Rapid AST: Possibility of inferring resistance mechanisms with complex phenotypes / Pruebas rápidas de sensibilidad a los antimicrobianos: ¿es posible inferir mecanismos de resistencia con fenotipos complicados?

ABSTRACT

The new automated systems designed for rapid performance of AST have significantly reduced the response time for susceptibility testing of microorganisms causing bacteremia and sepsis. The Accelerate Pheno® system (AAC) is one such system. Our objective for this study was to determine whether the AAC system is capable of providing an accurate susceptibility profile to infer resistance mechanisms in different carbapenemase-producing isolates when compared to the MicroScan WalkAway System (MWS). Disk diffusion method was also performed on all isolates as a reference method. Additionally, we compared the results obtained with the routine AST production system. We selected 19 isolates from the cryobank of the Microbiology department, all of which were carbapenemase-producing gram-negative bacilli. AAC was able to identify and infer the resistance of a total of 10 isolates, with an EA and CA of 84.2% for meropenem and 88.2% and 64.7% for ertapenem EA and CA, respectively. If we consider the disk diffusion technique, the CA was 57.9% and 76.5% for meropenem and ertapenem. However, in the presence of carbapenemases, AAC was not able to provide adequate MICs or infer the resistance mechanisms of the isolates accurately. Further studies with a larger number of isolates, including the new antibiotics ceftolozane/tazobactam and ceftazidime/avibactam, are needed for a more comprehensive comparison. (AU)

RESUMEN

Los nuevos sistemas automatizados diseñados para la realización rápida de antibiogramas han reducido significativamente el tiempo de respuesta para las pruebas de susceptibilidad de los microorganismos causantes de bacteriemia y sepsis. El sistema Accelerate Pheno® (AAC) es uno de ellos. Nuestro objetivo para este estudio era determinar si el sistema AAC es capaz de proporcionar un perfil de sensibilidad preciso para inferir mecanismos de resistencia en diferentes aislados productores de carbapenemasas en comparación con el sistema MicroScan WalkAway (MWS). El método de disco difusión fue incluido también en todos los aislados como método de referencia. Además, comparamos los resultados obtenidos con el sistema rutinario de producción de antibiogramas rápidos. Seleccionamos 19 aislados del criobanco del departamento de Microbiología, todos ellos bacilos gramnegativos productores de carbapenemasas. AAC fue capaz de identificar e inferir la resistencia de un total de 10 aislados, con una EA y CA del 84,2% para el meropenem y del 88,2% y 64,7% para la EA y CA del ertapenem, respectivamente. Si consideramos la técnica de disco difusión, la CA fue de un 57.9% y de un 76.5% para meropenem y ertapenem. Sin embargo, en presencia de carbapenemasas, AAC no fue capaz de proporcionar CMIs adecuadas ni de inferir con precisión los mecanismos de resistencia de los aislados. Se necesitan más estudios con un mayor número de aislados incluyendo también los nuevos antibióticos ceftolozano/tazobactam y ceftazidima/avibactam para una comparación más exhaustiva. (AU)