Variabilidad genética de aislamientos de Phytophthora infestans procedentes del suroeste de Colombia / Genetic variability of Phytophthora infestans isolates from south-western Colombia

RESUMEN

La gota o tizón tardío causado por Phytophthora infestans es una de lasenfermedades más limitantes en diversos cultivos de solanáceas en el mundo.Este patógeno es especialmente problemático en las zonas andinas altas,donde dichos cultivos se desarrollan bajo condiciones de alta humedad ysiembra continua durante todo el año. El objetivo de este trabajo fue aumentarla información disponible sobre la biología de P. infestans, especialmente conrespecto a su variabilidad genética en el suroeste de Colombia, región dondeconfluyen cultivos de diferentes solanáceas susceptibles a este patógeno.La evaluación se realizó mediante la utilización de marcadores molecularesAFLP con las enzimas de restricción EcoRI y MseI y diferentes combinacionesde cebadores. Los resultados obtenidos indicaron un bajo nivel de variacióngenética entre los 26 aislamientos evaluados, presentándose sólo 18 bandaspolimórficas de los 135 amplicones obtenidos (13,43%), un índice dediversidad de Nei de 0,04 y un índice de Shannon de 0,06. A pesar del altogrado de similitud encontrado en la población, el dendrograma generado porel método UPGMA permitió dividir la población en dos grandes grupos.El primero de ellos presentaba aislamientos procedentes de papa (Solanumtuberosum y Solanum phureja), mientras que el segundo incluyó soloaislamientos obtenidos de tomate de árbol (Solanum betaceum). Uno de losaislamientos evaluados (C8) no se agrupó con ninguno de los anterioresgrupos, aunque compartió un alto nivel de similitud con éstos (0,86).Los resultados apoyan la hipótesis de la estructuración poblacional deP. infestans en función del hospedante; sin embargo, esta situación requiereser verificada con evaluaciones de patogenicidad cruzada(AU)

ABSTRACT

Late blight caused by Phytophthora infestans is one of the most limitingdiseases in solanaceous crops in the world. This pathogen is a mainconstraint in the highland Andes, where these plants are grown under highhumidity conditions and continuous cropping. The aim of this research was toincrease the available information on the biology of P. infestans, specifically onits level of genetic variation in south-western Colombia, an area where varioussolanaceous crops susceptible to this pathogen converge. The study wascarried out by using AFLP molecular markers with the restriction enzymesEcoRI and MseI and different primer combinations. Results indicated a lowlevel of genetic variation among the 26 isolates evaluated, with only 18polymorphic bands out of 135 amplicons obtained (13.43%), a Nei´s geneticdiversity index of 0.04, and a Shannon´s information index of 0.06. The UPGMA dendrogram allowed dividing the population in two main groups,the first of them having the isolates collected from potato (Solanum tuberosumand Solanum phureja), while the second one included isolates obtained fromtree tomato (Solanum betaceum). One of the isolates (C8) was located outsideof these groups, although it shared a high level of similarity with them (0.86).The results support the hypothesis of population structure of P. infestansbased on host; however, this situation needs to be verified with crosspathogenicity assays(AU)