Mining biomass-degrading genes through Illumina-based de novo sequencing and metagenomic analysis of free-living bacteria in the gut of the lower termite Coptotermes gestroi harvested in Vietnam.

Do, Thi Huyen; Nguyen, Thi Thao; Nguyen, Thanh Ngoc; Le, Quynh Giang; Nguyen, Cuong; Kimura, Keitarou; Truong, Nam Hai

Do, Thi Huyen; Nguyen, Thi Thao; Nguyen, Thanh Ngoc; Le, Quynh Giang; Nguyen, Cuong; Kimura, Keitarou; Truong, Nam Hai.

Afiliação

Do TH; Institute of Biotechnology, Vietnam Academy of Science and Technology, 18-Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Ha Noi, Viet Nam.
Nguyen TT; Vinh University, 182 Le Duan, Vinh, Nghe An, Vietnam.
Nguyen TN; Institute of Biotechnology, Vietnam Academy of Science and Technology, 18-Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Ha Noi, Viet Nam.
Le QG; Institute of Biotechnology, Vietnam Academy of Science and Technology, 18-Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Ha Noi, Viet Nam.
Nguyen C; Institute of Biotechnology, Vietnam Academy of Science and Technology, 18-Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Ha Noi, Viet Nam.
Kimura K; National Food Research Institute, National Agriculture and Food Research Organization (NARO), 2-1-12 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8642, Japan.
Truong NH; Institute of Biotechnology, Vietnam Academy of Science and Technology, 18-Hoang Quoc Viet, Cau Giay, Ha Noi, Viet Nam. Electronic address: tnhai@ibt.ac.vn.

J Biosci Bioeng ; 118(6): 665-71, 2014 Dec.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-24928651

Assuntos

Bactérias/enzimologia; Bactérias/genética; Trato Gastrointestinal/microbiologia; Genes Bacterianos/genética; Isópteros/microbiologia; Lignina/metabolismo; Metagenoma/genética; Animais; Bactérias/classificação; Bactérias/isolamento & purificação; Sequência de Bases; Biomassa; Hidrolases de Éster Carboxílico/genética; Hidrolases de Éster Carboxílico/metabolismo; Celulases/genética; Celulases/metabolismo; Metagenômica; Fases de Leitura Aberta/genética; Análise de Sequência de DNA; Vietnã

Palavras-chave

Cellulase; Coptotermes gestroi; Free-living gut bacterial community; Hemicellulase; Illumina de novo sequencing; Metagenome; Pectinesterase

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Bactérias / Isópteros / Trato Gastrointestinal / Metagenoma / Genes Bacterianos / Lignina Limite: Animals País/Região como assunto: Asia Idioma: En Revista: J Biosci Bioeng Assunto da revista: ENGENHARIA BIOMEDICA / MICROBIOLOGIA Ano de publicação: 2014 Tipo de documento: Article País de publicação: Japão

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