Tiempo de ciclado y carga viral en pacientes infectados por SARS-CoV-2 en Sonora, México / Cycle threshold and viral load in SARS-CoV-2-infected patients in Sonora, Mexico

RESUMEN

Resumen Antecedentes: La infección por SARS-CoV-2 se confirma con la prueba de reacción en cadena de la polimerasa. Su positividad se determina mediante el tiempo de ciclado (Ct, cycle threshold), el cual es inversamente proporcional a la carga viral. Objetivo: Describir las características clínicas y epidemiológicas de pacientes infectados por SARS-CoV-2 de acuerdo con su carga viral estimada mediante Ct. Material y métodos: Estudio transversal que incluyó 21 110 casos confirmados, los cuales fueron estratificados conforme a su carga viral: baja (Ct > 30), media (Ct 25-30) y alta (Ct < 25). Resultado: 53 % de los casos tuvo una carga viral alta, la hospitalización fue más frecuente en sujetos con carga viral media y las defunciones fueron más prevalentes en aquellos con carga viral alta. La mediana del Ct fue más baja durante los primeros cinco días y aumentó linealmente con los días de evolución clínica. Hubo una mayor prevalencia de defunciones, hospitalizaciones y apoyo ventilatorio en sujetos con infección confirmada por SARS-CoV-2 que presentaron carga viral media y alta. Conclusiones: El valor de Ct, correlacionado con otras características del paciente, puede orientar el pronóstico, así como al diseño de intervenciones que limiten la diseminación poblacional del virus.

ABSTRACT

Abstract Background: SARS-CoV-2 infection is confirmed with the polymerase chain reaction test. Its positivity is determined by the cycle threshold (Ct), which is inversely proportional to viral load. Objective: To describe clinical and epidemiological characteristics of SARS-CoV-2-infected patients according to their viral load estimated by Ct. Material and methods: Cross-sectional study that included 21,110 confirmed cases, which were stratified according to their viral load: low (Ct > 30), medium (Ct 25-30) and high (Ct < 25). Results: High viral load was identified in 53% of the cases, hospitalization was more common in subjects with medium viral load, and deaths were more prevalent in those with high viral load. Median Ct was lower during the first five days and linearly increased with the days of clinical evolution. There was a higher prevalence of deaths, hospitalizations and ventilatory support in subjects with confirmed SARS-CoV-2 infection who had a medium and high viral load. Conclusions: The Ct value, correlated with other patient characteristics, can guide the prognosis, as well as the design of interventions that limit the spread of the virus within the population.