Molecular profiling of bacterial blight resistance in Malaysian rice cultivars / Perfil molecular da resistência à ferrugem bacteriana em cultivares de arroz da Malásia

Bacteria blight is one of the most serious bacterial diseases of rice worldwide. The identification of genetic potential against bacterial blight in the existing rice resources is a prerequisite to develop multigenic resistance to combat the threat of climate change. This investigation was conducted to evaluate alleles variation in 38 Malaysian cultivars using thirteen Simple Sequences Repeats markers and one Sequence Tagged Sites (STS) marker which were reported to be linked with the resistance to bacterial blight. Based on molecular data, a dendrogram was constructed which classified the rice cultivars into seven major clusters at 0.0, 0.28 and 0.3 of similarity coefficient. Cluster 5 was the largest group comprised of ten rice cultivars where multiple genes were identified. However, xa13 could not be detected in the current rice germplasm, whereas xa2 was detected in 25 cultivars. Molecular analysis revealed that Malaysian rice cultivars possess multigenic resistance.

A ferrugem bacteriana é uma das doenças bacterianas mais graves do arroz em todo o mundo. A identificação do potencial genético contra a ferrugem bacteriana nos recursos de arroz existentes é um pré-requisito para desenvolver resistência multigênica no combate à ameaça da mudança climática. Esta investigação foi conduzida para avaliar a variação de alelos em 38 cultivares da Malásia usando 13 marcadores Simple Sequences Repeats (SSR) e 1 marcador Sequence Tagged Sites (STS), que foram relatados como associados à resistência à ferrugem bacteriana. Com base em dados moleculares, foi construído um dendrograma que classificou as cultivares de arroz em sete grandes agrupamentos a 0,0, 0,28 e 0,3 de coeficiente de similaridade. O Cluster 5 foi o maior grupo composto por 10 cultivares de arroz, no qual múltiplos genes foram identificados. No entanto, xa13 não pôde ser detectado no germoplasma atual de arroz, enquanto xa2 foi detectado em 25 cultivares. A análise molecular revelou que as cultivares de arroz da Malásia possuem resistência multigênica.

Optimal alarm system applied in coffee rust / Sistema de alarme ótimo aplicado na ferrugem do café

Alarm systems have very great utility in detecting and warning of catastrophes. This methodology was applied via TARSO model with Bayesian estimation, serving as a forecasting mechanism for coffee rust disease. The coffee culture is very susceptible to this disease causing several records of incidence in most cultivated crops. Researches involving this limiting factor for production are intense and frequent, indicating environmental factors as responsible for the epidemics spread, which does not occur if these factors are not favorable. The fitting type used by the a posteriori probability, allows the system to be updated each time point. The methodology was applied to the rust index series in the presence of the average temperature series. Thus, it is possible to verify the alarm resulted or in a high catastrophe detection in points at which the catastrophe has not occurred, or in the low detections if the point was already in the catastrophe state.(AU)

Os sistemas de alarme ótimos têm tido grande utilidade na detecção e advertência de ocorrência de catástrofes. Essa metodologia foi aplicada via modelo TARSO com ajuste bayesiano, servindo como mais um mecanismo de previsão para a doença ferrugem do café. A cultura cafeeira é muito suscetível ao ataque dessa doença, existindo registros de incidência na maioria das lavouras cultivadas. Pesquisas envolvendo esse fator limitante para a produção são intensas e frequentes, indicando os fatores ambientais como responsáveis pelo alastramento de epidemias, que não ocorrem se esses fatores não forem favoráveis. O tipo de ajuste utilizado por meio das probabilidades a posteriori, permitem que o sistema seja atualizado a cada ponto do tempo. A metodologia foi aplicada à série de índice de ferrugem na presença da série de temperatura média sendo possível verificar que o alarme resultou em uma detecção de catástrofe alta em pontos nos quais a catástrofe ainda não ocorreu e em detecções baixas se o ponto já estava no estado de catástrofe.(AU)

Optimal alarm system applied in coffee rust / Sistema de alarme ótimo aplicado na ferrugem do café

Alarm systems have very great utility in detecting and warning of catastrophes. This methodology was applied via TARSO model with Bayesian estimation, serving as a forecasting mechanism for coffee rust disease. The coffee culture is very susceptible to this disease causing several records of incidence in most cultivated crops. Researches involving this limiting factor for production are intense and frequent, indicating environmental factors as responsible for the epidemics spread, which does not occur if these factors are not favorable. The fitting type used by the a posteriori probability, allows the system to be updated each time point. The methodology was applied to the rust index series in the presence of the average temperature series. Thus, it is possible to verify the alarm resulted or in a high catastrophe detection in points at which the catastrophe has not occurred, or in the low detections if the point was already in the catastrophe state.

Os sistemas de alarme ótimos têm tido grande utilidade na detecção e advertência de ocorrência de catástrofes. Essa metodologia foi aplicada via modelo TARSO com ajuste bayesiano, servindo como mais um mecanismo de previsão para a doença ferrugem do café. A cultura cafeeira é muito suscetível ao ataque dessa doença, existindo registros de incidência na maioria das lavouras cultivadas. Pesquisas envolvendo esse fator limitante para a produção são intensas e frequentes, indicando os fatores ambientais como responsáveis pelo alastramento de epidemias, que não ocorrem se esses fatores não forem favoráveis. O tipo de ajuste utilizado por meio das probabilidades a posteriori, permitem que o sistema seja atualizado a cada ponto do tempo. A metodologia foi aplicada à série de índice de ferrugem na presença da série de temperatura média sendo possível verificar que o alarme resultou em uma detecção de catástrofe alta em pontos nos quais a catástrofe ainda não ocorreu e em detecções baixas se o ponto já estava no estado de catástrofe.

