Revisão de classificação de bactérias utilizando dados genômicos

ABSTRACT

Bioinformatics is an important tool in several areas of science, and it can be used for the reclassification of organisms from the Archaea and Bacteria kingdoms. Using tools to calculate the average nucleotide identity, gene annotation and pan-genome analysis, it can be identified possible inconsistencies in the classification of bacteria. It was made a massive analysis of genomic data from two bacterial genera of medical interest Brucella and Micrococcus responsible for causing chronic diseases and nosocomial infections, respectively. The methodology used was nucleotide similarity analysis, genomic annotation, pan-genome analysis and annotation of genes of interest. In this study we propose reclassifications for both genera studied and we point out proposals for new poorly classified species and others not yet identified.

RESUMO

A bioinformática é uma importante ferramenta em diversas áreas da ciência, podendo ser usada para a reclassificação de organismos dos reinos Archaea e Bacteria. A partir do uso de ferramentas de cálculo da identidade média de nucleotídeos, anotação de genes, análise pan-genoma podem ser identificadas possíveis inconsistências na classificação de bactérias. Nesse trabalho, foi realizada uma análise massiva de dados genômicos de dois gêneros bacterianos de interesse médico, Burcella e Micrococcus, responsáveis por causar doenças crônicas e infecções hospitalares, respectivamente. A metodologia utilizada foi a de análise de similaridade nucleotídica, anotação genômica, análise de pan-genoma e anotação de genes de interesse. Neste estudo propomos reclassificações para ambos os gêneros estudados e apontamos propostas de novas espécies classificadas erroneamente e de outras ainda não identificadas.