Genotypic characterization of ten microsatellite loci in two Brazilian free range (Caipira) chicken lines / Caracterização genotípica de dez loci de microssatélites em duas linhagens de galinhas caipiras brasileiras

ABSTRACT

This study aimed to investigate the genetic variability of two Brazilian free range (Caipira) chickens lines using microsatellites analysis of ten loci. It was collected a total of 99 blood samples, which 49 were from Paraíso Pedrês (PP) and 50 were from Rubro Negra (RN) lines. The amplification of the DNA fragments was performed by polymerase chain reaction (PCR) and the genotyping was conduct using ABI 3130 sequencer. The allele number variation was among 3 (LEI0254) to 32 (LEI0212) in the PP line, and 4 (LEI0254) to 31 (LEI0212) in the RN line. The allelic average per locus was 13.3 and 13.1 in the PP and RN lines, respectively. The average observed and the expected heterozygosity were 0.650 and 0.820 in the PP line, and 0.671 and 0.804 in the RN line. All of the analyzed loci were informative (PIC>0.5). These results indicate that these free-range animals have a high genetic variability, at least for the majority of the analyzed loci, and this genetic variation is higher than the commercial chickens and similar for the no-commercial birds.

RESUMO

Este trabalho teve como objetivo investigar a variabilidade genética de duas linhagens de galinhas caipiras brasileiras usando 10 locos de microssatélites. Noventa e nove amostras de sangue total foram coletadas, sendo 49 da linhagem Paraíso Pedrês (PP) e 50 da linhagem Rubro Negra (RN). As amplificações dos fragmentos do DNA foram realizadas pela técnica da reação em cadeia pela polimerase (PCR), e a genotipagem ocorreu em um sequenciador ABI 3130. O número de alelos variou de 3 (LEI0254) a 32 (LEI0212), na linhagem PP, e de 4 (LEI0254) a 31 (LEI0212), na linhagem RN. O número médio de alelos por loco foi de 13,3 e de 13,1 nas linhagens PP e RN, respectivamente. A heterozigosidade observada média e a heterozigosidade esperada média foram 0,650 e 0,820, na linhagem PP, e 0,671 e 0,804, na linhagem RN. Todos os locos analisados foram informativos (PIC>0,5). Estes resultados indicam que estes animais caipiras têm uma grande variabilidade genética, pelo menos para a maioria dos locos analisados, e que esta variação genética é maior do que a das galinhas comerciais e semelhante à de aves não comerciais.