Chemical and microbiological properties of Lake Aygir in Turkey and usage of drinking, fisheries, and irrigation / Propriedades químicas e microbiológicas do lago Aygir na Turquia e uso de bebidas, pescarias e irrigação

Abstract Since water is one of the essentials for life, the presence and quality of water in the habitat is extremely important. Therefore, water quality change and management of Lake Aygır was investigated in this study. For this, water samples collected from the lake and the irrigation pool between May 2015 and May 2016 were analyzed monthly. Spectrophotometric, titrimetric and microbiological methods were used to determine the water quality. According to some water quality regulations, HCO3, NH4, Cu, Mo, Br, fecal coliform and total suspended solid (TSS) values were found above the limit values. The other 29 parameters comply with Turkish national and international legislations. Lake Aygır was negatively affected by the surrounding settlements and agricultural activities. It is thought that the water resource should be monitored periodically and remedial studies should be done to prevent parameters exceeding the limits. However, Lake Aygır was generally suitable for drinking, use, fishing and irrigation.

Resumo Como a água é um dos elementos essenciais para a vida, a presença e a qualidade da água no habitat são extremamente importantes. Portanto, a mudança da qualidade da água e a gestão do lago Aygır foram investigadas neste estudo. Para isso, amostras de água coletadas no lago e na piscina de irrigação entre maio de 2015 e maio de 2016 foram analisadas mensalmente. Métodos espectrofotométricos, titulométricos e microbiológicos foram usados para determinar a qualidade da água. De acordo com alguns regulamentos de qualidade da água, os valores de HCO3, NH4, Cu, Mo, Br, coliformes fecais e total sólido suspenso (TSS) foram encontrados acima dos valores limite. Os outros 29 parâmetros estão em conformidade com as legislações nacionais e internacionais turcas. O lago Aygır foi afetado negativamente pelos assentamentos e atividades agrícolas ao redor. Pensa-se que o recurso hídrico deve ser monitorado periodicamente e estudos corretivos devem ser feitos para evitar que os parâmetros ultrapassem os limites. No entanto, o lago Aygır era geralmente adequado para beber, usar, pescar e irrigar.

The molecular investigations on the subgenus Artemisia Less. of the genus Artemisia L. (Asteraceae) in Turkey / Investigações moleculares sobre o subgênero Artemisia Less. do gênero Artemisia L. (Asteraceae) na Turquia

Abstract The genus Artemisia L. of the family Asteraceae is systematically very complex. The aim of this study was to evaluate taxonomic positions of taxa of the subgenus Artemisia belonging to the genus Artemisia in Turkey using some molecular techniques. In this molecular study, 44 individuals belong to 14 species of the subgenus Artemisia were examined. Analyses were performed on the combined dataset using maximum parsimony, maximum likelihood and Bayesian inference and Molecular parameters obtained from co-evaluations of sequences of the psbA-trnH, ITS and ETS regions of examined individuals were used in the phylogenetic tree drawing. According to the results of this study, two molecular groups have been formed based on the DNA sequence similarity of the species, but there are no obvious morphological characters corresponding to two molecular groups. There is no also agreement between the two molecular groups and the two morphological groups formed according to the hairiness condition of the receptacle of species. Due to the lack of molecular significance of their receptacles with or without hair, dividing of the subgenus Artemisia species into new subgenera or sections was not considered appropriate. Likewise, it has been found that with or without hair on the corolla lobes of the central hermaphrodite disc flowers have no molecular significance. It was found that there were no gene flow and hybridization between the 14 species of the subgenus Artemisia and these 14 species were found completed their speciation. This study is important as it is the first molecular based study relating with belong to subgenus Artemisia species growing naturally in Turkey. In addition, new haplotypes related to the populations of Turkey belonging to the subgenus Artemisia taxa were reported by us for the first time and added to the GenBank database.

