Rotavírus a genótipos G5 e G1 associados ao genótipo P[8] circulando no Brasil de 1986 a 2013: variabilidade genética pré e pós-vacinação / Rotavirus a genotypes g5 and g1 associated to genotype p[8] circulating in brazil from 1986 to 2013: genetic variability before and after vaccination

RESUMO

Os rotavírus da espécie A (RVA) são os principais agentes etiológicos causadores de gastroenterite aguda (GA) em crianças menor ou igual a 5 anos e, anualmente, são responsáveis por aproximadamente 196.000 casos de óbito infantil em todo o mundo. Diferentes mecanismos genéticos (mutações pontuais, rearranjos genéticos, reestruturação de segmentos genômicos (reassortment) e recombinação genética) estão envolvidos na geração de variabilidade genética destes vírus. As combinações genotípicas mais encontradas mundialmente são: G1P[8], G2P[4], G3P[8], G4P[8] e G9P[8], entretanto, os países em desenvolvimento apresentam uma maior variabilidade genotípica entre as cepas circulantes. No intuito de se compreender a diversidade dos RVA, em 2011 foi proposto um novo sistema de classificação para os RVA baseado no sequenciamento nucleotídico dos onze segmentos gênicos destes vírus. No presente estudo foram realizadas análises filogenéticas dos onze genes de 28 cepas brasileiras de RVA de genótipo G5P[8] coletadas entre 1986 e 2005, 90 cepas de RVA de genótipo G1P[8] em diferentes regiões brasileiras entre 1986 e 2013, além do perfil de flutuação do genótipo P[8] no Brasil durante as últimas 3 décadas. Os resultados demonstraram que as cepas brasileiras de genótipo G5P[8] e G1P[8] possuem uma constelação gênica do genótipo Wa-like (I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1), com exceção de duas cepas G1P[8], que apresentaram o genótipo T3 (genótipo AU-1-like), comumente detectado em felinos. Foi proposta a classificação do genótipo G5 em 3 linhagens diferentes (I, II e III), de modo que a linhagem I circulou no Brasil entre 1986 e 2005 e a linhagem que está circulando atualmente entre países dos continentes Africano e Asiático pertencem à linhagem III...

ABSTRACT

Specie A rotaviruses (RVA) are the main etiological agent of acute gastroenteritis (AG) in children less than or equal to 5 years old and, annually, are responsible for about death of 196.000 childrenworldwide. Different genetic mechanisms (pontual mutation, genetic rearrangement,reassortment and genetic combination) are involved in the generation of variability of thisviruses. The most detected combinations worldwide are: G1P[8], G2P[4], G3P[8], G4P[8]and G9P[8], however developing countries have strains with a greater genotypic variability.In order to unsderstand the RVA diversity, in 2011, was proposed a new classification systemfor RVA based on the nucleotide sequencing of the 11 gene segments. In the present studywere conducted Phylogenetic analyses of the 11 gene segments from 28 brazilian RVA strainsgenotype G5P[8] collected between 1986 and 2005, 90 RVA strains genotype G1P[8]collected between 1986 and 2013 in different regions of the country, besides the analysis ofthe fluctuation profile from genotype P[8] during the last 3 decades in Brazil. The resultsshowed that brazilian RVA strains genotypes G5P[8] and G1P[8] have a genecticconstellation characteristic of the genotype Wa-like (I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1), exceptfor 2 G1P[8] strains, which showed genotype T3 (AU-1-Like), generally detected in felines.Was proposed the classification of genotype G5 in 3 different lineages (I, II and III), lineage Icirculated in Brazil between 1986 and 2005, while the lineage actually circulating in Africanand Asiatic continents is lineage III...