Characterisation of complete high- and low-risk human papillomavirus genomes isolated from cervical specimens in southern Brazil
Mem. Inst. Oswaldo Cruz
; 112(10): 728-731, Oct. 2017. tab
Artigo
em Inglês
| LILACS
| ID: biblio-894837
Biblioteca responsável:
BR1.1
ABSTRACT
The classification of human papillomavirus (HPV) intratypic lineages by complete genome sequencing is a determinant in understanding biological differences in association with this disease. In this work, we have characterised complete HPV genomes from southern Brazil. Fifteen cervicovaginal Pap smear negative samples previously categorised as HPV-positive were sequenced using ultradeep sequencing, and 18 complete genomes from 13 different HPV types were assembled. Phylogenetic and genetic distance analyses were performed to classify the HPV genomes into lineages and sublineages. This is the first report describing the distribution of HPV intratype lineages of high and low oncogenic risk in asymptomatic women from southern Brazil.
Texto completo:
Disponível
Coleções:
Bases de dados internacionais
Base de dados:
LILACS
Assunto principal:
Papillomaviridae
/
Esfregaço Vaginal
/
DNA Viral
/
Doenças do Colo do Útero
/
Genoma Viral
/
Infecções por Papillomavirus
Tipo de estudo:
Estudo de etiologia
/
Fatores de risco
Limite:
Adulto
/
Feminino
/
Humanos
País/Região como assunto:
América do Sul
/
Brasil
Idioma:
Inglês
Revista:
Mem. Inst. Oswaldo Cruz
Assunto da revista:
Medicina Tropical
/
Parasitologia
Ano de publicação:
2017
Tipo de documento:
Artigo
/
Documento de projeto
País de afiliação:
Brasil
Instituição/País de afiliação:
Universidade Federal do Rio Grande/BR