Resumo O gênero Artemisia L. da família Asteraceae é sistematicamente muito complexo. O objetivo deste estudo foi avaliar as posições taxonômicas de táxons do subgênero Artemisia pertencentes ao gênero Artemisia na Turquia usando algumas técnicas moleculares. Neste estudo molecular, 44 indivíduos pertencentes a 14 espécies do subgênero Artemisia foram examinados. As análises foram realizadas no conjunto de dados combinado usando máxima parcimônia, máxima verossimilhança e inferência bayesiana e parâmetros moleculares obtidos a partir de coavaliações de sequências das regiões psbA-trnH, ITS e ETS de indivíduos examinados foram usados ​​no desenho da árvore filogenética. De acordo com os resultados deste estudo, dois grupos moleculares foram formados com base na similaridade da sequência de DNA das espécies, mas não há caracteres morfológicos óbvios correspondentes a dois grupos moleculares. Também não há concordância entre os dois grupos moleculares e os dois grupos morfológicos formados de acordo com a condição de pilosidade do receptáculo da espécie. Devido à falta de significado molecular de seus receptáculos com ou sem cabelo, a divisão das espécies do subgênero Artemisia em novos subgêneros ou seções não foi considerada apropriada. Da mesma forma, verificou-se que com ou sem cabelo nos lobos da corola das flores do disco hermafrodita central não tem significado molecular. Constatou-se que não houve fluxo gênico e hibridização entre as 14 espécies do subgênero Artemisia e essas 14 espécies concluíram sua especiação. Este estudo é importante porque é o primeiro estudo de base molecular relacionado com espécies pertencentes ao subgênero Artemisia crescendo naturalmente na Turquia. Além disso, novos haplótipos relacionados às populações da Turquia pertencentes ao subgênero Artemisia taxa foram relatados por nós pela primeira vez e adicionados ao banco de dados do GenBank.

Determining the proper sowing time for the mixture of Hungarian vetch and triticale under continental climate conditions / Determinação da época de semeadura adequada para a mistura de ervilhaca Húngara e triticale em condições climáticas continentais

The research was conducted to determine forage yield and some quality characteristics of Hungarian vetch + triticale mixture, sowed in five different times under rainfed conditions of Central Anatolia, Turkey. The mixture was sowed in the second, third and fourth week of October, and the first and the second week of November in 2017 and 2018. Depending on the sowing times, plant height (PH) of Hungarian vetch and triticale was between 46.7 and 59.4 cm, and 85.9 and 93.4 cm, respectively. Green forage yield (GFY) was between 1746.2 and 2059.4 kg da-1, dry matter yield (DMY) was between 541.0 and 707.6 kg da-1, crude protein yield (CPY) was between 80.4 and 110.3 kg da-1, digestible dry matter yield (DDMY) was between 340.8 and 453.9 kg da-1, acid detergent fiber (ADF) ratio was between 31.8 and 33.7%, neutral detergent fiber (NDF) ratio was between 44.7 and 49.5%, total digestible nutrient (TDN) was between 57.9 and 60.4% and relative feed value (RFV) was between 118.6 and 133.8. Sowing time had a significant effect (P < 0.05) on PH of triticale, while it has a very significant effect (P < 0.01) on GFY, DMY, CPY, DDMY, NDF ratios and RFV. Delaying the sowing time caused a decrease in the GFY, DMY and quality of the mixture. Results revealed that the first week of October is the most appropriate sowing time to obtain high dry matter yield with high quality under continental climate conditions of the Central Anatolia.

A pesquisa foi conduzida para determinar a produção de forragem e algumas características de qualidade da mistura de ervilhaca húngara + triticale, semeada em cinco épocas diferentes em regime de sequeiro na região Central da Anatólia, Turquia. A mistura foi semeada na segunda, terceira e quarta semanas de outubro, e na primeira e segunda semanas de novembro de 2017 e 2018. Dependendo da época de semeadura, a altura da planta (PH) da ervilhaca e triticale húngara foi entre 46,7 e 59,4 cm e 85,9 e 93,4 cm, respectivamente. O rendimento de forragem verde (GFY) ficou entre 1746,2 e 2059,4 kg da-1, o rendimento de matéria seca (DMY) foi entre 541,0 e 707,6 kg da-1, o rendimento de proteína bruta (CPY) foi entre 80,4 e 110,3 kg da-1, digestível seco o rendimento de matéria (DDMY) estava entre 340,8 e 453,9 kg da-1, a proporção da fibra em detergente ácido (FDA) estava entre 31,8 e 33,7%, a proporção da fibra em detergente neutro (FDN) estava entre 44,7 e 49,5%, o nutriente digestível total (NDT) era entre 57,9 e 60,4% e o valor relativo da alimentação (RFV) foi entre 118,6 e 133,8. A época de semeadura teve um efeito significativo (P < 0,05) no PH do triticale, enquanto teve um efeito muito significativo (P < 0,01) nas relações GFY, DMY, CPY, DDMY, FDN e RFV. O atraso na semeadura ocasionou diminuição no GFY, DMY e na qualidade da mistura. Os resultados revelaram que a primeira semana de outubro é a época de semeadura mais adequada para a obtenção de alta produtividade de matéria seca com alta qualidade nas condições climáticas continentais da Anatólia Central.

