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SvABA: genome-wide detection of structural variants and indels by local assembly.
Wala, Jeremiah A; Bandopadhayay, Pratiti; Greenwald, Noah F; O'Rourke, Ryan; Sharpe, Ted; Stewart, Chip; Schumacher, Steve; Li, Yilong; Weischenfeldt, Joachim; Yao, Xiaotong; Nusbaum, Chad; Campbell, Peter; Getz, Gad; Meyerson, Matthew; Zhang, Cheng-Zhong; Imielinski, Marcin; Beroukhim, Rameen.
Afiliação
  • Wala JA; The Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.
  • Bandopadhayay P; Department of Cancer Biology, Dana-Farber Cancer Institute, Boston, Massachusetts 02115, USA.
  • Greenwald NF; Bioinformatics and Integrative Genomics, Harvard University, Cambridge, Massachusetts 02138, USA.
  • O'Rourke R; Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115, USA.
  • Sharpe T; The Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.
  • Stewart C; Department of Cancer Biology, Dana-Farber Cancer Institute, Boston, Massachusetts 02115, USA.
  • Schumacher S; The Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.
  • Li Y; Department of Cancer Biology, Dana-Farber Cancer Institute, Boston, Massachusetts 02115, USA.
  • Weischenfeldt J; The Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.
  • Yao X; Department of Cancer Biology, Dana-Farber Cancer Institute, Boston, Massachusetts 02115, USA.
  • Nusbaum C; The Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.
  • Campbell P; The Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.
  • Getz G; The Broad Institute of Harvard and MIT, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.
  • Meyerson M; Department of Cancer Biology, Dana-Farber Cancer Institute, Boston, Massachusetts 02115, USA.
  • Zhang CZ; Seven Bridges Genomics, Cambridge, Massachusetts 02142, USA.
  • Imielinski M; Cancer Genome Project, Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridgeshire CB10 1SA, United Kingdom.
  • Beroukhim R; The Finsen Laboratory, Rigshospitalet, University of Copenhagen, DK-2200 Copenhagen, Denmark.
Genome Res ; 28(4): 581-591, 2018 04.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29535149
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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genoma Humano / Genômica / Mutação INDEL / Variação Estrutural do Genoma Tipo de estudo: Diagnostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Genome Res Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos País de publicação: Estados Unidos
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