupo 1 y 2 no mostraron diferencias significativas. El anti-VIH 1+2, AgsHB y anti-HBc fueron negativos en el binomio. En los lactantes el anti-VHC fue positivo en 4 casos, todos del grupo 1. En este grupo sólo 1 madre fue positiva. Los anti-CMV fueron positivos en 19 casos, distribuidos por igual en ambos grupos. En 18 de 19 casos con anti-CMV, el binomio resultó positivo. El anti-HTLV I+II fue positivo en 4 lactantes, 3 en el grupo 1 y 1 en el grupo 2, con una madre positiva en el grupo 1. Para el anti-VEB, un lactante fue positivo y todas las madres presentaron reactividad. Conclusiones. Los niños con menor edad gestacional al nacimiento se transfunden con más frecuencia y todos los niños menores de 31 semanas son transfundidos. La probabilidad de que ocurra transmisión postransfusional de alguna infección viral depende, entre otros factores, de la prevalancia de los marcadores serológicos contra estas enfermedades virales. La elevada prevalancia de positividad serológica de algunos marcadores maternos, actúan como variables oconfusoras e impiden establecer si la seroconversión en los lactantes está asociada a la transfusión

Seropositividad de la infección por HCV y HBV, en estudiantes universitarios del Estado de Nuevo León, México / Positive serology for HCV and HBV infection in univertity students of the state on Nuevo Leon, Mexico

Antecedentes: La hepatitis viral es una enfermedad infectocontagiosa. Los pacientes infectados con virus de la hepatitis B (HBV) o con virus de la hepatitis C (HCV) pueden evolucionar a un estado crónico sintomático o asintomático que ocasiona cirrosis y un riesgo muy alto de carcinoma hepático. Objetivo: Los sujetos asintomáticos portadores del antígeno de superficie del HBV (Hbs-Ag) o de anticuerpos dirigidos contra HCV son potencialmente infectantes, por lo que desde el punto de vista de salud pública, es muy importante detectarlos. Métodos: En este trabajo se buscó la frecuencia de seropositividad de HBs-Ag y de anticuerpos anti-HCV en una población de 774 jóvenes de nuevo ingreso a la Facultad de Medicina de la Universidad Autónoma de Nuevo León, con una edad promedio de 188 años. Para detectar HBs-Ag se usó una prueba de ELISA de segunda generación y una prueba confirmatoria de neutralización. Los anticuerpos anti-HCV se midieron por un ELISA de segunda generación y por una prueba confirmatoria de un inmunoensayo en línea o RIBA. Tesultados: Se detectaron tres sueros positivos en HBs-Ag por ELISA, y sólo un suero (0.13 por ciento de las muestras analizadas) se confirmó por neutralización. En cambio se obtuvieron 12 sueros con anticuerpos dirigidos contra HCV por ELISA, de los cuales 8 fueron confirmados por RIBA ( 1.03 por ciento de la población total analizada). Dos sueros positivos mostraron bandas de reactividad intensa y 6 dieron bandas de reactividad débil. Los 4 sueros negativos representan el 0.5 por ciento de falsos positivos de la prueba de ELISA para determinar anti-HCV. Conclusiones: En este estudio se encontró que la frecuencia de anticuerpos anti-HCV fue 7.95 veces más alta que la de HBs-Ag. Todos los sujetos seropositivos estaban asintomáticos, pero son considerados potencialmente infectantes. Este trabajo pone de manifiesto la necesidad de implantar en forma rutinaria las técnicas de detección de HBs-Ag y de los anticuerpos anti HCV, para poder establecer la prevalencia de estas enfermedades virales en nuestra región.

Infecciones en pacientes no inmunocomprometidos y factores condicionantes de infección / Infections in the no-immunocompromised patients and conditional factors of infection

Se revisan de manera general los factores que condicionan procesos infecciosos, principalmente las características del huésped, agentes infecciosos y sus vías de transmisión, así como de las medidas preventivas de las mismas