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Proteins ; 88(10): 1361-1375, 2020 10.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32506560

RESUMO

Years of evolution have kept actin conserved throughout various clades of life. It is an essential protein starring in many cellular processes. In a primitive eukaryote named Entamoeba histolytica, actin directs the process of phagocytosis. A finely tuned coordination between various actin-binding proteins (ABPs) choreographs this process and forms one of the virulence factors for this protist pathogen. The ever-expanding world of ABPs always has space to accommodate new and varied types of proteins to the earlier existing repertoire. In this article, we report the identification of 390 ABPs from Entamoeba histolytica. These proteins are part of diverse families that have been known to regulate actin dynamics. Most of the proteins are primarily uncharacterized in this organism; however, this study aims to annotate the ABPs based on their domain arrangements. A unique characteristic about some of the ABPs found is the combination of domains present in them unlike any other reported till date. Calponin domain-containing proteins formed the largest group among all types with 38 proteins, followed by 29 proteins with the infamous BAR domain in them, and 23 proteins belonging to actin-related proteins. The other protein families had a lesser number of members. Presence of exclusive domain arrangements in these proteins could guide us to yet unknown actin regulatory mechanisms prevalent in nature. This article is the first step to unraveling them.


Assuntos
Citoesqueleto de Actina/genética , Actinas/genética , Proteínas de Ligação ao Cálcio/genética , Entamoeba histolytica/genética , Proteínas dos Microfilamentos/genética , Proteínas de Protozoários/genética , Citoesqueleto de Actina/química , Citoesqueleto de Actina/metabolismo , Actinas/classificação , Actinas/metabolismo , Sequência de Aminoácidos , Proteínas de Ligação ao Cálcio/metabolismo , Bases de Dados de Proteínas , Entamoeba histolytica/classificação , Entamoeba histolytica/metabolismo , Entamoeba histolytica/patogenicidade , Forminas/classificação , Forminas/genética , Forminas/metabolismo , Expressão Gênica , Proteínas dos Microfilamentos/classificação , Proteínas dos Microfilamentos/metabolismo , Anotação de Sequência Molecular , Família Multigênica , Fagocitose/fisiologia , Filogenia , Profilinas/classificação , Profilinas/genética , Profilinas/metabolismo , Isoformas de Proteínas/classificação , Isoformas de Proteínas/genética , Isoformas de Proteínas/metabolismo , Proteínas de Protozoários/classificação , Proteínas de Protozoários/metabolismo , Fatores de Virulência/classificação , Fatores de Virulência/genética , Fatores de Virulência/metabolismo , Calponinas
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