In Silico Methods for Cell Annotation, Quantification of Gene Expression, and Cell Geometry at Single-Cell Resolution Using 3DCellAtlas.

Stamm, Petra; Strauss, Soeren; Montenegro-Johnson, Thomas D; Smith, Richard; Bassel, George W

Stamm, Petra; Strauss, Soeren; Montenegro-Johnson, Thomas D; Smith, Richard; Bassel, George W.

Afiliação

Stamm P; School of Biosciences, University of Birmingham, Birmingham, B15 2TT, UK.
Strauss S; Department of Comparative Development and Genetics, Max Planck Institute for Plant Breeding Research, 50829, Cologne, Germany.
Montenegro-Johnson TD; School of Mathematics, University of Birmingham, Edgbaston, Birmingham, B15 2TT, UK.
Smith R; Department of Comparative Development and Genetics, Max Planck Institute for Plant Breeding Research, 50829, Cologne, Germany. smith@mpipz.mpg.de.
Bassel GW; School of Biosciences, University of Birmingham, Birmingham, B15 2TT, UK. g.w.bassel@bham.ac.uk.

Methods Mol Biol ; 1497: 99-123, 2017.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27864762

Assuntos

Redes Reguladoras de Genes/genética; Imageamento Tridimensional/métodos; Desenvolvimento Vegetal/fisiologia; Análise de Célula Única/métodos; Anisotropia; Simulação por Computador

Palavras-chave

3D anisotropy; 3D image analysis; 3D imaging; 3DCellAtlas; Cell type identification; Digital single-cell analysis; MorphoGraphX

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Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Imageamento Tridimensional / Redes Reguladoras de Genes / Análise de Célula Única / Desenvolvimento Vegetal Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article País de afiliação: Reino Unido País de publicação: Estados Unidos

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