Cache-Oblivious parallel SIMD Viterbi decoding for sequence search in HMMER.

Ferreira, Miguel; Roma, Nuno; Russo, Luis M S

Ferreira, Miguel; Roma, Nuno; Russo, Luis M S.

Afiliação

Russo LM; Instituto Superior Técnico, Universidade de Lisboa, Av, Rovisco Pais, 1049-001 Lisboa, Portugal. lsr@kdbio.inesc-id.pt.

BMC Bioinformatics ; 15: 165, 2014 May 30.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-24884826

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Cadeias de Markov; Análise de Sequência/métodos; Algoritmos; Bases de Dados Genéticas; Bases de Dados de Proteínas; Humanos; Alinhamento de Sequência

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Cadeias de Markov / Análise de Sequência / Biologia Computacional Tipo de estudo: Health_economic_evaluation / Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2014 Tipo de documento: Article País de publicação: Reino Unido

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