An assessment of the urban water footprint and blue water scarcity: A case study for Van (Turkey) / Uma avaliação da pegada hídrica urbana e da escassez de água azul: um estudo de caso para Van, Turquia

Today, most of the world's population faces water scarcity, while global warming, urbanization, industrialization and population increases continue to increase the severity of the pressure on water resources. Management of water resources plays a key role in the sustainability of agricultural production. The water footprint (WF) is different in comparison to other water statistics because it takes direct and indirect water consumption into account, and helps in the management of water resources. Within this context, the WF of Van province, which is Turkey's most easterly located arid region, was calculated from 2004 to 2019. The study area covers lake Van, which is Turkey's largest lake, and the Van basin with an area of 23.334km2 and a population of 1.136.757 (2019). In the calculations, crop (WFcrop), livestock (WFlivestock), and domestic and industrial water footprints (WFdomestic+industrial) were evaluated separately, and blue and green water footprints (WFblue and WFgreen) were analyzed in detail. According to the results, the average WF of Van province was found to be 8.73 billionm3 year-1. Throughout the province, 87.6% of the WF is composed of WFcrop, 4.9% is WFlivestock and 7.5% is WFdomestic+industrial. Of the WFcrop, 62.5% depends on WFblue, i.e., freshwater. Most of the WFlivestock consisted of dairy cattle (49%) and sheep (38%). The average WFdomestic+industrial for 2004 to 2019 was 0.64billion m3 year-1. The average per capita water footprint of Van province was found to be 889.9m3 year-1 capita-1. In addition, the province is classified as severe water scarcity (257%). This study is one of the first province-based calculations of WF in Turkey and is the first study to bring a different aspect to published literature by including residual soil moisture from the winter months. As a result of this study, the WFblue of the WFcrop is above the worldwide average and should be reduced by changing the crop pattern or synchronizing the planting and harvest dates of the crops to a period that benefits from precipitation. In addition, this study is expected to contribute to new studies for calculating the provincial scale WF and will have positive effects on agricultural planning, water allocation and the sustainability of water resources.

Hoje, a maior parte da população mundial enfrenta a escassez de água, enquanto o aquecimento global, a urbanização, a industrialização e o crescimento da população continuam a aumentar a gravidade da pressão sobre os recursos hídricos. A gestão dos recursos hídricos desempenha papel fundamental na sustentabilidade da produção agrícola. A pegada hídrica (WF) é diferente em comparação com outras estatísticas hídricas porque leva em consideração o consumo direto e indireto de água e auxilia na gestão dos recursos hídricos. Nesse contexto, o WF da província de Van, que é a região árida localizada mais a leste da Turquia, foi calculado de 2004 a 2019. A área de estudo cobre o lago Van, que é o maior lago da Turquia, e a bacia de Van, com uma área de 23,334 km2 e uma população de 1.136.757 (2019). Nos cálculos, as pegadas hídricas de safra (WFcrop), pecuária (WFlivestock) e doméstica e industrial (WFdomestic+industrial) foram avaliadas separadamente, e as pegadas hídricas azul e verde (WFblue e WFgreen) foram analisadas em detalhes. De acordo com os resultados, o WF médio da província de Van foi encontrado em 8,73 bilhões de m3 ano-1. Em toda a província, 87,6% do WF são compostos por WFcrop, 4,9% são WFlivestock e 7,5% são WFdomestic+industrial. Do WFcrop, 62,5% dependem do WFblue, ou seja, de água doce. A maior parte do gado WFlivestock era composto por gado leiteiro (49%) e ovelhas (38%). O WFdomestic+industrial médio de 2004 a 2019 foi de 0,64 bilhão de m3 ano-1. A pegada hídrica per capita média da província de Van foi encontrada em 889,9 m3 ano-1 capita-1. Além disso, a região é classificada como grave escassez de água (257%). Este estudo é um dos primeiros cálculos de WF baseados em províncias na Turquia e é o primeiro estudo a trazer um aspecto diferente para a literatura publicada, incluindo a umidade residual do solo dos meses de inverno. Como resultado deste estudo, o WFblue do WFcrop está acima da média mundial e deve ser reduzido alterando o padrão de cultivo ou sincronizando as datas de plantio e colheita das safras para um período que se beneficie da precipitação. Além disso, espera-se que este estudo contribua para novos estudos para o cálculo da escala provincial WF e terá efeitos positivos no planejamento agrícola, alocação de água e a sustentabilidade dos recursos hídricos.

