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Revista cuba inf méd ; 8(2)2008. tab, graf
Artigo em Inglês | CUMED | ID: cum-57978

RESUMO

Objetivos: comparar las predicciones teóricas con datos conocidos acerca de la proteína C enlazadora de Miosina (Myosin Binding Protein C, MyBPC). Metodos: Se aplicó un análisis por modelo de reconocimiento resonante (resonant recognition model, RRM) para estudiar un conjunto de secuencias MyBPC con el objetivo de identificar las frecuencias relevantes. Un análisis de sitios calientes con análisis de Fourier de “grano grueso” se aplicó para predecir las regiones que mayormente contribuyen a la función. Resultados: Se encontraron dos frecuencias características: f= 0.226, aparentemente asociada a la isoforma cardiaca de la proteína, y f= 0.3667, que corresponde a MyBPC de modo inespecífico. Las regiones críticas en la proteína que fueron predichas por el método incluyeron la región de fosforilación, así como otras áreas cercanas o que incluyen muchas de las mutaciones que provocan cardiopatía familiar. Una secuencia “artificial” con todas las mutaciones puntuales descritas reportadas en la literatura mostró un pico mucho menor en el pico f=0.226. Conclusiones: al menos existen dos frecuencias de RRM asociadas a la función de la MyBPC, siendo f=0.226 la mas específica para la función cardiaca. Aproximadamente el 15 por ciento de las mutaciones puntuales descritas que aparentemente conducen a cardiopatía hipertrófica, una inserción especifica de la isoforma cardiaca, dos sitios de fosforilación y una mutación que conduce a la desnaturalización irreversible del dominio C5, caen dentro de las regiones de mayor contribución a la frecuencia f=0.226. Los autores sugieren que un enfoque basado en RRM seria útil para explicar o predecir otras enfermedades asociadas a mutaciones(AU)


Aim: to compare theoretical predictions with known data about Myosin Binding Protein C (MBPC). Methods: resonant recognition model (RRM) analysis was performed on MBPC from different types in order to identify relevant frequencies. Coarse Grained hot spot Fourier analysis was used for predicting regions of the sequence with major contribution to the function. Results: Two characteristic frequencies were found: f= 0.226, apparently associated to the cardiac isoform and f= 0.3667, non-specifically correspondent to MBPC. Critical areas in the sequence were predicted for the region of phosphorylation as well as for areas where several of the most important disease-causing mutations have been described. An artificial “sequence” with all point mutations reported in literature leads to a significant reduction of the peak at f=0.226. Conclusions: at least two RRM frequencies are associated to MYBPC function, being f=0.226 the most specific for cardiac function.Nearly 15 percent of the point mutations purportedly associated to CMH4, a cardiac specific insert, two phosphorylation sites and a mutation leading to an irreversible denaturation of the dominion C5 fall into the regions of major contribution to f=0.226. Authors suggest that an RRM based approach could be useful for explaining or predicting other mutation-associated diseases(AU)


Assuntos
Mutação , Proteína C/análise , Miosinas Cardíacas/análise , Cardiopatias/patologia
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