Predicting age from the transcriptome of human dermal fibroblasts.

Fleischer, Jason G; Schulte, Roberta; Tsai, Hsiao H; Tyagi, Swati; Ibarra, Arkaitz; Shokhirev, Maxim N; Huang, Ling; Hetzer, Martin W; Navlakha, Saket

Fleischer, Jason G; Schulte, Roberta; Tsai, Hsiao H; Tyagi, Swati; Ibarra, Arkaitz; Shokhirev, Maxim N; Huang, Ling; Hetzer, Martin W; Navlakha, Saket.

Afiliação

Fleischer JG; Integrative Biology Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA, 92037, USA.
Schulte R; Molecular and Cell Biology Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA, 92037, USA.
Tsai HH; Molecular and Cell Biology Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA, 92037, USA.
Tyagi S; Molecular and Cell Biology Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA, 92037, USA.
Ibarra A; Molecular Stethoscope Inc., San Diego, CA, 92121, USA.
Shokhirev MN; Bioinformatics Core, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA, 92037, USA.
Huang L; Bioinformatics Core, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA, 92037, USA.
Hetzer MW; Molecular and Cell Biology Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA, 92037, USA. hetzer@salk.edu.
Navlakha S; Integrative Biology Laboratory, The Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, CA, 92037, USA. navlakha@salk.edu.

Genome Biol ; 19(1): 221, 2018 12 20.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30567591

Assuntos

Envelhecimento/metabolismo; Fibroblastos/metabolismo; Perfilação da Expressão Gênica; Transcriptoma; Adolescente; Adulto; Idoso; Idoso de 80 Anos ou mais; Criança; Pré-Escolar; Genômica/métodos; Humanos; Aprendizado de Máquina; Pessoa de Meia-Idade; Progéria/metabolismo; Adulto Jovem

Palavras-chave

Aging; Biological age; Biomarker; Ensemble classifiers; Machine learning; RNA-seq; Skin fibroblasts

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Envelhecimento / Perfilação da Expressão Gênica / Transcriptoma / Fibroblastos Tipo de estudo: Evaluation_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Adolescent / Adult / Aged / Aged80 / Child / Child, preschool / Humans / Middle aged Idioma: En Revista: Genome Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos País de publicação: Reino Unido

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