Automatic Cell Segmentation by Adaptive Thresholding (ACSAT) for Large-Scale Calcium Imaging Datasets.

Shen, Simon P; Tseng, Hua-An; Hansen, Kyle R; Wu, Ruofan; Gritton, Howard J; Si, Jennie; Han, Xue

Shen, Simon P; Tseng, Hua-An; Hansen, Kyle R; Wu, Ruofan; Gritton, Howard J; Si, Jennie; Han, Xue.

Afiliação

Shen SP; Department of Physics, Harvard University, Cambridge, MA 02138.
Tseng HA; Biomedical Engineering Department, Boston University, Boston, MA 02215.
Hansen KR; Biomedical Engineering Department, Boston University, Boston, MA 02215.
Wu R; School of Electrical, Computer and Energy Engineering, Arizona State University, Tempe, AZ 85287.
Gritton HJ; Biomedical Engineering Department, Boston University, Boston, MA 02215.
Si J; School of Electrical, Computer and Energy Engineering, Arizona State University, Tempe, AZ 85287.
Han X; Biomedical Engineering Department, Boston University, Boston, MA 02215.

eNeuro ; 5(5)2018.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30221189

Assuntos

Cálcio/metabolismo; Hipocampo/metabolismo; Processamento de Imagem Assistida por Computador; Neuroimagem; Neurônios/metabolismo; Algoritmos; Animais; Células Cultivadas; Feminino; Processamento de Imagem Assistida por Computador/métodos; Camundongos Endogâmicos C57BL

Palavras-chave

GCaMP6; ROI segmentation; adaptive thresholding; automated image analysis; genetically encoded calcium sensors; in vivo imaging; neural network; two-photon imaging; wide-field imaging

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Processamento de Imagem Assistida por Computador / Cálcio / Neuroimagem / Hipocampo / Neurônios Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals Idioma: En Revista: ENeuro Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article

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