Biochemical parameters and antioxidant property of three Salvia L. taxa endemic in Turkey / Parâmetros bioquímicos e propriedade antioxidante de três espécies de Salvia L. endêmicos da Turquia

The aim of the present study was to determine and compare the fatty acids, lipid soluble vitamins, sterols, phenolics, and antioxidant capacities of three endemic Salvia L. taxa (S. euphratica var. Montbret & Aucher ex Bentham leiocalycina (Rech. Fil.) Hedge, S. euphratica var. Montbret & Aucher ex Bentham euphratica (Rech. Fil.) Hedge and S. pseudoeuphratica Rech.Fil.) and to evaluate these results systematically. The fatty acid compositions were determined by using gas chromatography, while the lipid soluble vitamins, sterols, and phenolics were determined by using HPLC. Also, the antioxidant capacities of three Salvia taxa were measured in vitro. Palmitic acid was found as major saturated fatty acid while oleic acid, linoleic acid, α-linolenic acid, and erucic acid were found as major unsaturated fatty acids in the present study. It was found that S. euphratica var. euphratica had lower palmitic acid (8.94 ± 0.71%), total saturated fatty acid (19.16 ± 0.15%), and higher unsaturated fatty acid content (82.08 ± 0.52%) than other studied taxa. Furthermore, it was shown that S. euphratica var. euphratica had different 18.3/18:2 (0.36) unsaturated/saturated fatty acid (4.28) ratios. However, this study demonstrated that Salvia taxa had low lipid soluble vitamins, sterol contents. On the other hand, it was shown that Salvia taxa had similar catechin (509.2 ± 4.21 µg/g and 552.2 ± 9.21 µg/g) and vanillic acid amounts (351.2 ± 2.17 µg/g and 396.8 ± 4.1 µg/g) in this study. And also, it was found that Salvia taxa had high rosmarinic acid content while S. euphratica var. leiocalycina had the highest rosmarinic acid content (1480 ± 7.57 µg/g). On the other hand, it was shown that the two ferulic acid contents of S. euphratica varieties were higher (1175 ±/5.21 µgmg-1740.2 ± 4.82 µg/mg) than the ferulic acid content of S. pseudoeuphratica of which was the lowest (19.2 ± 0.97 µg/mg). The present results suggested that the biochemical results guided the morphological studies, and Salvia taxa have a potent antioxidant capacity.

O objetivo do presente estudo foi determinar e comparar os ácidos graxos, vitaminas lipossolúveis, esteróis, fenóis e capacidades antioxidantes de três espécies endêmicas de Salvia L. (S. euphratica var. Montbret & Aucher ex Bentham leiocalycina (Rech. Fil.) Hedge, S. euphratica var. Montbret & Aucher ex Bentham euphratica (Rech. Fil.) Hedge e S. pseudoeuphratica Rech.Fil.) e avaliar esses resultados sistematicamente. As composições de ácidos graxos foram determinadas por cromatografia gasosa, enquanto as vitaminas lipossolúveis, esteróis e fenóis foram determinadas por HPLC. Além disso, as capacidades antioxidantes das três espécies de Salvia foram medidas in vitro. O ácido palmítico foi encontrado como ácido graxo saturado principal, enquanto o ácido oleico, ácido linoleico, ácido α-linolênico e ácido erúcico foram encontrados como principais ácidos graxos insaturados no presente estudo. Verificou-se que S. euphratica var. euphratica tem menor teor de ácido palmítico (8.94 ± 0.71%) e ácido graxo saturado total (19.16 ± 0.15%) e maior teor de ácidos graxos insaturados (82.08 ± 0.52%) do que as outras espécies estudadas. Além disso, foi demonstrado que a S. euphratica var. euphratica apresentou diferentes proporções 18:3/18:2 (0.36) de ácidos graxos insaturados/saturados (4.28). No entanto, este estudo demonstrou que o gênero Salvia tinha baixo teor de vitaminas lipossolúveis e baixo conteúdo de esteróis. Por outro lado, foi demonstrado que as espécies do gênero Salvia contém quantidades de catequinas (509.2 ± 4,21 µg/mg-552.2 ± 9.21 µg/mg) e ácido vanílico semelhantes (351.2 ± 2.17 µg/mg 396,8 ± 4,1 µg/mg). Descobriu-se também que o gênero Salvia tinha alto conteúdo de ácido rosmarínico enquanto a espécie S. euphratica var. leiocalycina apresentou o maior teor desse ácido (1.480 ± 7.57 µg/g). Por outro lado, foi demonstrado que os teores de ácido ferúlico da espécie S. eupratica foram maiores (1.175 ± 5.21 µg/mg-1740.2 ± 4.82 µg/mg) do que o conteúdo de ácido ferúlico da espécie S. pseudoeuphratica dos quais foi o mais baixo (19.2 ± 0.97 µg/mg). Os resultados atuais sugerem que os resultados bioquímicos orientaram os estudos morfológicos e as espécies de Salvia têm uma potente capacidade antioxidante.

