Análise filogenética e padronização da técnica de eletroforese em gel com gradientes desnaturantes (DGGE) para caracterização das linhagens do vírus Influenza B identificadas durante as epidemias de 2004 a 2008 / Phylogenetic analysis and standardization of denaturing gradient gel eletrophoresis (DGGE) technique for characterization of Influenza B viruses lineages detected during the 2004-2008 epidemics

RESUMO

Globalmente, as infecções causadas pelos vírus Influenza constituem um importante desafio a Saúde Pública. Os vírus Influenza B pertencem à família Orthomyxoviridae, o genoma viral é constituído por um RNA de fita simples e polaridade negativa. O processo de drift antigênico favorece o contínuo aparecimento de novas variantes virais, o que demanda a reformulação anual da vacina. No início década de 80, foi observada a divergência do vírus Influenza B em duas linhagens antigênica e filogeneticamente distintas B/Victoria/2/87-like (Vic87) e B/yamagata/16/88-like (Yam88), que têm co-circulado em diferentes países. O objetivo deste estudo consiste na identificação e caracterização molecular das linhagens de Influenza B circulantes em diferentes regiões brasileiras durante as epidemias de 2004 a 2008, com base no sequenciamento dos genes Hemaglutinina (HA) e Neuraminidase (NA). Ainda, padronizamos o protocolo de Eletroforese em Gel com Gradientes Desnaturantes (DGGE), visando à rápida tipagem dos vírus B. Diferentes substituições nos genes da HA e NA foram encontradas, e evidenciamos a co-circulação de ambas as linhagens no período estudado. Contudo, não observamos a ocorrência de rearranjo gênico, e nem a emergência de cepas resistentes aos inibidores de neuraminidase, com base nos genes investigados. No período 2006-2008, observamos a adequada concordância entre as cepas circulantes e as cepas vacinas preconizadas para o uso no Hemisfério Sul. Entretanto, o mesmo não foi verdadeiro para o período 2004-2005. Finalmente, o protocolo de DGGE desenvolvido pode ser eficientemente utilizado para fins de rápida...