Influencia de los tiempos entre el inicio de síntomas, la toma de frotis nasofaríngeo y su procesamiento en laboratorio en la detección de gripe / Effect of the time between symptom onset, swabbing and testing on the detection of influenza virus

RESUMEN

Introducción La vigilancia epidemiológica de la gripe requiere la recogida de frotis nasofaríngeos en atención primaria para su análisis en laboratorios de referencia. Evaluamos la influencia en el resultado de laboratorio, de los tiempos transcurridos desde el inicio de síntomas hasta la recogida del frotis (TSF) y desde entonces hasta su procesamiento en laboratorio (TFL).Métodos Analizamos las muestras recogidas en la red centinela de gripe de Navarra en la temporada 2009-2010. Los hisopados se conservaron refrigerados hasta su estudio mediante RT-PCR y cultivo viral. Se analizó el porcentaje de positividad a gripe en función del TSF y del TFL mediante regresión logística. Resultados Se analizaron 937 frotis y 373 (40%) fueron positivos para gripe mediante RT-PCR. El TSF osciló entre 0-15 días. En el análisis ajustado por periodo, laboratorio y edad, la detección del virus de la gripe descendió a menos de la mitad en el cultivo cuando el TSF era de 4-5 días (OR = 0,47; IC 95% 0,24-0,94), y en la RT-PCR, cuando el TSF era mayor de 5 días (OR = 0,24; IC 95% 0,09-0,65). El TFL no afectó de forma significativa al resultado de muestras procesadas por RT-PCR (OR por día transcurrido = 0,96; IC 95% 0,88-1,04), ni por cultivo viral (OR por día transcurrido = 0,97; IC 95% 0,89-1,06).Conclusiones Un TSF superior a 3 días redujo la probabilidad de confirmación de gripe, afectando más al cultivo que a la PCR. El TFL dentro de un rango de dos semanas no afectó de forma relevante al resultado de la RT-PCR ni del cultivo (AU)

ABSTRACT

Background Influenza surveillance requires the collection of nasopharyngeal swabs in Primary Care for testing in reference laboratories. We evaluated the influence on the laboratory results of the time since the onset of symptoms to swabbing (TSS) and from then until laboratory processing (TSL).Methods We analysed swabs collected in the Sentinel Network of Navarra during the 2009-2010 influenza season. The samples were kept refrigerated until analysed by RT-PCR and viral culture. We analysed the percentage of positive swabs to influenza virus in accordance with the TSS and TSL by logistic regression. Results From a total of 937 swabs, 373 (40%) were positive for influenza by RT-PCR. The TSS ranged from 0-15 days. In the adjusted analysis by period, laboratory and age, having a positive influenza culture decreased to less than half when the TSS was 4-5 days (OR=0.47; 95% CI, 0.24-0.94), and having a positive RT-PCR decreased when the TSS was 5 days or more (OR=0.24, 95% CI, 0.09-0.65). TSL does not significantly affect the result of the RT-PCR (OR by each day=0.96; 95% CI, 0.88-1.04), or the result of the viral culture (OR by each day=0.97, 95% CI, 0.89-1.06).Conclusions A TSS over 3 days reduced the likelihood of confirmation of influenza, affecting the viral culture more than the RT-PCR. A TSL within a range of two weeks had no significant effect on the results of the RT-PCR or the viral culture (AU)