An investigation on the chloroplast and nuclear genomes of taxa belong to the subgenus Dracunculus (Bess.) Rydb. of Artemisia L. (Asteraceae) in Turkey / Uma investigação sobre o cloroplasto e os genomas nucleares de táxons pertencentes ao subgênero Dracunculus (Bess.) Rydb. de Artemisia L. (Asteraceae) na Turquia

Artemisia is one of the biggest genera in the family Asteraceae, with around 500-600 taxa at specific and subspecific levels and organised in 5 subgenera. Due to the high number of taxa, a lot taxonomists are trying to solve the problem of its classification and phylogeny but its natural classification still hasn't been achieved. In this research, 60 individuals belonging to 4 taxa of the subgenus Dracunculus of Artemisia L. in Turkey were examined. For all the examined individuals from both the same and different populations belonging to the taxa of the subgenus Dracunculus, the sequences of the regions both psbA-trnH of chloroplast DNA and ITS of nuclear DNA were determined. Also, the gene regions obtained were recorded in the NCBI GenBank database and an accession number was taken. It was found that there was no gene flow and hybridization between the four studied taxa of the subgenus Dracunculus, and these 4 taxa also completed their speciation. According to the results of this molecular study, A. campestris var. campestris, A. campestris var. marschalliana and A. campestris var. araratica were proposed to be raised from the variety level to the species level. This research is important as it is the first molecular based study relating with the subgenus Dracunculus growing in Turkey.

Artemisia é um dos maiores gêneros da família Asteraceae, com cerca de 500 a 600 táxons em níveis específicos e subespecíficos e organizados em cinco subgêneros. Em razão do grande número de táxons, muitos taxonomistas estão tentando resolver o problema de sua classificação e filogenia, mas sua classificação natural ainda não foi alcançada. Nesta pesquisa, 60 indivíduos pertencentes a quatro táxons do subgênero Dracunculus de Artemisia L. na Turquia foram examinados. Para todos os indivíduos examinados de populações iguais e diferentes pertencentes aos táxons do subgênero Dracunculus, foram determinadas as sequências das regiões psbA-trnH do DNA do cloroplasto e ITS do DNA nuclear. Além disso, as regiões gênicas obtidas foram registradas no banco de dados do NCBI GenBank e um número de acesso foi obtido. Foi constatado que não houve fluxo gênico nem hibridização entre os quatro táxons estudados do subgênero Dracunculus, os quais também completaram sua especiação. De acordo com os resultados deste estudo molecular, A. campestris var. campestris, A. campestris var. marschalliana e A. campestris var. araratica foram propostos para ser elevados do nível de variedade para o nível de espécie. Esta pesquisa é importante porque é o primeiro estudo de base molecular relacionado com o subgênero Dracunculus em crescimento na Turquia.

Measurement of resource use efficiency in corn production: a two-stage data envelopment analysis approach in Turkey / Medição da eficiência do uso de recursos na produção de milho: uma abordagem de análise de dados em duas fases na Turquia

This research analyzed the efficiency situation of corn farms operating in the Adana province of Turkey. In this context, required farm management data were collected from 111 corn farmers by using face to face survey method during the 2019-2020 cultivation season. To determine the technical efficiency (TE) levels of corn farms, Data Envelopment Analysis (DEA) was applied. Furthermore, factors that cause the inefficiency in corn farms were detected by using the Tobit regression model. According to research results, the average TE levels of corn farms in the research area under the variable return to scale conditions are reported as 0.887 (111 farms). These results suggested that if farms reduced their input use by 11.3% on average, they can achieve the same output level and be able to reach full technical efficiency. The most ineffective source in terms of farms performance is machine expenditures with 68.2% of excessive use followed by labor use. In this regard, mechanization modernization, education and training of the labor force and more sensitive fertilizers and pesticide use can increase the efficiency of corn farms. Results of the Tobit regression model indicated that factors such as experience, education, number of tractors and size of the irrigated area positively influenced the TE, whereas family size in corn farming has a negative effect.

Esta pesquisa tem como objetivo analisar a situação de eficiência das fazendas de milho operando na província de Adana, na Turquia. Neste contexto, os dados necessários de gestão da fazenda foram coletados de 111 produtores de milho usando o método de pesquisa frente a frente durante a temporada de cultivo de 2019-2020. Para determinar os níveis de eficiência técnica (TE) das fazendas de milho, foi aplicada a Análise Envoltória de Dados (DEA). Além disso, os fatores que causam a ineficiência nas fazendas de milho foram detectados por meio do modelo de regressão Tobit. De acordo com os resultados da pesquisa, os níveis médios de TE das fazendas de milho na área de pesquisa sob as condições de retorno variável à escala são encontrados em 0,887 (111 fazendas). Esses resultados sugerem que, se as fazendas reduzirem o uso de insumos em 11,3% em média, podem atingir o mesmo nível de produção e alcançar eficiência técnica plena. A fonte mais ineficaz em termos de desempenho das fazendas são os gastos com máquinas, com 68,2% do uso excedente continuado com o uso de mão de obra. Nesse sentido, a mecanização, a modernização, a educação e o treinamento da força de trabalho e o uso de fertilizantes e pesticidas mais sensíveis podem ser sugeridos para aumentar a eficiência das fazendas de milho. Os resultados do modelo de regressão Tobit indicam que fatores como experiência, escolaridade, número de tratores e tamanho da área irrigada influenciaram positivamente no TE, enquanto o tamanho da família na cultura do milho tem efeito negativo.

