Whole-genome sequences of influenza A(H3N2) viruses isolated from Brazilian patients with mild illness during the 2014 season
Mem. Inst. Oswaldo Cruz
; 110(1): 148-150, 03/02/2015. tab
Artigo
em Inglês
| LILACS
| ID: lil-741618
Biblioteca responsável:
BR1.1
ABSTRACT
The influenza A(H3N2) virus has circulated worldwide for almost five decades and is the dominant subtype in most seasonal influenza epidemics, as occurred in the 2014 season in South America. In this study we evaluate five whole genome sequences of influenza A(H3N2) viruses detected in patients with mild illness collected from January-March 2014. To sequence the genomes, a new generation sequencing (NGS) protocol was performed using the Ion Torrent PGM platform. In addition to analysing the common genes, haemagglutinin, neuraminidase and matrix, our work also comprised internal genes. This was the first report of a whole genome analysis with Brazilian influenza A(H3N2) samples. Considerable amino acid variability was encountered in all gene segments, demonstrating the importance of studying the internal genes. NGS of whole genomes in this study will facilitate deeper virus characterisation, contributing to the improvement of influenza strain surveillance in Brazil.
Texto completo:
Disponível
Coleções:
Bases de dados internacionais
Contexto em Saúde:
ODS3 - Meta 3.3 Acabar com as doenças tropicais negligenciadas e combater as doenças transmissíveis
/
ODS3 - Meta 3.4 Reduzir as mortes prematuras devido doenças não transmissíveis
Problema de saúde:
Hepatite
/
Doenças do Sistema Digestório
Base de dados:
LILACS
Assunto principal:
Índice de Gravidade de Doença
/
Prednisolona
/
Hepatite B Crônica
/
Glucocorticoides
Tipo de estudo:
Ensaio clínico controlado
Limite:
Adulto
/
Idoso
/
Feminino
/
Humanos
/
Masculino
País/Região como assunto:
América do Sul
/
Brasil
Idioma:
Inglês
Revista:
Mem. Inst. Oswaldo Cruz
Assunto da revista:
Medicina Tropical
/
Parasitologia
Ano de publicação:
2015
Tipo de documento:
Artigo
País de afiliação:
Brasil
Instituição/País de afiliação:
Instituto Oswaldo Cruz/BR