A detailed cell-free transcription-translation-based assay to decipher CRISPR protospacer-adjacent motifs.

Maxwell, Colin S; Jacobsen, Thomas; Marshall, Ryan; Noireaux, Vincent; Beisel, Chase L

Maxwell, Colin S; Jacobsen, Thomas; Marshall, Ryan; Noireaux, Vincent; Beisel, Chase L.

Afiliação

Maxwell CS; Department of Chemical and Biomolecular Engineering, North Carolina State University, Raleigh, NC 27695, United States.
Jacobsen T; Department of Chemical and Biomolecular Engineering, North Carolina State University, Raleigh, NC 27695, United States.
Marshall R; School of Physics and Astronomy, University of Minnesota, Minneapolis, MN 55455, United States.
Noireaux V; School of Physics and Astronomy, University of Minnesota, Minneapolis, MN 55455, United States.
Beisel CL; Department of Chemical and Biomolecular Engineering, North Carolina State University, Raleigh, NC 27695, United States; Helmholtz Institute for RNA-based Infection Research (HIRI), Josef-Schneider-Str. 2/D15, D-97080 Würzburg, Germany. Electronic address: cbeisel@ncsu.edu.

Methods ; 143: 48-57, 2018 07 01.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29486239

Assuntos

Proteína 9 Associada à CRISPR/metabolismo; Sistemas CRISPR-Cas/genética; Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas/genética; DNA/genética; Análise de Sequência de DNA/métodos; Motivos de Aminoácidos; Biotecnologia/métodos; Proteína 9 Associada à CRISPR/genética; Biologia Computacional/métodos; Escherichia coli; Biblioteca Gênica; Proteínas de Fluorescência Verde/química; Proteínas de Fluorescência Verde/metabolismo; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/instrumentação; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Neisseria meningitidis; Plasmídeos/genética; Biossíntese de Proteínas/genética; RNA Guia de Cinetoplastídeos/genética; Análise de Sequência de DNA/instrumentação; Transcrição Gênica/genética

Palavras-chave

Cas12a; Cas9; PAM; TXTL; crRNA; sgRNA

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: DNA / Análise de Sequência de DNA / Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas / Sistemas CRISPR-Cas / Proteína 9 Associada à CRISPR Idioma: En Revista: Methods Assunto da revista: BIOQUIMICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos País de publicação: Estados Unidos

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