Genomic characterization, antimicrobial resistance profiles, enterotoxin, and biofilm production of methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolated from clinical and animal products origins in Eastern Turkey / Caracterização genômica perfis de resistência antimicrobiana, produção de enterotoxinas e biofilme Staphylococcus aureus resistente à meticilina isolado de origem clínica e de produtos de origem animal no leste da Turquia

Staphylococcus aureus is an opportunistic and ubiquitous pathogen found in the skin, nares, and mucosal membranes of mammals. Increasing resistance to antimicrobials including methicillin has become an important public concern. One hundred and eight (108) S. aureus strains isolated from a total of 572 clinical and animal products samples, were investigated for their biofilm capability, methicillin resistance, enterotoxin genes, and genetic diversity. Although only one strain isolated from raw retail was found as a strong biofilm producer, the percentage of antimicrobial resistance pattern was relatively higher. 17.59% of S. aureus strains tested in this study were resistant to cefoxitin and identified as methicillin-resistant S. aureus (MRSA) isolates. mecA and mecC harboring S. aureus strains were detected at a rate of 2.79% and 0.93%, respectively. In addition, staphylococcal enterotoxin genes including Sea, Seb, Sec, and Sed genes were found to be 18.5%, 32.4%, 6.5% and 3.7%, respectively. The phylogenetic relationship among the isolates showed relationship between joint calf and cow milk isolates. Multi locus sequence typing (MLST) revealed three different sequence types (STs) including ST84, ST829, and ST6238. These findings highlight the development and spread of MRSA strains with zoonotic potential in animals and the food chain throughout the world.

Staphylococcus aureus é um patógeno dúctil e ubíquo encontrado na pele, narinas e membranas mucosas de mamíferos. O aumento da resistência aos antimicrobianos, incluindo a meticilina, tornou-se uma importante preocupação pública. Cento e oito (108) cepas de S. aureus isoladas de um total de 572 amostras clínicas e de produtos animais foram investigadas por sua capacidade de biofilme, resistência à meticilina, genes de enterotoxinas e diversidade genética. Embora apenas uma cepa isolada do cru tenha sido encontrada como forte produtora de biofilme, a porcentagem do padrão de resistência antimicrobiana foi relativamente maior. Parte das cepas (17,59%) de S. aureus testadas neste estudo eram resistentes à cefoxitina e identificadas como isolados de MRSA. mecA e mecC abrigando cepas de S. aureus foram detectados a uma taxa de 2,79% e 0,93%, respectivamente. Além disso, verificou-se que os genes da enterotoxina estafilocócica, incluindo os genes Sea, Seb, Sec e Sed, eram 18,5%, 32,4%, 6,5% e 3,7%, respectivamente. A relação filogenética entre os isolados mostrou relação entre os isolados de bezerro e leite de vaca. A tipagem de sequência multiloco (MLST) revelou três tipos de sequência diferentes (STs), incluindo ST84, ST829 e ST6238. Essas descobertas destacam o desenvolvimento e a disseminação de cepas de MRSA com potencial zoonótico em animais e na cadeia alimentar em todo o mundo.

Estimation of genetic parameters and relationships between type traits and milk yield of Holstein cows in Turkey / [Estimativa de parâmetros genéticos e relações entre características de tipo e produção de leite das vacas Holstein na Turquia]

In this study, milk yield, reproductive yield, and type traits of 533 Holstein cows in the first lactation raised in 54 farms were examined. In the three-year study, phenotypic (rP) and genetic (rG) correlations between type traits and milk yield were estimated based on the variance elements and heritability of the type traits of Holstein cows in the first lactation. Linear identification and scoring systems have been applied to classify the cows according to type traits. Heritability and correlations were estimated with ASREML models. The type traits included stature, angularity, rump width, hocks, rear udder height, central ligament, teat length, body capacity, feet and legs, udder composite and final score for genetic correlations with 305-day milk yield were estimated as -0.49, -0.14, -0.93, 0.35, 0.40, 0.11, -0.65, 0.70, 0.31, 0.54, and 0.70, for phenotypic correlations were estimated as 0.28, 0.28, 0.30, 0.21, 0.35, 0.39, -0.06, 0.46, 0.48, 0.56, and 0.58 respectively. Among the phenotypic correlations between the type traits, especially the phenotypic correlations between the final score and various type traits were found to be high and significant. The fact that these traits are in high correlation with other traits and milk yield may enable these to be used as indirect selection criteria in the selection for milk yield.(AU)