Occurrence of white rust (Albugo ipomoeae-panduratae) on Ipomoea acuminata in the brazilian mid-west

Spontaneous plants of Ipomoea acuminata ("morning glory") exhibiting white rust pustules were found in a field crop area of Planaltina, DF, in the fall season of 2010 and the disease causal agent was identified as Albugo ipomoea-panduratae (Oomycota). No reports of the association between A. ipomoea-panduratae and I. acuminata were known in Brazil previously to 2010. A reference specimen was deposited at the University of Brasilia Mycological Reference Collection.

The exploration of the antibacterial mechanism of fe3+ against bacteria

This study demonstrated that the bacteria could adsorb Fe3+ and reduce Fe3+ to Fe2+. Iron had significant bacteriostatic effects, which were directly proportional to the iron concentration and under the influence of pH and chelator. It presumed that the inhibition of Fe3+ acts through the formation of hydroxyl free radicals.

Tratamento de sementes de híbridos de milho com fluquinconazol / Effect of seed treatment in maize hybrids with fluquinconazol

A evolução na severidade e incidência das doenças na cultura do milho (Zea mays), tornou-se um entrave para o aumento da produtividade e da produção brasileira deste grão. Com isso o uso de fungicidas tem sido cada vez mais constante. O presente trabalho teve por objetivo avaliar o fungicida fluquinconazol em tratamento de sementes de diferentes híbridos de milho no controle da ferrugem comum e cercosporiose do milho. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados, em esquema fatorial 8 (híbridos) x 4 (doses de fungicida) com 3 repetições. Foram avaliadas a porcentagem de plântulas emergidas, a incidência, a severidade, a evolução das doenças, a área abaixo da curva de progresso da doença e também a tolerância dos híbridos às doenças ocorridas. Pelos resultados obtidos verificou-se que o uso de fluquinconazol no tratamento de sementes de milho é eficaz para diminuir a severidade e o progresso de cercosporiose e de ferrugem comum na dose de 0,34g i.a.500g de sementes-1. O uso de fluquinconazol no tratamento de sementes em milho reduziu a porcentagem de emergência em até 2,4%.

Desempenho de gotejadores utilizando água de baixa qualidade química e biológica / Drip lines performance using water of low chemical and biological quality

Esse trabalho objetivou identificar os principais fatores de entupimento em três modelos de tubogotejadores (M1, M2 e M3), caracterizar a qualidade da água utilizada na irrigação, bem como verificar os gêneros de bactérias causadoras de entupimento. Avaliou-se a uniformidade de aplicação de água, por meio da vazão e do Coeficiente de Uniformidade Estatístico (Us). Conclui-se que todos os parâmetros de qualidade da água analisados encontravam-se dentro dos padrões desejados, com exceção do ferro. Foram identificadas ferrobactérias dos gêneros Gallionella e Leptpthrix nos tubogotejadores. Após 700 h de funcionamento do sistema, a vazão dos tubogotejadores M1 e M2 reduziu 26,13 e 27,4%, respectivamente, e o modelo M3 apresentou um incremento de 1%. Os valores de Us apresentaram reduções de 28,35; 16,25 e 12,5% para os modelos M1, M2 e M3, respectivamente.

This work objectified to identify to the main causes of clogging in three models of drip lines (M1, M2 and M3), to characterize the quality of the water used in the irrigation, as well as verifying the gender of ironbacterias causing of clogging. The uniformity of application of water was evaluated, through the discharge and the Coefficient of Statistic Uniformity (Us). In accordance with the gotten results concluded that all of the parameters of quality of the water analyzed met inside of the wanted patterns, except for the iron. The gender Gallionella and Leptpthrix had been identified in drip lines. After 700 h of operation, the discharge of the drip lines M1 and M2 reduced 26,13 and 27,4%, respectively, and increased 1% for M3. The reductions in the values of Us for model M1, M2 and M3: 28,35; 16,25 and 12,5%.

Iron-depletion prevents biofilm formation in Pseudomonas aeruginosa through twitching motility and quorum sensing

Influence of iron-depletion on twitching motility and quorum sensing (QS) system in P. aeruginosa was evaluated. The results demonstrated iron-depletion can retard biofilm formation and increase the twitching motility and expression of QS-related genes, suggesting a potential interaction between twitching motility and QS system in P. aeruginosa biofilm formation.

Corrosión e incrustación microbiológica en sistemas de captación y conducción de agua : Aspectos teóricos y aplicados

Analiza aspectos básicos de los fenómenos biológicos de incrustación y corrosión de las perforaciones, así como de su construcción, acabado, mantenimiento, rehabilitación y reconstrucción.Incluye bibliografía

Corrosión e incrustación microbiológica en sistemas de captación y conducción de agua : Aspectos teóricos y aplicados

Analiza aspectos básicos de los fenómenos biológicos de incrustación y corrosión de las perforaciones, así como de su construcción, acabado, mantenimiento, rehabilitación y reconstrucción.Incluye bibliografía