Improved annotation of the domestic pig genome through integration of Iso-Seq and RNA-seq data.

Beiki, H; Liu, H; Huang, J; Manchanda, N; Nonneman, D; Smith, T P L; Reecy, J M; Tuggle, C K

Beiki, H; Liu, H; Huang, J; Manchanda, N; Nonneman, D; Smith, T P L; Reecy, J M; Tuggle, C K.

Afiliação

Beiki H; Department of Animal Science, Iowa State University, 2255 Kildee Hall, Ames, IA, 50011, USA.
Liu H; Department of Animal Science, Iowa State University, 2255 Kildee Hall, Ames, IA, 50011, USA.
Huang J; Department of Animal Science, Iowa State University, 2255 Kildee Hall, Ames, IA, 50011, USA.
Manchanda N; College of Animal Science and Technology, Jiangxi Agricultural University, Nanchang, Jiangxi, People's Republic of China.
Nonneman D; Department of Ecology, Evolution, and Organismal Biology, Iowa State University, 819 Wallace Road, Ames, IA, 50011, USA.
Smith TPL; USDA, ARS, U.S. Meat Animal Research Center, Clay Center, NE, 68933, USA.
Reecy JM; USDA, ARS, U.S. Meat Animal Research Center, Clay Center, NE, 68933, USA.
Tuggle CK; Department of Animal Science, Iowa State University, 2255 Kildee Hall, Ames, IA, 50011, USA.

BMC Genomics ; 20(1): 344, 2019 May 07.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31064321

Assuntos

Processamento Alternativo; Imunoprecipitação da Cromatina/métodos; Biologia Computacional/métodos; Genoma; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Anotação de Sequência Molecular; Animais; Sus scrofa

Palavras-chave

Genome annotation; Iso-seq; PacBio; Porcine; RNA-seq; Single molecule long read sequencing; Transcriptome sequencing

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genoma / Processamento Alternativo / Biologia Computacional / Imunoprecipitação da Cromatina / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / Anotação de Sequência Molecular Limite: Animals Idioma: En Revista: BMC Genomics Assunto da revista: GENETICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos País de publicação: Reino Unido

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