Neste estudo, foram examinadas a produção de leite, a produção reprodutiva e as características de tipo de 533 vacas Holstein na primeira lactação criadas em 54 fazendas. No estudo trienal, as correlações fenotípicas (rP) e genéticas (rG) entre características de tipo e produção de leite foram estimadas com base nos elementos de variação e hereditariedade das características de tipo das vacas Holstein na primeira lactação. Sistemas de identificação linear e de pontuação foram aplicados para classificar as vacas de acordo com os traços de tipo. A hereditariedade e correlações foram estimadas com os modelos ASREML. Os traços de tipo incluíam estatura, angularidade, largura da alcatra, jarretes, altura do úbere traseiro, ligamento central, comprimento das tetas, capacidade corporal, pés e patas, composição do úbere e pontuação final para correlações genéticas com a produção de leite de 305 dias foram estimados como -0. 49, -0,14, -0,93, 0,35, 0,40, 0,11, -0,65, 0,70, 0,31, 0,54, e 0,70, para correlações fenotípicas foram estimadas como 0,28, 0,28, 0,30, 0,21, 0,35, 0,39, -0,06, 0,46, 0,48, 0,56, e 0,58 respectivamente. Dentre as correlações fenotípicas entre os traços de tipo, especialmente as correlações fenotípicas entre a pontuação final e vários traços de tipo foram encontradas como altas e significativas. O fato destes traços estarem em alta correlação com outros traços e a produção de leite pode permitir que sejam usados como critérios de seleção indiretos na seleção para a produção de leite.(AU)

Linear modeling analysis using for determining the factors affecting 305-day milk yield / [Análise de modelagem linear usado para determinar os fatores que afetam o rendimento leiteiro de 305 dias]

The purpose of this study was to model the factors affecting the 305-day milk yield of dairy cows by using Automatic Linear Modeling Technique (ALM). The data set of this study consisted of eight different cow breeds grown in eight province of Turkey. Results of ALM showed that the accuracy of the model was 64.2 % means that 64.2% of the variation in the 305-day milk yield could be explained by the constructed model. Created model was consisted of four factors namely the Breed, Lactation Length, Parity, and Province. Therefore, those selected factors were more efficient than the others in predicting the 305-day milk yield.(AU)

O objetivo deste estudo foi modelar os fatores que afetam a produção de leite das vacas leiteiras em 305 dias, utilizando a Técnica de Modelagem Linear Automática (ALM). O conjunto de dados deste estudo consistia em oito raças diferentes de vacas cultivadas em oito províncias da Turquia. Os resultados da ALM mostraram que a precisão do modelo era de 64,2% significa que 64,2% da variação na produção de leite de 305 dias poderia ser explicada pelo modelo construído. O modelo criado consistia de quatro fatores: Raça, Comprimento da Lactação, Paridade e Província. Portanto, esses fatores selecionados foram mais eficientes do que os outros na previsão da produção de leite de 305 dias.(AU)

Motile aeromonad septicemia (MAS) at Cyprinus carpio L, 1758 (Actinopterygii: Cyprinidae) in Lake Tödürge (Sivas/Turkey) / [Septicemia móvel por aeromonada (SMA) em Cyprinus carpio L, 1758 (Actinopterygii: Cyprinidae) no lago Tödürge (Sivas, Turquia)]

In this study, fish's morphologic and anatomic lesions caused by motile aeromonad septicemia (MAS) depending on environmental stress in carp, Cyprinus carpio population living in Lake Tödürge were identified. Various morphological and anatomical deformations and lesions were observed in the body of approximately 17% (252 fish specimens) of a total of 1488 carp samples. Bacteria are grown from all wipe samples. Bacterial colonies have a gray-white appearance with round, convex and smooth edges. 15-20 cfu colonies were observed in each aerop culture. As a result of analysis of wet wipe samples from infected fish's skin, gill, kidney and liver, it is determined that the bacteria which causes septicemia is Aeromonas sobria from the Aeromonadaceae family (with 99.2% confidence value). No bacteria were grown in cultures except A. sobria. Some symptoms of the infection are inflammation on different parts of the fish bodies, eruption on skin and scales, dermal necrosis, degeneration at soft rays of the fins, exophthalmos, and purulent liquid accumulation in the abdominal cavity, etc. Infected fish were most commonly encountered in July and August (water temperature above 20ºC), the lowest in October and November (water temperature below 10ºC).(AU)

