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Molecular characterisation of dengue virus type 1 reveals lineage replacement during circulation in Brazilian territory
Carneiro, Adriana Ribeiro; Cruz, Ana Cecília Ribeiro; Vallinoto, Marcelo; Melo, Diego de Vasconcelos; Ramos, Rommel Thiago J; Medeiros, Daniele Barbosa Almeida; Silva, Eliana Vieira Pinto da; Vasconcelos, Pedro Fernando da Costa.
Afiliação
  • Carneiro, Adriana Ribeiro; Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Seção de Arbovirologia e Febres Hemorrágicas. Ananindeua. BR
  • Cruz, Ana Cecília Ribeiro; Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Seção de Arbovirologia e Febres Hemorrágicas. Ananindeua. BR
  • Vallinoto, Marcelo; Laboratório de Genética e Biologia Molecular.
  • Melo, Diego de Vasconcelos; Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Seção de Arbovirologia e Febres Hemorrágicas. Ananindeua. BR
  • Ramos, Rommel Thiago J; Universidade do Estado do Pará. Laboratório de Polimorfismo de DNA. Belém. BR
  • Medeiros, Daniele Barbosa Almeida; Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Seção de Arbovirologia e Febres Hemorrágicas. Ananindeua. BR
  • Silva, Eliana Vieira Pinto da; Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Seção de Arbovirologia e Febres Hemorrágicas. Ananindeua. BR
  • Vasconcelos, Pedro Fernando da Costa; Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Seção de Arbovirologia e Febres Hemorrágicas. Ananindeua. BR
Mem. Inst. Oswaldo Cruz ; 107(6): 805-812, set. 2012. ilus, tab
Article em En | LILACS | ID: lil-649498
Biblioteca responsável: BR1.1
ABSTRACT
Dengue fever is the most important arbovirus infection found in tropical regions around the world. Dispersal of the vector and an increase in migratory flow between countries have led to large epidemics and severe clinical outcomes, such as dengue haemorrhagic fever and dengue shock syndrome. This study analysed the genetic variability of the dengue virus serotype 1 (DENV-1) in Brazil with regard to the full-length structural genes C/prM/M/E among 34 strains isolated during epidemics that occurred in the country between 1994-2011. Virus phylogeny and time of divergence were also evaluated with only the E gene of the strains isolated from 1994-2008. An analysis of amino acid differences between these strains and the French Guiana strain (FGA/89) revealed the presence of important nonsynonymous substitutions in the amino acid sequences, including residues E297 (Met→Thr) and E338 (Ser→Leu). A phylogenetic analysis of E proteins comparing the studied isolates and other strains selected from the GenBank database showed that the Brazilian DENV-1 strains since 1982 belonged to genotype V. This analysis also showed that different introductions of strains from the 1990s represented lineage replacement, with the identification of three lineages that cluster all isolates from the Americas. An analysis of the divergence time of DENV-1 indicated that the lineage circulating in Brazil emerged from an ancestral lineage that originated approximately 44.35 years ago.
Assuntos
Palavras-chave

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: LILACS Assunto principal: RNA Viral / Vírus da Dengue Limite: Humans País/Região como assunto: America do sul / Brasil Idioma: En Revista: Mem. Inst. Oswaldo Cruz Assunto da revista: MEDICINA TROPICAL / PARASITOLOGIA Ano de publicação: 2012 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: LILACS Assunto principal: RNA Viral / Vírus da Dengue Limite: Humans País/Região como assunto: America do sul / Brasil Idioma: En Revista: Mem. Inst. Oswaldo Cruz Assunto da revista: MEDICINA TROPICAL / PARASITOLOGIA Ano de publicação: 2012 Tipo de documento: Article País de afiliação: Brasil
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