Molecular characterization of Cryptococcus gattii genotype AFLP6/VGII isolated from woody debris of divi-divi (Caesalpinia coriaria), Bonaire, Dutch Caribbean / Caracterización molecular del genotipo AFLP6/VGII Cryptococcus gattii aislado de restos de madera de divi-divi (Caesalpinia coriaria), Bonaire, Caribe Holandés

ABSTRACT

Background. The basidiomycetous yeast Cryptococcus gattii is an emerging and primary pathogen. There is a lack of information about its environmental spread outside outbreak regions in Mediterranean Europe, North and South America. Environmental sampling for C. gattii and molecular characterization of the obtained isolates will provide an insight into the global spread of the various genotypes. Methods. Woody debris of native divi-divi (Caesalpinia coriaria) trees were sampled across Bonaire, Dutch Caribbean. Colonies suspected for Cryptococcus species were subjected to standard mycology investigations and identification by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. Isolates identified as C. gattii were subjected to amplified fragment length polymorphism genotyping, mating-type analysis and multi-locus sequence typing. Results. Ten colonies of C. gattii were cultured from different trunk hollows of the same divi-divi tree. Molecular characterization showed that all isolates were genotype AFLP6/VGII and mating-type α. Multi-locus sequence typing revealed that all isolates were genetically indistinguishable from each other. Conclusions. C. gattii is present in the environment of Bonaire, which suggests that this yeast is likely to be present in the environment of other Caribbean islands (AU)

RESUMEN

Antecedentes. La levadura Cryptococcus gattii es un basidiomiceto emergente y patógeno primario. Existe poca información acerca de su dispersión en medio ambiente fuera de las regiones con brotes descritos por esta levadura en la Europa mediterránea, Norte y Sur de América. Los muestreos del medio ambiente para la búsqueda de C. gattii y la caracterización molecular de los aislamientos obtenidos puede proveer de una visión global sobre la dispersión de varios de sus genotipos. Métodos. Se tomaron muestras de residuos de madera de árboles nativos divi-divi (Caesalpinia coriaria) en Bonaire, Caribe Holandés. Las colonias susceptibles de pertenecer a las especies de Cryptococcus se sometieron a un estudio micológico estándar e identificación por espectrometría de masas MALDI-TOF (Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time of Flight). Los aislamientos identificados como C. gattii se sometieron a genotipado mediante AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism), obtención del tipo sexual y MLST (Multi-locus Sequence Typing). Resultados. Se obtuvieron diez colonias de C. gattii en el cultivo de nuestras de diferentes agujeros de un mismo árbol divi-divi. La caracterización molecular mostró que todos los aislamientos eran genotipo AFLP6/VGII y tipo sexual α. El tipado mediante MLST reveló que todos los aislamientos eran genéticamente indistinguibles unos de otros. Conclusiones. C. gattii está presente en el medio ambiente de Bonaire, lo que sugiere que esta levadura podría estar presente en el ambiente de otras islas del Caribe (AU)