Neste estudo, foram identificadas lesões morfológicas e anatômicas causadas por septicemia móvel por aeromônios (MPA), dependendo do estresse ambiental da carpa, a população de Cyprinus carpio que vive no lago Tödürge foi identificada. Várias deformações e lesões morfológicas e anatômicas foram observadas no corpo de aproximadamente 17% (252 amostras de peixes) de um total de 1488 amostras de carpa. As bactérias são cultivadas a partir de todas as amostras de limpeza. As colônias bacterianas têm uma aparência branco-acinzentada, com bordas arredondadas, convexas e lisas. Foram observadas 15-20 colônias de UFC em cada cultura de aerop. Como resultado da análise de amostras de lenços umedecidos da pele, brânquias, rins e fígado de peixes infectados, é determinado que a bactéria que causa a septicemia é a Aeromonas sobria, da família Aeromonadaceae (com valor de confiança de 99,2%). Nenhuma bactéria foi cultivada em culturas, exceto A. sobria. Alguns sintomas da infecção são inflamação em diferentes partes dos corpos dos peixes, erupção na pele e escamas, necrose dérmica, degeneração aos raios moles das barbatanas, exoftalmia e acúmulo de líquido purulento na cavidade abdominal, entre outros. Os peixes infectados eram encontrados com maior frequência em julho e agosto (temperatura da água acima de 20ºC), e eram menos comumente encontrados em outubro e novembro (temperatura da água abaixo de 10ºC).(AU)

A new maximum size record of the shi drum (Umbrina cirrosa Linnaeus, 1758) for Aegean Sea / Um novo registro de tamanho máximo do corvina (Umbrina cirrosa Linnaeus, 1758) para o Mar Egeu

The present study has been conducted to find out new findings on maximum length and weight values of Umbrina cirrosa in the Bay of Saros (Northern Aegean Sea, Turkey). On September, 11, 2016, a single specimen of Umbrina cirrosa with 68.8 cm total length and 2600.00 g total weight was caught by handline at a depth of 20 m. The provable size is the second largest length ever reported in the all seas of the world.

O presente estudo foi realizado para descobrir novas descobertas sobre os valores máximos de comprimento e peso de Umbrina cirrosa na Baía de Saros (Mar Egeu do Norte, Turquia). Em 11 de setembro de 2016, um único espécime de Umbrina cirrosa com 68.8 cm de comprimento total e 2600.00 g de peso total foi capturado por linha de mão a uma profundidade de 20 m. O tamanho provável é o segundo maior comprimento já registrado em todos os mares do mundo.

The relationship between consumption of animal products and expenditure levels with Quality of Life Scores (SF-36) by veterinary students in Turkey / [A relação entre o consumo de produtos de origem animal e níveis de gasto com Scores de Qualidade de Vida (SF-36) por alunos de veterinária na Turquia]

The present study aimed to calculate the quality of life scores (Short Form-36) of veterinary students in Turkey and review their scores with regards to different socio-demographic characteristics. A total of 1211 students studying veterinary medicine in 26 different faculties in Turkey were selected by stratified sampling method and were asked questions concerning their consumption of and expenditures on foods of animal origin using the SF-36 questionnaire between October and December 2018. Significant differences were found between SF-36 components in terms of year level, gender, accommodation status, income level, and level of expenditures on foods and foods of animal origin (P<0.01). With the increase in the size of the budget set aside for animal products, the scores in the domains of physical functioning, vitality, mental health, pain, and general health perception also enhanced, and statistically significant differences were found (P<0.01). The low quality of life scores of the veterinary students can be improved by increasing their income level and consumption of foods of animal origin. This will ensure that they are energetic and have the desired level of mental and general health perceptions.(AU)

O presente estudo teve como objetivo calcular os escores de qualidade de vida (SF-36) de estudantes de veterinária na Turquia e revisar seus escores no que diz respeito a diferentes características sociodemográficas. Um total de 1211 estudantes de medicina veterinária em 26 faculdades diferentes na Turquia foram selecionados pelo método de amostragem estratificada e foram questionadas sobre o consumo e as despesas com alimentos de origem animal usando o questionário SF-36 entre outubro e dezembro de 2018. Diferenças significativas foram encontradas entre os participantes do SF-36 em termos de nível do ano, gênero, status de acomodação, nível de renda e nível de gastos com alimentos e alimentos de origem animal (P <0,01). Com o aumento do orçamento reservado para produtos de origem animal, as pontuações nos domínios de funcionamento físico, vitalidade, saúde mental, dor e percepção geral de saúde também aumentaram e foram encontradas diferenças estatisticamente significativas (P <0,01). Os baixos índices de qualidade de vida dos veterinários podem ser melhorados, aumentando o nível de renda e o consumo de alimentos de origem animal. Isso garantirá mais energia e que tenham o nível desejado de percepção mental e geral de saúde.(AU)